297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1010 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1010  flavoprotein WrbA  100 
 
 		 201 aa  417  1e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000029905  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2414  flavoprotein WrbA  77.16 
 
 		 200 aa  320  8e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1455  flavoprotein WrbA  72 
 
 		 200 aa  318  3.9999999999999996e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157391  normal  0.291105 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6613  TrpR binding protein WrbA  73.6 
 
 		 200 aa  310  7.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280289 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  73.6 
 
 		 200 aa  310  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6057  TrpR binding protein WrbA  73.1 
 
 		 200 aa  310  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6351  TrpR binding protein WrbA  73.6 
 
 		 200 aa  308  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6131  TrpR binding protein WrbA  73.1 
 
 		 200 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5766  TrpR binding protein WrbA  72.59 
 
 		 200 aa  308  5e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6077  TrpR binding protein WrbA  73.1 
 
 		 200 aa  305  3e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.201338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  71.57 
 
 		 199 aa  303  9.000000000000001e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5841  TrpR binding protein WrbA  72.08 
 
 		 200 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.823521 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2002  TrpR binding protein WrbA  77.16 
 
 		 199 aa  297  8e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1505  flavoprotein WrbA  67.01 
 
 		 206 aa  289  2e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0774654  normal  0.0461136 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0460  TrpR binding protein WrbA  65.48 
 
 		 200 aa  282  3.0000000000000004e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0620  TrpR binding protein WrbA  65.48 
 
 		 200 aa  282  3.0000000000000004e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4089  flavoprotein WrbA  65.99 
 
 		 199 aa  278  5e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1148  flavoprotein WrbA  65.15 
 
 		 201 aa  274  7e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3134  TrpR binding protein WrbA  68.53 
 
 		 199 aa  274  7e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1683  flavoprotein WrbA  64.97 
 
 		 207 aa  273  1.0000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.308348  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4280  TrpR binding protein WrbA  66.5 
 
 		 199 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4647  TrpR binding protein WrbA  66.5 
 
 		 199 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3831  TrpR binding protein WrbA  65.99 
 
 		 200 aa  271  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.872601 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4564  TrpR binding protein WrbA  67.01 
 
 		 208 aa  268  4e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0396  flavoprotein WrbA  68.37 
 
 		 212 aa  268  5e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1384  TrpR binding protein WrbA  63.45 
 
 		 200 aa  266  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.106085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1813  TrpR binding protein WrbA  65.48 
 
 		 199 aa  266  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000250234  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4797  TrpR binding protein WrbA  63.96 
 
 		 199 aa  266  1e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153134  normal  0.829265 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1516  TrpR binding protein WrbA  68.02 
 
 		 198 aa  265  4e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.348571 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01007  TrpR binding protein WrbA  64.97 
 
 		 198 aa  263  2e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2638  flavoprotein WrbA  64.97 
 
 		 198 aa  263  2e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.836437  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2043  TrpR binding protein WrbA  65.99 
 
 		 199 aa  263  2e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0806093  normal  0.0679166 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2120  TrpR binding protein WrbA  64.97 
 
 		 198 aa  263  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2591  TrpR binding protein WrbA  64.97 
 
 		 198 aa  263  2e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.172537 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1214  TrpR binding protein WrbA  65.99 
 
 		 198 aa  262  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.332262 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01014  hypothetical protein  64.97 
 
 		 198 aa  263  2e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1183  TrpR binding protein WrbA  65.99 
 
 		 198 aa  262  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.165059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1117  TrpR binding protein WrbA  64.97 
 
 		 198 aa  263  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1078  TrpR binding protein WrbA  65.99 
 
 		 198 aa  262  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1194  TrpR binding protein WrbA  65.99 
 
 		 198 aa  262  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1229  TrpR binding protein WrbA  65.99 
 
 		 198 aa  262  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.570385 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2363  TrpR binding protein WrbA  65.99 
 
 		 199 aa  263  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00380027  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1122  TrpR binding protein WrbA  64.97 
 
 		 198 aa  263  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.98388  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2261  TrpR binding protein WrbA  65.99 
 
 		 199 aa  263  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.999788  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1242  TrpR binding protein WrbA  64.47 
 
 		 198 aa  262  3e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0105  TrpR binding protein WrbA  61.27 
 
 		 204 aa  262  3e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2368  TrpR binding protein WrbA  62.44 
 
 		 199 aa  261  4e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.598358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2843  TrpR binding protein WrbA  62.94 
 
 		 199 aa  260  8e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5291  TrpR binding protein WrbA  63.45 
 
 		 212 aa  260  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.759442 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4139  flavoprotein WrbA  65 
 
 		 198 aa  259  2e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000384114  unclonable  0.00000000000397831 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2222  flavoprotein WrbA  66.5 
 
 		 203 aa  258  5.0000000000000005e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1594  TrpR binding protein WrbA  63.45 
 
 		 198 aa  256  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00380  TrpR binding protein WrbA  64.43 
 
 		 198 aa  255  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0373  flavodoxin/nitric oxide synthase  62.76 
 
 		 202 aa  251  6e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.267004  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2181  TrpR binding protein WrbA  60.5 
 
 		 199 aa  247  8e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0057  flavoprotein WrbA  61.42 
 
 		 200 aa  247  9e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4332  flavoprotein WrbA  62.94 
 
 		 199 aa  247  9e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.294077 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0608  TrpR binding protein WrbA  62.44 
 
 		 198 aa  246  1e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4506  TrpR binding protein WrbA  62.44 
 
 		 199 aa  244  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.860905  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1650  TrpR binding protein WrbA  61.42 
 
 		 199 aa  244  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.207552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5226  TrpR binding protein WrbA  64.89 
 
 		 203 aa  244  4.9999999999999997e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2508  TrpR binding protein WrbA  58.79 
 
 		 203 aa  244  6.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272355  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3669  TrpR binding protein WrbA  62.44 
 
 		 199 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.196893 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4352  TrpR binding protein WrbA  60.91 
 
 		 199 aa  242  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0979  TrpR binding protein WrbA  59.9 
 
 		 199 aa  241  5e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0804  TrpR binding protein WrbA  56.78 
 
 		 203 aa  239  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3216  flavoprotein WrbA  60.41 
 
 		 199 aa  240  1e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103808 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0784  TrpR binding protein WrbA  60.91 
 
 		 199 aa  240  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3387  TrpR binding protein WrbA  56.78 
 
 		 204 aa  240  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0637331 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2810  TrpR binding protein WrbA  59.9 
 
 		 199 aa  239  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.111031 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2136  TrpR binding protein WrbA  60.91 
 
 		 199 aa  236  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1014  TrpR binding protein WrbA  59.39 
 
 		 199 aa  234  5.0000000000000005e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0771  TrpR binding protein WrbA  56.28 
 
 		 203 aa  234  8e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1049  TrpR binding protein WrbA  58.88 
 
 		 199 aa  231  4.0000000000000004e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1932  TrpR binding protein WrbA  62 
 
 		 199 aa  231  6e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.66734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0978  TrpR binding protein WrbA  57.36 
 
 		 199 aa  229  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.642178  normal  0.831105 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3178  flavoprotein WrbA  56.78 
 
 		 204 aa  228  4e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4096  TrpR binding protein WrbA  56.85 
 
 		 199 aa  228  6e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.832118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1023  flavoprotein WrbA  59.39 
 
 		 199 aa  222  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1914  TrpR binding protein WrbA  54.63 
 
 		 208 aa  221  8e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.936643 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0958  flavoprotein WrbA  54.73 
 
 		 204 aa  219  1.9999999999999999e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2234  flavoprotein WrbA  53.47 
 
 		 206 aa  219  1.9999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.710258  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1256  flavoprotein WrbA  53.23 
 
 		 204 aa  218  3.9999999999999997e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8249  flavoprotein WrbA  57.36 
 
 		 199 aa  215  5e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.907663  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1341  TrpR binding protein WrbA  52.79 
 
 		 199 aa  191  7e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.357847  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04556  tryptophan repressor binding protein  42.13 
 
 		 218 aa  170  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.816043  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3223  WrbA family protein  47.21 
 
 		 150 aa  169  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2827  flavoprotein WrbA  47.21 
 
 		 150 aa  169  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.254037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0439  tryptophan repressor binding protein  40.61 
 
 		 199 aa  159  2e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0384  flavoprotein WrbA  40.61 
 
 		 199 aa  159  3e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85539  predicted protein  44.15 
 
 		 200 aa  158  4e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.08977 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79909  predicted protein  42.21 
 
 		 277 aa  157  1e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.147925 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1979  tryptophan repressor binding protein  41.5 
 
 		 197 aa  156  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2247  flavoprotein WrbA  42.35 
 
 		 205 aa  156  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0187  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.24 
 
 		 200 aa  155  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.938759  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1206  flavoprotein WrbA  42.93 
 
 		 201 aa  154  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0715  flavoprotein WrbA  39.09 
 
 		 197 aa  154  7e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.358899 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0700  hypothetical protein  42.71 
 
 		 199 aa  154  8e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0913  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.1 
 
 		 203 aa  154  9e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04240  cytoplasm protein, putative  41.36 
 
 		 211 aa  154  1e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.538448  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>