More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5355 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5355  flavoprotein WrbA  100 
 
 		 199 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.272087  normal  0.149509 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0142  flavoprotein WrbA  60 
 
 		 209 aa  250  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3618  flavoprotein WrbA  57.95 
 
 		 205 aa  234  7e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.700273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1973  flavodoxin/nitric oxide synthase  58.46 
 
 		 205 aa  230  9e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3183  flavodoxin/nitric oxide synthase  57.95 
 
 		 205 aa  224  9e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.202353  decreased coverage  0.0000326844 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4633  hypothetical protein  52.28 
 
 		 226 aa  218  6e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1050  flavodoxin/nitric oxide synthase  53.09 
 
 		 202 aa  205  3e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0284539  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2478  flavoprotein WrbA  53.16 
 
 		 205 aa  192  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1251  flavoprotein WrbA  48.47 
 
 		 206 aa  184  6e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.135496  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0518  flavoprotein WrbA  54.92 
 
 		 204 aa  177  8e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0188609  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2335  trp repressor binding protein WrbA, putative  45.64 
 
 		 197 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.634232  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1010  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.13 
 
 		 197 aa  174  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0958  flavoprotein WrbA  47.8 
 
 		 204 aa  172  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1591  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.69 
 
 		 197 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.741736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0636  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.35 
 
 		 210 aa  171  5.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2843  TrpR binding protein WrbA  45.1 
 
 		 199 aa  168  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4647  TrpR binding protein WrbA  46.86 
 
 		 199 aa  167  7e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4280  TrpR binding protein WrbA  46.86 
 
 		 199 aa  167  7e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5419  flavoprotein WrbA  43.37 
 
 		 209 aa  167  8e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2368  TrpR binding protein WrbA  45.1 
 
 		 199 aa  167  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.598358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1256  flavoprotein WrbA  45.15 
 
 		 204 aa  165  5e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0768  flavoprotein WrbA  43.68 
 
 		 208 aa  164  6.9999999999999995e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4797  TrpR binding protein WrbA  44.93 
 
 		 199 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153134  normal  0.829265 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3216  flavoprotein WrbA  42.65 
 
 		 199 aa  161  7e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103808 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5986  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):flavodoxin/nitric oxide synthase  41.15 
 
 		 208 aa  160  9e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1384  TrpR binding protein WrbA  43.56 
 
 		 200 aa  159  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.106085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3831  TrpR binding protein WrbA  43.07 
 
 		 200 aa  157  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.872601 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2126  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.65 
 
 		 198 aa  151  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1341  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.67 
 
 		 201 aa  151  5.9999999999999996e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.519594  normal  0.441102 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1878  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.67 
 
 		 202 aa  151  5.9999999999999996e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  43.35 
 
 		 200 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0979  TrpR binding protein WrbA  39.71 
 
 		 199 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2806  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.59 
 
 		 204 aa  150  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.54892  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0896  flavoprotein WrbA  43.43 
 
 		 197 aa  149  3e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2508  TrpR binding protein WrbA  42.57 
 
 		 203 aa  149  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272355  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1014  TrpR binding protein WrbA  42.65 
 
 		 199 aa  148  5e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0057  flavoprotein WrbA  40.69 
 
 		 200 aa  148  5e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5841  TrpR binding protein WrbA  42.36 
 
 		 200 aa  148  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.823521 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6077  TrpR binding protein WrbA  42.86 
 
 		 200 aa  148  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.201338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6131  TrpR binding protein WrbA  42.86 
 
 		 200 aa  147  7e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2136  TrpR binding protein WrbA  42.57 
 
 		 199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1010  flavoprotein WrbA  42.57 
 
 		 201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000029905  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5766  TrpR binding protein WrbA  42.86 
 
 		 200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6613  TrpR binding protein WrbA  42.36 
 
 		 200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280289 
 
 
-
 
NC_004310  BR1049  TrpR binding protein WrbA  42.16 
 
 		 199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1594  TrpR binding protein WrbA  42.57 
 
 		 198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3669  TrpR binding protein WrbA  40.69 
 
 		 199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.196893 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6351  TrpR binding protein WrbA  40.98 
 
 		 200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0804  TrpR binding protein WrbA  43.14 
 
 		 203 aa  146  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1148  flavoprotein WrbA  39.51 
 
 		 201 aa  146  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0428  NADPH-dependent FMN reductase  43.43 
 
 		 197 aa  145  4.0000000000000006e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6057  TrpR binding protein WrbA  41.38 
 
 		 200 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1650  TrpR binding protein WrbA  40.2 
 
 		 199 aa  144  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.207552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4506  TrpR binding protein WrbA  40.69 
 
 		 199 aa  144  9e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.860905  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0105  TrpR binding protein WrbA  39.32 
 
 		 204 aa  143  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2810  TrpR binding protein WrbA  40.2 
 
 		 199 aa  144  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.111031 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0771  TrpR binding protein WrbA  42.16 
 
 		 203 aa  144  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4352  TrpR binding protein WrbA  39.22 
 
 		 199 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0784  TrpR binding protein WrbA  39.22 
 
 		 199 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5291  TrpR binding protein WrbA  39.11 
 
 		 212 aa  141  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.759442 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2234  flavoprotein WrbA  42.79 
 
 		 206 aa  141  7e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.710258  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0620  TrpR binding protein WrbA  38.54 
 
 		 200 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0460  TrpR binding protein WrbA  38.54 
 
 		 200 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1813  TrpR binding protein WrbA  42.65 
 
 		 199 aa  139  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000250234  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  38.54 
 
 		 199 aa  139  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2181  TrpR binding protein WrbA  39.6 
 
 		 199 aa  139  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4564  TrpR binding protein WrbA  40.2 
 
 		 208 aa  138  6e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2414  flavoprotein WrbA  39.11 
 
 		 200 aa  137  7e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0978  TrpR binding protein WrbA  38.24 
 
 		 199 aa  137  7.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.642178  normal  0.831105 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4332  flavoprotein WrbA  39.22 
 
 		 199 aa  137  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.294077 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3387  TrpR binding protein WrbA  39.8 
 
 		 204 aa  137  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0637331 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3134  TrpR binding protein WrbA  41.46 
 
 		 199 aa  136  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4096  TrpR binding protein WrbA  38.24 
 
 		 199 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.832118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1214  TrpR binding protein WrbA  40.98 
 
 		 198 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.332262 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1229  TrpR binding protein WrbA  40.98 
 
 		 198 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.570385 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1194  TrpR binding protein WrbA  40.98 
 
 		 198 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1183  TrpR binding protein WrbA  40.98 
 
 		 198 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.165059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1078  TrpR binding protein WrbA  40.98 
 
 		 198 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2002  TrpR binding protein WrbA  44.61 
 
 		 199 aa  135  4e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01007  TrpR binding protein WrbA  40.98 
 
 		 198 aa  134  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2638  flavoprotein WrbA  40.98 
 
 		 198 aa  134  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.836437  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01014  hypothetical protein  40.98 
 
 		 198 aa  134  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1117  TrpR binding protein WrbA  40.98 
 
 		 198 aa  134  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1122  TrpR binding protein WrbA  40.98 
 
 		 198 aa  134  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.98388  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2120  TrpR binding protein WrbA  40.98 
 
 		 198 aa  134  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2591  TrpR binding protein WrbA  40.98 
 
 		 198 aa  134  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.172537 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1914  TrpR binding protein WrbA  39.17 
 
 		 208 aa  134  7.000000000000001e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.936643 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1455  flavoprotein WrbA  37.93 
 
 		 200 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157391  normal  0.291105 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5226  TrpR binding protein WrbA  38.97 
 
 		 203 aa  132  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1242  TrpR binding protein WrbA  40.49 
 
 		 198 aa  131  6e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0373  flavodoxin/nitric oxide synthase  40.89 
 
 		 202 aa  130  9e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.267004  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0396  flavoprotein WrbA  40.59 
 
 		 212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1683  flavoprotein WrbA  39.6 
 
 		 207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.308348  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1023  flavoprotein WrbA  40.2 
 
 		 199 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2363  TrpR binding protein WrbA  40.98 
 
 		 199 aa  128  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00380027  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2261  TrpR binding protein WrbA  40.98 
 
 		 199 aa  128  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.999788  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2043  TrpR binding protein WrbA  40.98 
 
 		 199 aa  128  5.0000000000000004e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0806093  normal  0.0679166 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8249  flavoprotein WrbA  40.2 
 
 		 199 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.907663  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1516  TrpR binding protein WrbA  40 
 
 		 198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.348571 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4139  flavoprotein WrbA  40.1 
 
 		 198 aa  125  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000384114  unclonable  0.00000000000397831 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>