241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1010 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1010  flavodoxin/nitric oxide synthase  100 
 
 		 197 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2335  trp repressor binding protein WrbA, putative  99.49 
 
 		 197 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.634232  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1591  flavodoxin/nitric oxide synthase  87.18 
 
 		 197 aa  360  7.0000000000000005e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.741736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1878  flavodoxin/nitric oxide synthase  63.08 
 
 		 202 aa  236  2e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1251  flavoprotein WrbA  58.85 
 
 		 206 aa  231  7.000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.135496  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0518  flavoprotein WrbA  55.44 
 
 		 204 aa  202  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0188609  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1050  flavodoxin/nitric oxide synthase  47.72 
 
 		 202 aa  194  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0284539  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4633  hypothetical protein  49.49 
 
 		 226 aa  190  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0142  flavoprotein WrbA  49.74 
 
 		 209 aa  188  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1973  flavodoxin/nitric oxide synthase  48.72 
 
 		 205 aa  185  5e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2478  flavoprotein WrbA  51.31 
 
 		 205 aa  181  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0636  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.45 
 
 		 210 aa  178  4.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3183  flavodoxin/nitric oxide synthase  47.18 
 
 		 205 aa  176  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.202353  decreased coverage  0.0000326844 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5355  flavoprotein WrbA  45.13 
 
 		 199 aa  174  7e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.272087  normal  0.149509 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3618  flavoprotein WrbA  45.69 
 
 		 205 aa  172  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.700273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2126  flavodoxin/nitric oxide synthase  47.45 
 
 		 198 aa  160  9e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1341  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.27 
 
 		 201 aa  148  5e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.519594  normal  0.441102 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5986  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):flavodoxin/nitric oxide synthase  41.84 
 
 		 208 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5419  flavoprotein WrbA  41.41 
 
 		 209 aa  132  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0958  flavoprotein WrbA  38.81 
 
 		 204 aa  128  5.0000000000000004e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0768  flavoprotein WrbA  45.34 
 
 		 208 aa  127  9.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1256  flavoprotein WrbA  42.26 
 
 		 204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2806  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.36 
 
 		 204 aa  125  6e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.54892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2508  TrpR binding protein WrbA  40.45 
 
 		 203 aa  123  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272355  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3387  TrpR binding protein WrbA  38.16 
 
 		 204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0637331 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2234  flavoprotein WrbA  36.36 
 
 		 206 aa  115  5e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.710258  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4096  TrpR binding protein WrbA  37.2 
 
 		 199 aa  112  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.832118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0771  TrpR binding protein WrbA  38.86 
 
 		 203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0804  TrpR binding protein WrbA  38.76 
 
 		 203 aa  111  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0896  flavoprotein WrbA  34.36 
 
 		 197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0428  NADPH-dependent FMN reductase  35.9 
 
 		 197 aa  109  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  36.1 
 
 		 200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1384  TrpR binding protein WrbA  37.16 
 
 		 200 aa  109  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.106085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6351  TrpR binding protein WrbA  37.36 
 
 		 200 aa  108  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6077  TrpR binding protein WrbA  37.93 
 
 		 200 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.201338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5841  TrpR binding protein WrbA  37.36 
 
 		 200 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.823521 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0057  flavoprotein WrbA  35.8 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1914  TrpR binding protein WrbA  35.61 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.936643 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6131  TrpR binding protein WrbA  35.12 
 
 		 200 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1813  TrpR binding protein WrbA  38.98 
 
 		 199 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000250234  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6613  TrpR binding protein WrbA  35.12 
 
 		 200 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280289 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5766  TrpR binding protein WrbA  35.12 
 
 		 200 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  35.63 
 
 		 199 aa  105  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1010  flavoprotein WrbA  35.63 
 
 		 201 aa  105  5e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000029905  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4280  TrpR binding protein WrbA  36.84 
 
 		 199 aa  105  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4647  TrpR binding protein WrbA  36.84 
 
 		 199 aa  105  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2368  TrpR binding protein WrbA  36.26 
 
 		 199 aa  105  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.598358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2485  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.53 
 
 		 198 aa  105  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6057  TrpR binding protein WrbA  37.22 
 
 		 200 aa  105  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0105  TrpR binding protein WrbA  38.51 
 
 		 204 aa  103  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0460  TrpR binding protein WrbA  35.12 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5291  TrpR binding protein WrbA  36.72 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.759442 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0620  TrpR binding protein WrbA  35.12 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2843  TrpR binding protein WrbA  35.67 
 
 		 199 aa  102  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3831  TrpR binding protein WrbA  36.53 
 
 		 200 aa  101  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.872601 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2414  flavoprotein WrbA  36.31 
 
 		 200 aa  101  8e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2810  TrpR binding protein WrbA  38.01 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.111031 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3216  flavoprotein WrbA  35.71 
 
 		 199 aa  99.8  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103808 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4797  TrpR binding protein WrbA  35.15 
 
 		 199 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153134  normal  0.829265 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2002  TrpR binding protein WrbA  38.73 
 
 		 199 aa  100  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3178  flavoprotein WrbA  36.06 
 
 		 204 aa  99.8  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3669  TrpR binding protein WrbA  35.93 
 
 		 199 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.196893 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1594  TrpR binding protein WrbA  38.82 
 
 		 198 aa  99.8  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01007  TrpR binding protein WrbA  36.78 
 
 		 198 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2638  flavoprotein WrbA  36.78 
 
 		 198 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.836437  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2591  TrpR binding protein WrbA  36.78 
 
 		 198 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.172537 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2120  TrpR binding protein WrbA  36.78 
 
 		 198 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01014  hypothetical protein  36.78 
 
 		 198 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1117  TrpR binding protein WrbA  36.78 
 
 		 198 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1122  TrpR binding protein WrbA  36.78 
 
 		 198 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.98388  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04240  cytoplasm protein, putative  36.75 
 
 		 211 aa  99  4e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.538448  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1516  TrpR binding protein WrbA  36.78 
 
 		 198 aa  98.6  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.348571 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2181  TrpR binding protein WrbA  36.36 
 
 		 199 aa  98.6  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5226  TrpR binding protein WrbA  35.23 
 
 		 203 aa  98.6  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4089  flavoprotein WrbA  37.36 
 
 		 199 aa  98.6  6e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1505  flavoprotein WrbA  36.09 
 
 		 206 aa  97.8  8e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0774654  normal  0.0461136 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1214  TrpR binding protein WrbA  36.78 
 
 		 198 aa  97.8  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.332262 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1194  TrpR binding protein WrbA  36.78 
 
 		 198 aa  97.8  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04350  cytoplasm protein, putative  33.72 
 
 		 340 aa  97.8  9e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.4788  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1183  TrpR binding protein WrbA  36.78 
 
 		 198 aa  97.8  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.165059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1078  TrpR binding protein WrbA  36.78 
 
 		 198 aa  97.8  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1229  TrpR binding protein WrbA  36.78 
 
 		 198 aa  97.8  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.570385 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1148  flavoprotein WrbA  35.63 
 
 		 201 aa  97.4  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3134  TrpR binding protein WrbA  36.57 
 
 		 199 aa  97.4  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1242  TrpR binding protein WrbA  36.21 
 
 		 198 aa  96.3  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4139  flavoprotein WrbA  36.42 
 
 		 198 aa  96.7  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000384114  unclonable  0.00000000000397831 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0979  TrpR binding protein WrbA  34.1 
 
 		 199 aa  96.3  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1455  flavoprotein WrbA  32.45 
 
 		 200 aa  95.9  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157391  normal  0.291105 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0784  TrpR binding protein WrbA  34.64 
 
 		 199 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0408  trp repressor binding protein  32.35 
 
 		 197 aa  95.5  5e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1766  NAD(P)H:quinone oxidoreductase, type IV  32.35 
 
 		 197 aa  95.5  5e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1683  flavoprotein WrbA  34.91 
 
 		 207 aa  94.7  8e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.308348  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4564  TrpR binding protein WrbA  35.12 
 
 		 208 aa  94.4  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2363  TrpR binding protein WrbA  36.57 
 
 		 199 aa  94  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00380027  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2043  TrpR binding protein WrbA  36.57 
 
 		 199 aa  94  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0806093  normal  0.0679166 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1014  TrpR binding protein WrbA  33.97 
 
 		 199 aa  94.4  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2261  TrpR binding protein WrbA  36.57 
 
 		 199 aa  94  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.999788  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0373  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.13 
 
 		 202 aa  93.2  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.267004  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1650  TrpR binding protein WrbA  34.68 
 
 		 199 aa  93.2  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.207552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02144  Flavodoxin/nitric oxide synthase  25.89 
 
 		 200 aa  92.8  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0314978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>