292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1194 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A1183  TrpR binding protein WrbA  100 
 
 		 198 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.165059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1214  TrpR binding protein WrbA  100 
 
 		 198 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.332262 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1229  TrpR binding protein WrbA  100 
 
 		 198 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.570385 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1078  TrpR binding protein WrbA  100 
 
 		 198 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1194  TrpR binding protein WrbA  100 
 
 		 198 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01007  TrpR binding protein WrbA  94.95 
 
 		 198 aa  387  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2638  flavoprotein WrbA  94.95 
 
 		 198 aa  387  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.836437  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1117  TrpR binding protein WrbA  94.95 
 
 		 198 aa  387  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01014  hypothetical protein  94.95 
 
 		 198 aa  387  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2120  TrpR binding protein WrbA  94.95 
 
 		 198 aa  387  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1122  TrpR binding protein WrbA  94.95 
 
 		 198 aa  387  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.98388  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2591  TrpR binding protein WrbA  94.95 
 
 		 198 aa  387  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.172537 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1242  TrpR binding protein WrbA  93.94 
 
 		 198 aa  383  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1516  TrpR binding protein WrbA  90.91 
 
 		 198 aa  370  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.348571 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2261  TrpR binding protein WrbA  83.92 
 
 		 199 aa  341  2.9999999999999997e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.999788  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2363  TrpR binding protein WrbA  83.92 
 
 		 199 aa  341  2.9999999999999997e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00380027  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2043  TrpR binding protein WrbA  83.92 
 
 		 199 aa  341  2.9999999999999997e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0806093  normal  0.0679166 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1813  TrpR binding protein WrbA  84.34 
 
 		 199 aa  342  2.9999999999999997e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000250234  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3134  TrpR binding protein WrbA  77.89 
 
 		 199 aa  324  6e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6351  TrpR binding protein WrbA  70 
 
 		 200 aa  274  8e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6057  TrpR binding protein WrbA  71.21 
 
 		 200 aa  273  9e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5766  TrpR binding protein WrbA  70.71 
 
 		 200 aa  269  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6131  TrpR binding protein WrbA  70.2 
 
 		 200 aa  269  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  70.2 
 
 		 200 aa  268  4e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6613  TrpR binding protein WrbA  69.7 
 
 		 200 aa  268  5e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280289 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4089  flavoprotein WrbA  64.82 
 
 		 199 aa  267  5.9999999999999995e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6077  TrpR binding protein WrbA  69.7 
 
 		 200 aa  266  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.201338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5841  TrpR binding protein WrbA  69.7 
 
 		 200 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.823521 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  65.83 
 
 		 199 aa  265  2.9999999999999995e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1010  flavoprotein WrbA  65.99 
 
 		 201 aa  262  2e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000029905  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1455  flavoprotein WrbA  63.32 
 
 		 200 aa  260  6.999999999999999e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157391  normal  0.291105 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2414  flavoprotein WrbA  64.14 
 
 		 200 aa  260  1e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0608  TrpR binding protein WrbA  69.85 
 
 		 198 aa  259  2e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00380  TrpR binding protein WrbA  70.71 
 
 		 198 aa  258  5.0000000000000005e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2222  flavoprotein WrbA  70.05 
 
 		 203 aa  255  3e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2002  TrpR binding protein WrbA  67 
 
 		 199 aa  249  2e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0373  flavodoxin/nitric oxide synthase  59.39 
 
 		 202 aa  247  7e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.267004  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2368  TrpR binding protein WrbA  64 
 
 		 199 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.598358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3831  TrpR binding protein WrbA  63.64 
 
 		 200 aa  241  6e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.872601 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4797  TrpR binding protein WrbA  62.5 
 
 		 199 aa  239  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153134  normal  0.829265 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2843  TrpR binding protein WrbA  64.5 
 
 		 199 aa  239  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0620  TrpR binding protein WrbA  59 
 
 		 200 aa  239  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0460  TrpR binding protein WrbA  59 
 
 		 200 aa  239  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4647  TrpR binding protein WrbA  62.5 
 
 		 199 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4280  TrpR binding protein WrbA  62.5 
 
 		 199 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1148  flavoprotein WrbA  59.2 
 
 		 201 aa  235  3e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1505  flavoprotein WrbA  60.53 
 
 		 206 aa  234  6e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0774654  normal  0.0461136 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1384  TrpR binding protein WrbA  61.11 
 
 		 200 aa  231  4.0000000000000004e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.106085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2508  TrpR binding protein WrbA  59 
 
 		 203 aa  231  5e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272355  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4139  flavoprotein WrbA  61.11 
 
 		 198 aa  229  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000384114  unclonable  0.00000000000397831 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0105  TrpR binding protein WrbA  56.16 
 
 		 204 aa  227  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1683  flavoprotein WrbA  58.76 
 
 		 207 aa  226  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.308348  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0979  TrpR binding protein WrbA  60 
 
 		 199 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2136  TrpR binding protein WrbA  59.3 
 
 		 199 aa  223  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4352  TrpR binding protein WrbA  60 
 
 		 199 aa  222  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1014  TrpR binding protein WrbA  59 
 
 		 199 aa  222  3e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4506  TrpR binding protein WrbA  60.2 
 
 		 199 aa  221  4e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.860905  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0784  TrpR binding protein WrbA  59.5 
 
 		 199 aa  221  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0804  TrpR binding protein WrbA  56.93 
 
 		 203 aa  221  6e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1049  TrpR binding protein WrbA  59 
 
 		 199 aa  220  8e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2810  TrpR binding protein WrbA  62 
 
 		 199 aa  220  9e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.111031 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0771  TrpR binding protein WrbA  56.44 
 
 		 203 aa  219  3e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5226  TrpR binding protein WrbA  63.35 
 
 		 203 aa  219  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1594  TrpR binding protein WrbA  60.1 
 
 		 198 aa  218  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3669  TrpR binding protein WrbA  59 
 
 		 199 aa  217  7.999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.196893 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0057  flavoprotein WrbA  61 
 
 		 200 aa  216  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3387  TrpR binding protein WrbA  56.5 
 
 		 204 aa  216  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0637331 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4564  TrpR binding protein WrbA  57.5 
 
 		 208 aa  215  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3216  flavoprotein WrbA  61.39 
 
 		 199 aa  214  9e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103808 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4332  flavoprotein WrbA  60 
 
 		 199 aa  213  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.294077 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0396  flavoprotein WrbA  59.9 
 
 		 212 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0978  TrpR binding protein WrbA  58.5 
 
 		 199 aa  212  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.642178  normal  0.831105 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5291  TrpR binding protein WrbA  56 
 
 		 212 aa  210  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.759442 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1650  TrpR binding protein WrbA  57 
 
 		 199 aa  210  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.207552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1256  flavoprotein WrbA  53.43 
 
 		 204 aa  206  1e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4096  TrpR binding protein WrbA  56 
 
 		 199 aa  205  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.832118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2181  TrpR binding protein WrbA  56.28 
 
 		 199 aa  204  6e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0958  flavoprotein WrbA  53.92 
 
 		 204 aa  204  6e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2234  flavoprotein WrbA  52.5 
 
 		 206 aa  203  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.710258  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3178  flavoprotein WrbA  54.73 
 
 		 204 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1914  TrpR binding protein WrbA  50.96 
 
 		 208 aa  199  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.936643 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1023  flavoprotein WrbA  59.9 
 
 		 199 aa  196  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79909  predicted protein  49.5 
 
 		 277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.147925 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8249  flavoprotein WrbA  53.5 
 
 		 199 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.907663  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1932  TrpR binding protein WrbA  52 
 
 		 199 aa  178  4.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.66734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1341  TrpR binding protein WrbA  53.54 
 
 		 199 aa  175  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.357847  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85539  predicted protein  47.62 
 
 		 200 aa  168  6e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.08977 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00297  NADH-quinone oxidoreductase Pst2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02820)  44.74 
 
 		 204 aa  166  2.9999999999999998e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0359141  normal  0.396271 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31495  predicted protein  44.92 
 
 		 201 aa  166  2.9999999999999998e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0157173  normal  0.0627326 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04350  cytoplasm protein, putative  48.15 
 
 		 340 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.4788  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44845  predicted protein  43.85 
 
 		 202 aa  158  4e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.357205  normal  0.0582237 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04240  cytoplasm protein, putative  43.52 
 
 		 211 aa  157  1e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.538448  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5986  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):flavodoxin/nitric oxide synthase  43.9 
 
 		 208 aa  156  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15393  predicted protein  42.35 
 
 		 197 aa  153  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0428  NADPH-dependent FMN reductase  43.22 
 
 		 197 aa  143  1e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5419  flavoprotein WrbA  42.36 
 
 		 209 aa  143  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0896  flavoprotein WrbA  42.93 
 
 		 197 aa  142  4e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1050  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.86 
 
 		 202 aa  142  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0284539  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0705  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.93 
 
 		 220 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.1474  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0768  flavoprotein WrbA  41.62 
 
 		 208 aa  139  3.9999999999999997e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>