298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0428 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0428  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 		 197 aa  408  1e-113  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0896  flavoprotein WrbA  72.08 
 
 		 197 aa  310  7.999999999999999e-84  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1979  tryptophan repressor binding protein  43.37 
 
 		 197 aa  156  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3387  TrpR binding protein WrbA  43.5 
 
 		 204 aa  154  7e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0637331 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0771  TrpR binding protein WrbA  46.34 
 
 		 203 aa  153  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2990  flavodoxin/nitric oxide synthase  42 
 
 		 198 aa  153  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.991698  hitchhiker  0.0079617 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0408  trp repressor binding protein  41.21 
 
 		 197 aa  152  5e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1766  NAD(P)H:quinone oxidoreductase, type IV  41.21 
 
 		 197 aa  152  5e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4229  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.5 
 
 		 198 aa  149  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.234243  normal  0.499938 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0804  TrpR binding protein WrbA  44.88 
 
 		 203 aa  147  7e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2508  TrpR binding protein WrbA  42 
 
 		 203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272355  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0913  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.12 
 
 		 203 aa  146  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3703  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.51 
 
 		 201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3216  flavoprotein WrbA  42.93 
 
 		 199 aa  145  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103808 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  42.93 
 
 		 200 aa  145  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6077  TrpR binding protein WrbA  42.93 
 
 		 200 aa  145  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.201338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2181  TrpR binding protein WrbA  40.89 
 
 		 199 aa  145  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5355  flavoprotein WrbA  43.43 
 
 		 199 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.272087  normal  0.149509 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2368  TrpR binding protein WrbA  43.65 
 
 		 199 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.598358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5841  TrpR binding protein WrbA  42.42 
 
 		 200 aa  145  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.823521 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2414  flavoprotein WrbA  40.91 
 
 		 200 aa  145  5e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2843  TrpR binding protein WrbA  43.15 
 
 		 199 aa  144  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0620  TrpR binding protein WrbA  39.9 
 
 		 200 aa  144  7.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0460  TrpR binding protein WrbA  39.9 
 
 		 200 aa  144  7.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6351  TrpR binding protein WrbA  42.93 
 
 		 200 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1823  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.33 
 
 		 199 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0558  flavoprotein WrbA  40.1 
 
 		 205 aa  144  8.000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.731292  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2521  Trp repressor-binding protein  41.54 
 
 		 205 aa  143  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02144  Flavodoxin/nitric oxide synthase  40.1 
 
 		 200 aa  144  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0314978  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1078  TrpR binding protein WrbA  43.22 
 
 		 198 aa  143  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1194  TrpR binding protein WrbA  43.22 
 
 		 198 aa  143  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1183  TrpR binding protein WrbA  43.22 
 
 		 198 aa  143  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.165059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1214  TrpR binding protein WrbA  43.22 
 
 		 198 aa  143  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.332262 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0899  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  40.49 
 
 		 199 aa  143  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000786086 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1130  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.05 
 
 		 209 aa  143  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0057993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1229  TrpR binding protein WrbA  43.22 
 
 		 198 aa  143  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.570385 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2363  TrpR binding protein WrbA  43.22 
 
 		 199 aa  143  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00380027  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2043  TrpR binding protein WrbA  43.22 
 
 		 199 aa  143  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0806093  normal  0.0679166 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2261  TrpR binding protein WrbA  43.22 
 
 		 199 aa  143  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.999788  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2340  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.92 
 
 		 200 aa  143  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200739 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51990  Trp repressor binding protein WrbA  40.5 
 
 		 198 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164992 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1246  flavoprotein WrbA  40.5 
 
 		 201 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000168945 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4797  TrpR binding protein WrbA  41.12 
 
 		 199 aa  143  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153134  normal  0.829265 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1249  NADPH-dependent FMN reductase:flavodoxin/nitric oxide synthase  41.54 
 
 		 200 aa  142  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.905  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5766  TrpR binding protein WrbA  42.42 
 
 		 200 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4280  TrpR binding protein WrbA  40.61 
 
 		 199 aa  142  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1516  TrpR binding protein WrbA  42.21 
 
 		 198 aa  142  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.348571 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4647  TrpR binding protein WrbA  40.61 
 
 		 199 aa  142  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6131  TrpR binding protein WrbA  41.92 
 
 		 200 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1686  trp repressor binding protein  38.24 
 
 		 201 aa  141  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5291  TrpR binding protein WrbA  45 
 
 		 212 aa  141  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.759442 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3831  TrpR binding protein WrbA  41.12 
 
 		 200 aa  141  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.872601 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6613  TrpR binding protein WrbA  41.92 
 
 		 200 aa  141  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280289 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4560  Trp repressor binding protein WrbA  40.5 
 
 		 198 aa  141  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.309608  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6057  TrpR binding protein WrbA  41.41 
 
 		 200 aa  141  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1206  flavoprotein WrbA  40 
 
 		 201 aa  141  6e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1644  trp repressor binding protein  40 
 
 		 201 aa  141  7e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.330548 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2247  flavoprotein WrbA  39.29 
 
 		 205 aa  141  7e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4073  flavodoxin/nitric oxide synthase  40 
 
 		 201 aa  141  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  40.91 
 
 		 199 aa  141  7e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01007  TrpR binding protein WrbA  42.21 
 
 		 198 aa  141  8e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2638  flavoprotein WrbA  42.21 
 
 		 198 aa  141  8e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.836437  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1117  TrpR binding protein WrbA  42.21 
 
 		 198 aa  141  8e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2591  TrpR binding protein WrbA  42.21 
 
 		 198 aa  141  8e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.172537 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2120  TrpR binding protein WrbA  42.21 
 
 		 198 aa  141  8e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1122  TrpR binding protein WrbA  42.21 
 
 		 198 aa  141  8e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.98388  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01014  hypothetical protein  42.21 
 
 		 198 aa  141  8e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1455  flavoprotein WrbA  38.89 
 
 		 200 aa  140  9e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157391  normal  0.291105 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2485  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.2 
 
 		 198 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1050  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.9 
 
 		 202 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0284539  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0705  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.59 
 
 		 220 aa  139  3e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.1474  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0784  TrpR binding protein WrbA  41.92 
 
 		 199 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1242  TrpR binding protein WrbA  41.71 
 
 		 198 aa  138  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1665  flavoprotein WrbA  41.03 
 
 		 197 aa  138  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204501  hitchhiker  0.00540913 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0187  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.07 
 
 		 200 aa  138  6e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.938759  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0973  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.05 
 
 		 206 aa  138  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0780306  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1433  flavoprotein WrbA  41.05 
 
 		 206 aa  138  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1455  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.05 
 
 		 206 aa  138  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1384  TrpR binding protein WrbA  43.14 
 
 		 200 aa  137  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.106085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1995  flavoprotein WrbA  41.03 
 
 		 197 aa  137  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4506  TrpR binding protein WrbA  42.93 
 
 		 199 aa  137  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.860905  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1813  TrpR binding protein WrbA  41.5 
 
 		 199 aa  137  7.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000250234  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0979  TrpR binding protein WrbA  42.21 
 
 		 199 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36830  WrbA-like flavodoxin  38.86 
 
 		 200 aa  137  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.740574  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4352  TrpR binding protein WrbA  43.72 
 
 		 199 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1897  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.89 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1336  flavodoxin/nitric oxide synthase  40.53 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.481655  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3669  TrpR binding protein WrbA  41.41 
 
 		 199 aa  137  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.196893 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5986  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):flavodoxin/nitric oxide synthase  40.49 
 
 		 208 aa  136  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1353  putative Trp repressor binding protein  40.31 
 
 		 200 aa  136  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.873787  normal  0.272914 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5419  flavoprotein WrbA  38.24 
 
 		 209 aa  136  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4096  TrpR binding protein WrbA  43.22 
 
 		 199 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.832118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1650  TrpR binding protein WrbA  42.93 
 
 		 199 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.207552  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1558  TRP repressor binding protein  39.5 
 
 		 201 aa  135  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.769228 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0105  TrpR binding protein WrbA  39 
 
 		 204 aa  135  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1010  flavoprotein WrbA  40.61 
 
 		 201 aa  135  4e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000029905  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4600  flavodoxin/nitric oxide synthase  40.64 
 
 		 206 aa  135  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.573755  normal  0.923474 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0057  flavoprotein WrbA  40.7 
 
 		 200 aa  135  5e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1376  flavoprotein WrbA  40.64 
 
 		 206 aa  135  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.79766 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3134  TrpR binding protein WrbA  42.71 
 
 		 199 aa  134  6.0000000000000005e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>