286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1644 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1644  trp repressor binding protein  100 
 
 		 201 aa  401  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.330548 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4073  flavodoxin/nitric oxide synthase  100 
 
 		 201 aa  401  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1246  flavoprotein WrbA  98.01 
 
 		 201 aa  394  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000168945 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1206  flavoprotein WrbA  98.01 
 
 		 201 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4229  flavodoxin/nitric oxide synthase  86.22 
 
 		 198 aa  346  1e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.234243  normal  0.499938 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2990  flavodoxin/nitric oxide synthase  83.76 
 
 		 198 aa  342  2e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.991698  hitchhiker  0.0079617 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3703  flavodoxin/nitric oxide synthase  83 
 
 		 201 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4560  Trp repressor binding protein WrbA  84.18 
 
 		 198 aa  338  4e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.309608  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1686  trp repressor binding protein  82.5 
 
 		 201 aa  335  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51990  Trp repressor binding protein WrbA  83.16 
 
 		 198 aa  335  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164992 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36830  WrbA-like flavodoxin  83.08 
 
 		 200 aa  318  3.9999999999999996e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.740574  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0700  hypothetical protein  64.32 
 
 		 199 aa  276  2e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0682  hypothetical protein  64.32 
 
 		 199 aa  275  4e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0187  flavodoxin/nitric oxide synthase  68.18 
 
 		 200 aa  274  6e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.938759  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2247  flavoprotein WrbA  68.75 
 
 		 205 aa  270  9e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1897  flavodoxin/nitric oxide synthase  67.35 
 
 		 209 aa  266  2e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0408  trp repressor binding protein  64.29 
 
 		 197 aa  265  4e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1766  NAD(P)H:quinone oxidoreductase, type IV  64.29 
 
 		 197 aa  265  4e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0899  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  63.45 
 
 		 199 aa  258  3e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000786086 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1130  flavodoxin/nitric oxide synthase  67.19 
 
 		 209 aa  255  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0057993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0913  flavodoxin/nitric oxide synthase  64.8 
 
 		 203 aa  254  8e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1249  NADPH-dependent FMN reductase:flavodoxin/nitric oxide synthase  66.33 
 
 		 200 aa  252  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.905  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1823  flavodoxin/nitric oxide synthase  64.77 
 
 		 199 aa  248  4e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1861  flavodoxin  67.51 
 
 		 687 aa  248  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697937  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0755  flavodoxin  67.51 
 
 		 202 aa  246  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383175  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0941  flavodoxin  67.51 
 
 		 202 aa  246  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1684  NADPH-dependent FMN reductase  67.51 
 
 		 202 aa  247  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.866798  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1706  NADPH-dependent FMN reductase  67.51 
 
 		 202 aa  246  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1474  flavodoxin  67.51 
 
 		 202 aa  246  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0407  flavodoxin  67.51 
 
 		 202 aa  246  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0705  flavodoxin/nitric oxide synthase  65.59 
 
 		 220 aa  246  2e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.1474  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1665  flavoprotein WrbA  64.95 
 
 		 197 aa  245  3e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204501  hitchhiker  0.00540913 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2619  flavodoxin  67.01 
 
 		 202 aa  244  6e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1336  flavodoxin/nitric oxide synthase  66.84 
 
 		 206 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.481655  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1433  flavoprotein WrbA  67.91 
 
 		 206 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0973  flavodoxin/nitric oxide synthase  67.91 
 
 		 206 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0780306  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2774  flavoprotein WrbA  65.8 
 
 		 200 aa  242  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1860  flavoprotein WrbA  68.48 
 
 		 203 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000177757 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1455  flavodoxin/nitric oxide synthase  67.91 
 
 		 206 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0867  flavoprotein WrbA  60.31 
 
 		 202 aa  242  3e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0748564  normal  0.44974 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1353  putative Trp repressor binding protein  65.28 
 
 		 200 aa  242  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.873787  normal  0.272914 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1995  flavoprotein WrbA  64.43 
 
 		 197 aa  242  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4600  flavodoxin/nitric oxide synthase  67.93 
 
 		 206 aa  240  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.573755  normal  0.923474 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1376  flavoprotein WrbA  66.85 
 
 		 206 aa  240  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.79766 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0980  flavodoxin/nitric oxide synthase  61.34 
 
 		 202 aa  240  1e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2485  flavodoxin/nitric oxide synthase  59.18 
 
 		 198 aa  238  5e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2779  flavoprotein WrbA  62.76 
 
 		 199 aa  237  8e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1558  TRP repressor binding protein  62.37 
 
 		 201 aa  234  9e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.769228 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2521  Trp repressor-binding protein  64.47 
 
 		 205 aa  232  2.0000000000000002e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0520  flavodoxin/nitric oxide synthase  70.41 
 
 		 184 aa  232  2.0000000000000002e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0558  flavoprotein WrbA  60.71 
 
 		 205 aa  231  6e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.731292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1576  flavoprotein WrbA  66.32 
 
 		 202 aa  230  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0631  flavodoxin/nitric oxide synthase  58.55 
 
 		 212 aa  230  1e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1979  tryptophan repressor binding protein  62.89 
 
 		 197 aa  227  8e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0439  tryptophan repressor binding protein  59.18 
 
 		 199 aa  226  1e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0384  flavoprotein WrbA  59.18 
 
 		 199 aa  226  2e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0715  flavoprotein WrbA  58.33 
 
 		 197 aa  225  3e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.358899 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04556  tryptophan repressor binding protein  59.38 
 
 		 218 aa  224  5.0000000000000005e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.816043  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2340  flavodoxin/nitric oxide synthase  52.79 
 
 		 200 aa  221  4.9999999999999996e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200739 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0549  putative Trp repressor binding protein  58.5 
 
 		 205 aa  219  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3069  flavodoxin-like protein  59.38 
 
 		 198 aa  219  3e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.432129  hitchhiker  0.00072414 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0537  flavodoxin/nitric oxide synthase  57.5 
 
 		 205 aa  216  2e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00888496 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0737  flavoprotein WrbA  56.63 
 
 		 197 aa  214  7e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.438501  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1746  Trp repressor-binding protein  55.44 
 
 		 186 aa  204  7e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02144  Flavodoxin/nitric oxide synthase  52.79 
 
 		 200 aa  203  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0314978  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03195  hypothetical protein  53.06 
 
 		 190 aa  198  3.9999999999999996e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002786  Trp repressor-binding protein  51.79 
 
 		 189 aa  192  4e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  43.84 
 
 		 200 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  45.36 
 
 		 199 aa  159  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6613  TrpR binding protein WrbA  42.36 
 
 		 200 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280289 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6131  TrpR binding protein WrbA  42.36 
 
 		 200 aa  154  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5766  TrpR binding protein WrbA  42.36 
 
 		 200 aa  154  9e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6077  TrpR binding protein WrbA  43.59 
 
 		 200 aa  154  9e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.201338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6057  TrpR binding protein WrbA  43.59 
 
 		 200 aa  153  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5841  TrpR binding protein WrbA  43.08 
 
 		 200 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.823521 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1010  flavoprotein WrbA  42.42 
 
 		 201 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000029905  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1505  flavoprotein WrbA  43.88 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0774654  normal  0.0461136 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1148  flavoprotein WrbA  44.33 
 
 		 201 aa  149  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1455  flavoprotein WrbA  42.93 
 
 		 200 aa  149  3e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157391  normal  0.291105 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0896  flavoprotein WrbA  40.49 
 
 		 197 aa  148  6e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1683  flavoprotein WrbA  43.81 
 
 		 207 aa  147  7e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.308348  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0804  TrpR binding protein WrbA  41 
 
 		 203 aa  145  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2414  flavoprotein WrbA  43.08 
 
 		 200 aa  146  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3831  TrpR binding protein WrbA  44.33 
 
 		 200 aa  145  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.872601 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2368  TrpR binding protein WrbA  42.78 
 
 		 199 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.598358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6351  TrpR binding protein WrbA  41.29 
 
 		 200 aa  144  9e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0373  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.07 
 
 		 202 aa  144  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.267004  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2181  TrpR binding protein WrbA  41.09 
 
 		 199 aa  142  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3387  TrpR binding protein WrbA  40.49 
 
 		 204 aa  142  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0637331 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4647  TrpR binding protein WrbA  41.79 
 
 		 199 aa  141  6e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4280  TrpR binding protein WrbA  41.79 
 
 		 199 aa  141  6e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0105  TrpR binding protein WrbA  40.78 
 
 		 204 aa  141  7e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0428  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 		 197 aa  141  8e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1384  TrpR binding protein WrbA  40.72 
 
 		 200 aa  141  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.106085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0460  TrpR binding protein WrbA  42.56 
 
 		 200 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4797  TrpR binding protein WrbA  42.27 
 
 		 199 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153134  normal  0.829265 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0620  TrpR binding protein WrbA  42.56 
 
 		 200 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0771  TrpR binding protein WrbA  40 
 
 		 203 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0979  TrpR binding protein WrbA  41.5 
 
 		 199 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2508  TrpR binding protein WrbA  38.73 
 
 		 203 aa  138  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>