285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0737 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0737  flavoprotein WrbA  100 
 
 
197 aa  404  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.438501  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2247  flavoprotein WrbA  62.56 
 
 
205 aa  256  1e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1766  NAD(P)H:quinone oxidoreductase, type IV  57.36 
 
 
197 aa  231  3e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0408  trp repressor binding protein  57.36 
 
 
197 aa  231  3e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0439  tryptophan repressor binding protein  59.8 
 
 
199 aa  231  4.0000000000000004e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0384  flavoprotein WrbA  59.8 
 
 
199 aa  231  6e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1684  NADPH-dependent FMN reductase  58.91 
 
 
202 aa  230  9e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.866798  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1706  NADPH-dependent FMN reductase  58.91 
 
 
202 aa  230  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0941  flavodoxin  58.91 
 
 
202 aa  230  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0407  flavodoxin  58.91 
 
 
202 aa  230  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1474  flavodoxin  58.91 
 
 
202 aa  230  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0755  flavodoxin  58.91 
 
 
202 aa  230  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383175  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2619  flavodoxin  58.42 
 
 
202 aa  229  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1861  flavodoxin  59.5 
 
 
687 aa  228  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697937  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1823  flavodoxin/nitric oxide synthase  58.46 
 
 
199 aa  226  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2774  flavoprotein WrbA  58.67 
 
 
200 aa  226  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1433  flavoprotein WrbA  60.53 
 
 
206 aa  226  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0973  flavodoxin/nitric oxide synthase  60.53 
 
 
206 aa  226  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0780306  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1455  flavodoxin/nitric oxide synthase  60.53 
 
 
206 aa  226  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1249  NADPH-dependent FMN reductase:flavodoxin/nitric oxide synthase  56.5 
 
 
200 aa  225  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.905  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1336  flavodoxin/nitric oxide synthase  59.47 
 
 
206 aa  225  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.481655  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0715  flavoprotein WrbA  59.49 
 
 
197 aa  225  3e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.358899 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1860  flavoprotein WrbA  60.96 
 
 
203 aa  224  4e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000177757 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1353  putative Trp repressor binding protein  58.67 
 
 
200 aa  224  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.873787  normal  0.272914 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1376  flavoprotein WrbA  59.89 
 
 
206 aa  223  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.79766 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1995  flavoprotein WrbA  56.85 
 
 
197 aa  223  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0187  flavodoxin/nitric oxide synthase  54.77 
 
 
200 aa  223  1e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.938759  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4600  flavodoxin/nitric oxide synthase  60.96 
 
 
206 aa  223  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.573755  normal  0.923474 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0705  flavodoxin/nitric oxide synthase  56.41 
 
 
220 aa  223  1e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.1474  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1665  flavoprotein WrbA  56.35 
 
 
197 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204501  hitchhiker  0.00540913 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04556  tryptophan repressor binding protein  58.38 
 
 
218 aa  223  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.816043  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1130  flavodoxin/nitric oxide synthase  57.95 
 
 
209 aa  223  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0057993  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1558  TRP repressor binding protein  56.35 
 
 
201 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.769228 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1206  flavoprotein WrbA  57.14 
 
 
201 aa  217  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1686  trp repressor binding protein  56.35 
 
 
201 aa  216  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3703  flavodoxin/nitric oxide synthase  56.35 
 
 
201 aa  215  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1246  flavoprotein WrbA  56.12 
 
 
201 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000168945 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1644  trp repressor binding protein  56.63 
 
 
201 aa  214  7e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.330548 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4073  flavodoxin/nitric oxide synthase  56.63 
 
 
201 aa  214  7e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0980  flavodoxin/nitric oxide synthase  53.54 
 
 
202 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0913  flavodoxin/nitric oxide synthase  55.21 
 
 
203 aa  212  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51990  Trp repressor binding protein WrbA  56.25 
 
 
198 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164992 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4560  Trp repressor binding protein WrbA  56.77 
 
 
198 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.309608  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0899  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  56.25 
 
 
199 aa  212  3.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000786086 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4229  flavodoxin/nitric oxide synthase  56.77 
 
 
198 aa  211  7e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.234243  normal  0.499938 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2990  flavodoxin/nitric oxide synthase  55.73 
 
 
198 aa  209  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.991698  hitchhiker  0.0079617 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2521  Trp repressor-binding protein  56.77 
 
 
205 aa  208  4e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1576  flavoprotein WrbA  59.09 
 
 
202 aa  207  7e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0700  hypothetical protein  53.12 
 
 
199 aa  206  3e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0867  flavoprotein WrbA  52.53 
 
 
202 aa  205  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0748564  normal  0.44974 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0682  hypothetical protein  53.12 
 
 
199 aa  204  7e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02144  Flavodoxin/nitric oxide synthase  50.76 
 
 
200 aa  202  4e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0314978  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0558  flavoprotein WrbA  52.28 
 
 
205 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.731292  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1979  tryptophan repressor binding protein  51.23 
 
 
197 aa  198  3.9999999999999996e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36830  WrbA-like flavodoxin  56 
 
 
200 aa  198  3.9999999999999996e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.740574  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2485  flavodoxin/nitric oxide synthase  53.09 
 
 
198 aa  197  7e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1746  Trp repressor-binding protein  53.37 
 
 
186 aa  197  7.999999999999999e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2779  flavoprotein WrbA  51.26 
 
 
199 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2340  flavodoxin/nitric oxide synthase  47.94 
 
 
200 aa  195  4.0000000000000005e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0200739 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0631  flavodoxin/nitric oxide synthase  49.74 
 
 
212 aa  191  4e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3069  flavodoxin-like protein  52.82 
 
 
198 aa  190  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.432129  hitchhiker  0.00072414 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002786  Trp repressor-binding protein  51.32 
 
 
189 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0520  flavodoxin/nitric oxide synthase  56.8 
 
 
184 aa  189  2.9999999999999997e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03195  hypothetical protein  49.74 
 
 
190 aa  187  7e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1897  flavodoxin/nitric oxide synthase  49.48 
 
 
209 aa  184  7e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0549  putative Trp repressor binding protein  53.54 
 
 
205 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0537  flavodoxin/nitric oxide synthase  53.12 
 
 
205 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00888496 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  43.15 
 
 
199 aa  154  8e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2414  flavoprotein WrbA  41 
 
 
200 aa  149  4e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1010  flavoprotein WrbA  40.3 
 
 
201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000029905  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1455  flavoprotein WrbA  40.3 
 
 
200 aa  143  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157391  normal  0.291105 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6057  TrpR binding protein WrbA  41.38 
 
 
200 aa  144  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186902  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2181  TrpR binding protein WrbA  42.5 
 
 
199 aa  143  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  41.29 
 
 
200 aa  143  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1505  flavoprotein WrbA  40.1 
 
 
206 aa  141  8e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0774654  normal  0.0461136 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0896  flavoprotein WrbA  40.1 
 
 
197 aa  140  9.999999999999999e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1683  flavoprotein WrbA  40.1 
 
 
207 aa  140  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.308348  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6613  TrpR binding protein WrbA  40.3 
 
 
200 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.280289 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6131  TrpR binding protein WrbA  40.3 
 
 
200 aa  138  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5766  TrpR binding protein WrbA  40.3 
 
 
200 aa  138  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5841  TrpR binding protein WrbA  40.3 
 
 
200 aa  136  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.823521 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1148  flavoprotein WrbA  40.2 
 
 
201 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6077  TrpR binding protein WrbA  40.3 
 
 
200 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.201338  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3387  TrpR binding protein WrbA  37.69 
 
 
204 aa  135  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0637331 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0958  flavoprotein WrbA  36.95 
 
 
204 aa  134  7.000000000000001e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0804  TrpR binding protein WrbA  38 
 
 
203 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4564  TrpR binding protein WrbA  39.61 
 
 
208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6351  TrpR binding protein WrbA  39.49 
 
 
200 aa  132  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0373  flavodoxin/nitric oxide synthase  40.1 
 
 
202 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.267004  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0428  NADPH-dependent FMN reductase  36.79 
 
 
197 aa  131  6e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1256  flavoprotein WrbA  37.44 
 
 
204 aa  131  6.999999999999999e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1516  TrpR binding protein WrbA  40.59 
 
 
198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.348571 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1214  TrpR binding protein WrbA  40.59 
 
 
198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.332262 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1078  TrpR binding protein WrbA  40.59 
 
 
198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1229  TrpR binding protein WrbA  40.59 
 
 
198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.570385 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1194  TrpR binding protein WrbA  40.59 
 
 
198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1183  TrpR binding protein WrbA  40.59 
 
 
198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.165059  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5291  TrpR binding protein WrbA  40.39 
 
 
212 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.759442 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0771  TrpR binding protein WrbA  36.5 
 
 
203 aa  128  6e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2508  TrpR binding protein WrbA  36 
 
 
203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>