281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2874 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2874  flavodoxin/nitric oxide synthase  100 
 
 		 191 aa  384  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00256934  hitchhiker  0.000000000000114365 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0295  flavodoxin/nitric oxide synthase  80.85 
 
 		 190 aa  320  7e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000113497 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3113  flavodoxin domain-containing protein  78.84 
 
 		 237 aa  319  9.999999999999999e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0234  flavodoxin/nitric oxide synthase  79.26 
 
 		 190 aa  315  3e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0022  flavodoxin domain-containing protein  77.78 
 
 		 264 aa  314  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0278  flavoprotein  85.56 
 
 		 190 aa  314  4e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000962932 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0242  flavodoxin/nitric oxide synthase  79.26 
 
 		 190 aa  313  9e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  hitchhiker  0.00000000952931 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2589  flavodoxin domain-containing protein  77.78 
 
 		 191 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3792  tryptophan repressor binding protein  77.78 
 
 		 191 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0417483  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3854  tryptophan repressor binding protein  77.78 
 
 		 191 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1966  flavodoxin domain-containing protein  77.78 
 
 		 191 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.952042  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3520  flavodoxin domain-containing protein  77.78 
 
 		 191 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3679  flavodoxin/nitric oxide synthase  83.51 
 
 		 190 aa  312  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0287676  hitchhiker  0.00000000000590116 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3127  flavodoxin domain-containing protein  77.25 
 
 		 191 aa  311  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3529  multimeric flavodoxin WrbA  77.25 
 
 		 191 aa  311  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2791  flavodoxin/nitric oxide synthase  75.53 
 
 		 190 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0315  flavodoxin/nitric oxide synthase  75.53 
 
 		 190 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3414  flavodoxin/nitric oxide synthase  72.49 
 
 		 190 aa  296  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851071  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2207  putative TRP repressor binding protein  65.61 
 
 		 190 aa  265  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.503271 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2405  putative TRP repressor binding protein-like protein  65.61 
 
 		 190 aa  262  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.570978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2011  flavodoxin/nitric oxide synthase  65.61 
 
 		 190 aa  261  4e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.61613  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2888  tryptophan repressor-binding protein  61.96 
 
 		 184 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.386778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2573  putative flavodoxin  61.05 
 
 		 184 aa  228  4e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.620204  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3121  putative flavodoxin  60.87 
 
 		 183 aa  224  8e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.197452  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03044  tryptophan repressor binding protein  60.64 
 
 		 191 aa  218  3e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1522  putative flavodoxin  55.56 
 
 		 184 aa  217  7.999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2449  tryptophan repressor binding protein  56.38 
 
 		 218 aa  216  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1180  flavodoxin/nitric oxide synthase  56.68 
 
 		 183 aa  209  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4981  flavodoxin/nitric oxide synthase  56.68 
 
 		 185 aa  209  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3028  flavodoxin/nitric oxide synthase  56.08 
 
 		 184 aa  206  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305562  normal  0.30268 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5160  flavodoxin/nitric oxide synthase  55.91 
 
 		 190 aa  204  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294272  normal  0.65126 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2899  putative flavodoxin  52.91 
 
 		 184 aa  202  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4044  flavodoxin/nitric oxide synthase  55.79 
 
 		 204 aa  202  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0392595 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3582  flavodoxin/nitric oxide synthase  55.61 
 
 		 184 aa  200  8e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105689  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0041  flavodoxin/nitric oxide synthase  54.5 
 
 		 184 aa  198  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6542  flavodoxin/nitric oxide synthase  55.26 
 
 		 196 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381266 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2929  putative flavodoxin  55.38 
 
 		 193 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0554  flavodoxin/nitric oxide synthase  56.99 
 
 		 184 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.519186 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2551  flavodoxin/nitric oxide synthase  56.68 
 
 		 184 aa  195  4.0000000000000005e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5693  flavodoxin/nitric oxide synthase  54.74 
 
 		 196 aa  194  7e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6057  flavodoxin/nitric oxide synthase  54.74 
 
 		 196 aa  194  7e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.244111  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2456  flavodoxin/nitric oxide synthase  53.44 
 
 		 184 aa  192  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0456  flavodoxin/nitric oxide synthase  57.61 
 
 		 211 aa  191  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3424  flavodoxin/nitric oxide synthase  55.08 
 
 		 184 aa  191  5e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4521  hypothetical protein  53.16 
 
 		 196 aa  191  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0923053  normal  0.429536 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4063  hypothetical protein  52.63 
 
 		 196 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0979244  normal  0.350489 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3284  NADPH-dependent FMN reductase  51.56 
 
 		 192 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.951999 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1090  NADPH-dependent FMN reductase  48.4 
 
 		 213 aa  177  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.665175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1832  NADPH-dependent FMN reductase  47.37 
 
 		 188 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.238885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0416  flavodoxin/nitric oxide synthase  48.4 
 
 		 189 aa  171  6.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.43833  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1959  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.79 
 
 		 189 aa  169  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0476  tryptophan repressor binding protein  47.87 
 
 		 189 aa  169  2e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22540  putative flavodoxin  48.62 
 
 		 184 aa  168  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000135401  hitchhiker  0.0000186487 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1709  NADPH-dependent FMN reductase  50 
 
 		 189 aa  165  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0120762  normal  0.0625376 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0633  putative TRP repressor binding protein  48.92 
 
 		 190 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4867  flavodoxin/nitric oxide synthase  46.43 
 
 		 206 aa  159  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392234  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4769  flavodoxin/nitric oxide synthase  46 
 
 		 201 aa  158  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.217595 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1254  TRP repressor binding protein  42.63 
 
 		 200 aa  150  8.999999999999999e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.128964  normal  0.538833 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4944  hypothetical protein  44.97 
 
 		 203 aa  149  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0236073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1570  NADPH-dependent FMN reductase  42.62 
 
 		 213 aa  148  4e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.101574  hitchhiker  0.00239279 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1129  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.94 
 
 		 205 aa  144  7.0000000000000006e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.92249 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2749  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.57 
 
 		 184 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0487  multimeric flavodoxin  47.92 
 
 		 159 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1421  NADPH-dependent FMN reductase  41.12 
 
 		 187 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.9217  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2684  tryptophan repressor binding protein  37.95 
 
 		 195 aa  122  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.501722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2904  NADPH-dependent FMN reductase  38.71 
 
 		 186 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001005  multimeric flavodoxin WrbA  39.3 
 
 		 194 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1213  tryptophan repressor binding protein  41.49 
 
 		 205 aa  120  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0487623 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07059  oxidoreductase  45.26 
 
 		 135 aa  115  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3518  multimeric flavodoxin WrbA  37.44 
 
 		 189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1044  tryptophan repressor binding protein  38.25 
 
 		 178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2368  TrpR binding protein WrbA  30.92 
 
 		 199 aa  88.2  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.598358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1384  TrpR binding protein WrbA  31.71 
 
 		 200 aa  85.1  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.106085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0105  TrpR binding protein WrbA  32.06 
 
 		 204 aa  84.7  8e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2508  TrpR binding protein WrbA  32.55 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272355  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4647  TrpR binding protein WrbA  29.35 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4280  TrpR binding protein WrbA  29.35 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.52 
 
 		 160 aa  82  0.000000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4797  TrpR binding protein WrbA  29.35 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153134  normal  0.829265 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2181  TrpR binding protein WrbA  31.37 
 
 		 199 aa  80.9  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2843  TrpR binding protein WrbA  28.99 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3831  TrpR binding protein WrbA  29.35 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.872601 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1455  flavoprotein WrbA  27.8 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157391  normal  0.291105 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3216  flavoprotein WrbA  30.05 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103808 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1333  hypothetical protein  44.76 
 
 		 162 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0541  hypothetical protein  44.76 
 
 		 162 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0614  hypothetical protein  44.76 
 
 		 162 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0804749  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0804  TrpR binding protein WrbA  32.55 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5291  TrpR binding protein WrbA  29.13 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.759442 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1010  flavoprotein WrbA  28.16 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000029905  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1050  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.35 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0284539  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4564  TrpR binding protein WrbA  29.13 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1256  flavoprotein WrbA  29.81 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2414  flavoprotein WrbA  27.72 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5355  flavoprotein WrbA  30.29 
 
 		 199 aa  74.7  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.272087  normal  0.149509 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0057  flavoprotein WrbA  31 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  28.71 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2810  TrpR binding protein WrbA  30.35 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.111031 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1505  flavoprotein WrbA  31.25 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0774654  normal  0.0461136 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1973  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.87 
 
 		 205 aa  72  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425402  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>