285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3028 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3028  flavodoxin/nitric oxide synthase  100 
 
 
184 aa  372  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305562  normal  0.30268 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1180  flavodoxin/nitric oxide synthase  75.82 
 
 
183 aa  290  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3582  flavodoxin/nitric oxide synthase  73.08 
 
 
184 aa  275  3e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105689  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3424  flavodoxin/nitric oxide synthase  76.37 
 
 
184 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0041  flavodoxin/nitric oxide synthase  71.58 
 
 
184 aa  272  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2456  flavodoxin/nitric oxide synthase  69.57 
 
 
184 aa  266  1e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2888  tryptophan repressor-binding protein  69.23 
 
 
184 aa  265  2e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.386778  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3121  putative flavodoxin  69.44 
 
 
183 aa  265  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.197452  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2551  flavodoxin/nitric oxide synthase  69.57 
 
 
184 aa  263  1e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0554  flavodoxin/nitric oxide synthase  72.83 
 
 
184 aa  259  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.519186 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4981  flavodoxin/nitric oxide synthase  68.68 
 
 
185 aa  254  6e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2899  putative flavodoxin  66.67 
 
 
184 aa  254  6e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1522  putative flavodoxin  61.41 
 
 
184 aa  249  1e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2573  putative flavodoxin  66.48 
 
 
184 aa  249  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.620204  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5160  flavodoxin/nitric oxide synthase  66.85 
 
 
190 aa  246  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294272  normal  0.65126 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22540  putative flavodoxin  67.76 
 
 
184 aa  245  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000135401  hitchhiker  0.0000186487 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2929  putative flavodoxin  68.33 
 
 
193 aa  244  6e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6542  flavodoxin/nitric oxide synthase  67.96 
 
 
196 aa  241  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.381266 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5693  flavodoxin/nitric oxide synthase  67.4 
 
 
196 aa  239  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6057  flavodoxin/nitric oxide synthase  67.4 
 
 
196 aa  239  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.244111  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4044  flavodoxin/nitric oxide synthase  66.12 
 
 
204 aa  239  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0392595 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4063  hypothetical protein  64.09 
 
 
196 aa  224  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0979244  normal  0.350489 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4521  hypothetical protein  63.54 
 
 
196 aa  224  7e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0923053  normal  0.429536 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0456  flavodoxin/nitric oxide synthase  62.71 
 
 
211 aa  223  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2791  flavodoxin/nitric oxide synthase  61.2 
 
 
190 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0315  flavodoxin/nitric oxide synthase  61.2 
 
 
190 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0234  flavodoxin/nitric oxide synthase  60.66 
 
 
190 aa  216  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0242  flavodoxin/nitric oxide synthase  59.89 
 
 
190 aa  216  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  hitchhiker  0.00000000952931 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0295  flavodoxin/nitric oxide synthase  59.89 
 
 
190 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000113497 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3414  flavodoxin/nitric oxide synthase  57.92 
 
 
190 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851071  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3113  flavodoxin domain-containing protein  59.89 
 
 
237 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03044  tryptophan repressor binding protein  59.04 
 
 
191 aa  211  3.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2589  flavodoxin domain-containing protein  59.34 
 
 
191 aa  209  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3854  tryptophan repressor binding protein  59.34 
 
 
191 aa  209  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0022  flavodoxin domain-containing protein  59.34 
 
 
264 aa  209  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3520  flavodoxin domain-containing protein  59.34 
 
 
191 aa  209  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3792  tryptophan repressor binding protein  59.34 
 
 
191 aa  209  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0417483  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1966  flavodoxin domain-containing protein  59.34 
 
 
191 aa  209  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.952042  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3529  multimeric flavodoxin WrbA  58.79 
 
 
191 aa  207  7e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3127  flavodoxin domain-containing protein  58.79 
 
 
191 aa  207  7e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2874  flavodoxin/nitric oxide synthase  56.08 
 
 
191 aa  206  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00256934  hitchhiker  0.000000000000114365 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2449  tryptophan repressor binding protein  55.56 
 
 
218 aa  204  8e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2405  putative TRP repressor binding protein-like protein  57.45 
 
 
190 aa  202  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.570978  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2011  flavodoxin/nitric oxide synthase  57.45 
 
 
190 aa  202  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.61613  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2207  putative TRP repressor binding protein  57.98 
 
 
190 aa  201  5e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.503271 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0278  flavoprotein  56.15 
 
 
190 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000962932 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3679  flavodoxin/nitric oxide synthase  56.52 
 
 
190 aa  192  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0287676  hitchhiker  0.00000000000590116 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1832  NADPH-dependent FMN reductase  50.52 
 
 
188 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.238885  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1090  NADPH-dependent FMN reductase  48.15 
 
 
213 aa  158  5e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.665175  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4867  flavodoxin/nitric oxide synthase  47.37 
 
 
206 aa  152  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392234  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1959  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.21 
 
 
189 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0633  putative TRP repressor binding protein  44.09 
 
 
190 aa  147  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1709  NADPH-dependent FMN reductase  45.83 
 
 
189 aa  143  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0120762  normal  0.0625376 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0416  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.86 
 
 
189 aa  142  2e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.43833  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0476  tryptophan repressor binding protein  41.8 
 
 
189 aa  140  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4944  hypothetical protein  42.93 
 
 
203 aa  139  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0236073  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4769  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.68 
 
 
201 aa  137  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.217595 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3284  NADPH-dependent FMN reductase  43.62 
 
 
192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.951999 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2749  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.48 
 
 
184 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0487  multimeric flavodoxin  52.48 
 
 
159 aa  129  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1421  NADPH-dependent FMN reductase  41.45 
 
 
187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.9217  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1254  TRP repressor binding protein  37.71 
 
 
200 aa  121  6e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.128964  normal  0.538833 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3518  multimeric flavodoxin WrbA  39.49 
 
 
189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1129  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.71 
 
 
205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.92249 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2684  tryptophan repressor binding protein  38.1 
 
 
195 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.501722  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1570  NADPH-dependent FMN reductase  35.83 
 
 
213 aa  111  7.000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.101574  hitchhiker  0.00239279 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1044  tryptophan repressor binding protein  41.67 
 
 
178 aa  110  8.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001005  multimeric flavodoxin WrbA  34.85 
 
 
194 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07059  oxidoreductase  41.3 
 
 
135 aa  107  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2904  NADPH-dependent FMN reductase  34.39 
 
 
186 aa  106  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1213  tryptophan repressor binding protein  42.16 
 
 
205 aa  101  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0487623 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1256  flavoprotein WrbA  29.72 
 
 
204 aa  81.3  0.000000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2368  TrpR binding protein WrbA  30.99 
 
 
199 aa  81.3  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.598358  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  32.02 
 
 
199 aa  81.3  0.000000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.33 
 
 
160 aa  81.3  0.000000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4647  TrpR binding protein WrbA  30.43 
 
 
199 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4280  TrpR binding protein WrbA  30.43 
 
 
199 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0105  TrpR binding protein WrbA  29.61 
 
 
204 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  29.21 
 
 
200 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0958  flavoprotein WrbA  30.23 
 
 
204 aa  78.6  0.00000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4797  TrpR binding protein WrbA  30.43 
 
 
199 aa  77.8  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153134  normal  0.829265 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3831  TrpR binding protein WrbA  34.51 
 
 
200 aa  77.8  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.872601 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0896  flavoprotein WrbA  29.13 
 
 
197 aa  77  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0804  TrpR binding protein WrbA  32.08 
 
 
203 aa  77  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1384  TrpR binding protein WrbA  30.85 
 
 
200 aa  76.3  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.106085  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2508  TrpR binding protein WrbA  30.43 
 
 
203 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272355  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6057  TrpR binding protein WrbA  29.21 
 
 
200 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186902  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6613  TrpR binding protein WrbA  28.22 
 
 
200 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.280289 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2414  flavoprotein WrbA  28.71 
 
 
200 aa  73.9  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6131  TrpR binding protein WrbA  26.73 
 
 
200 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0620  TrpR binding protein WrbA  29.41 
 
 
200 aa  73.2  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0771  TrpR binding protein WrbA  30.99 
 
 
203 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5766  TrpR binding protein WrbA  26.73 
 
 
200 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0460  TrpR binding protein WrbA  29.41 
 
 
200 aa  73.2  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1455  flavoprotein WrbA  28.22 
 
 
200 aa  72.8  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157391  normal  0.291105 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1010  flavoprotein WrbA  26.37 
 
 
201 aa  72.4  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000029905  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5355  flavoprotein WrbA  34 
 
 
199 aa  72  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.272087  normal  0.149509 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1148  flavoprotein WrbA  28.78 
 
 
201 aa  71.2  0.000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3216  flavoprotein WrbA  31.71 
 
 
199 aa  71.2  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103808 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1973  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.25 
 
 
205 aa  71.2  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425402  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>