282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1959 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1959  flavodoxin/nitric oxide synthase  100 
 
 
189 aa  391  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1832  NADPH-dependent FMN reductase  56.45 
 
 
188 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.238885  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0476  tryptophan repressor binding protein  53.26 
 
 
189 aa  199  9.999999999999999e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0416  flavodoxin/nitric oxide synthase  53.8 
 
 
189 aa  199  3e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.43833  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4867  flavodoxin/nitric oxide synthase  52.11 
 
 
206 aa  194  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392234  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1709  NADPH-dependent FMN reductase  55.38 
 
 
189 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0120762  normal  0.0625376 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0633  putative TRP repressor binding protein  49.19 
 
 
190 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3284  NADPH-dependent FMN reductase  50.26 
 
 
192 aa  181  4.0000000000000006e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.951999 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1090  NADPH-dependent FMN reductase  48.4 
 
 
213 aa  180  9.000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.665175  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2749  flavodoxin/nitric oxide synthase  52.72 
 
 
184 aa  176  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3414  flavodoxin/nitric oxide synthase  46.84 
 
 
190 aa  174  7e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851071  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2791  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.79 
 
 
190 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2874  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.79 
 
 
191 aa  169  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00256934  hitchhiker  0.000000000000114365 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0315  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.79 
 
 
190 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3127  flavodoxin domain-containing protein  46.84 
 
 
191 aa  168  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3529  multimeric flavodoxin WrbA  46.84 
 
 
191 aa  168  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2589  flavodoxin domain-containing protein  46.84 
 
 
191 aa  168  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3792  tryptophan repressor binding protein  46.84 
 
 
191 aa  168  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0417483  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1966  flavodoxin domain-containing protein  46.84 
 
 
191 aa  168  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.952042  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3520  flavodoxin domain-containing protein  46.84 
 
 
191 aa  168  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3854  tryptophan repressor binding protein  46.84 
 
 
191 aa  168  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0022  flavodoxin domain-containing protein  47.31 
 
 
264 aa  166  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0242  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.26 
 
 
190 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  hitchhiker  0.00000000952931 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0295  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.74 
 
 
190 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000113497 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3113  flavodoxin domain-containing protein  45.7 
 
 
237 aa  165  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0234  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.74 
 
 
190 aa  165  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4769  flavodoxin/nitric oxide synthase  46.91 
 
 
201 aa  160  7e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.217595 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4944  hypothetical protein  47.37 
 
 
203 aa  157  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0236073  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0041  flavodoxin/nitric oxide synthase  46.32 
 
 
184 aa  156  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2207  putative TRP repressor binding protein  43.68 
 
 
190 aa  156  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.503271 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0278  flavoprotein  46.49 
 
 
190 aa  155  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000962932 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0487  multimeric flavodoxin  54.61 
 
 
159 aa  154  8e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2405  putative TRP repressor binding protein-like protein  42.63 
 
 
190 aa  154  9e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.570978  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3679  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.21 
 
 
190 aa  153  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0287676  hitchhiker  0.00000000000590116 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2011  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.11 
 
 
190 aa  153  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.61613  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2888  tryptophan repressor-binding protein  45.55 
 
 
184 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.386778  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3028  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.21 
 
 
184 aa  151  5.9999999999999996e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305562  normal  0.30268 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2551  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.68 
 
 
184 aa  149  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3582  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.67 
 
 
184 aa  148  6e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105689  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5160  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.95 
 
 
190 aa  147  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294272  normal  0.65126 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2899  putative flavodoxin  45.79 
 
 
184 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3121  putative flavodoxin  42.19 
 
 
183 aa  145  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.197452  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2456  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.09 
 
 
184 aa  144  6e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2573  putative flavodoxin  43.92 
 
 
184 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.620204  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4063  hypothetical protein  44.68 
 
 
196 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0979244  normal  0.350489 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2449  tryptophan repressor binding protein  42.19 
 
 
218 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4521  hypothetical protein  45.21 
 
 
196 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0923053  normal  0.429536 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1522  putative flavodoxin  40.11 
 
 
184 aa  143  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1254  TRP repressor binding protein  41.57 
 
 
200 aa  141  6e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.128964  normal  0.538833 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1213  tryptophan repressor binding protein  48.17 
 
 
205 aa  141  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0487623 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1129  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.13 
 
 
205 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.92249 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1180  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.79 
 
 
183 aa  138  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4981  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.52 
 
 
185 aa  138  4.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03044  tryptophan repressor binding protein  41.15 
 
 
191 aa  137  7e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6542  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.41 
 
 
196 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.381266 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22540  putative flavodoxin  45.45 
 
 
184 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000135401  hitchhiker  0.0000186487 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3424  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.49 
 
 
184 aa  133  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5693  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.88 
 
 
196 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6057  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.88 
 
 
196 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.244111  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0554  flavodoxin/nitric oxide synthase  40.64 
 
 
184 aa  132  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.519186 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0456  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.39 
 
 
211 aa  131  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3518  multimeric flavodoxin WrbA  39.9 
 
 
189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2904  NADPH-dependent FMN reductase  40.86 
 
 
186 aa  129  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1570  NADPH-dependent FMN reductase  38.8 
 
 
213 aa  128  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.101574  hitchhiker  0.00239279 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4044  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.16 
 
 
204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0392595 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2929  putative flavodoxin  42.86 
 
 
193 aa  121  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2684  tryptophan repressor binding protein  39.04 
 
 
195 aa  120  8e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.501722  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1421  NADPH-dependent FMN reductase  37.37 
 
 
187 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.9217  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1044  tryptophan repressor binding protein  39.36 
 
 
178 aa  110  8.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001005  multimeric flavodoxin WrbA  34.83 
 
 
194 aa  105  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0541  hypothetical protein  49.09 
 
 
162 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1333  hypothetical protein  49.09 
 
 
162 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0614  hypothetical protein  49.09 
 
 
162 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0804749  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07059  oxidoreductase  37.59 
 
 
135 aa  97.8  8e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1561  tryptophan repressor binding protein  47.71 
 
 
109 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.789174  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1538  tryptophan repressor binding protein  45.87 
 
 
109 aa  91.7  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.45 
 
 
160 aa  79.7  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  28.78 
 
 
199 aa  79  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2247  flavoprotein WrbA  32.2 
 
 
205 aa  77.8  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2508  TrpR binding protein WrbA  29.25 
 
 
203 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272355  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  25.85 
 
 
200 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2368  TrpR binding protein WrbA  30.77 
 
 
199 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.598358  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0958  flavoprotein WrbA  28.37 
 
 
204 aa  73.2  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1256  flavoprotein WrbA  29.19 
 
 
204 aa  73.6  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0071  NADPH-dependent FMN reductase  33.54 
 
 
159 aa  72.8  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109479  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1050  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.48 
 
 
202 aa  72  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0284539  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0631  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.71 
 
 
212 aa  72  0.000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0705  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.43 
 
 
220 aa  71.6  0.000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.1474  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0804  TrpR binding protein WrbA  30.33 
 
 
203 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5291  TrpR binding protein WrbA  28.3 
 
 
212 aa  70.9  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.759442 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0558  flavoprotein WrbA  28.22 
 
 
205 aa  70.5  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.731292  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6057  TrpR binding protein WrbA  25.37 
 
 
200 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186902  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6613  TrpR binding protein WrbA  24.88 
 
 
200 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.280289 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6131  TrpR binding protein WrbA  24.88 
 
 
200 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3387  TrpR binding protein WrbA  28.17 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0637331 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03195  hypothetical protein  26.29 
 
 
190 aa  69.3  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5766  TrpR binding protein WrbA  24.88 
 
 
200 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1130  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.67 
 
 
209 aa  68.9  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0057993  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2485  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.39 
 
 
198 aa  68.6  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6077  TrpR binding protein WrbA  24.88 
 
 
200 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.201338  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>