290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2456 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2456  flavodoxin/nitric oxide synthase  100 
 
 		 184 aa  374  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2551  flavodoxin/nitric oxide synthase  85.87 
 
 		 184 aa  331  4e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0041  flavodoxin/nitric oxide synthase  76.5 
 
 		 184 aa  294  4e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3582  flavodoxin/nitric oxide synthase  69.23 
 
 		 184 aa  269  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105689  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3028  flavodoxin/nitric oxide synthase  69.57 
 
 		 184 aa  266  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305562  normal  0.30268 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1180  flavodoxin/nitric oxide synthase  67.03 
 
 		 183 aa  260  8e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22540  putative flavodoxin  69.95 
 
 		 184 aa  260  8e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000135401  hitchhiker  0.0000186487 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1522  putative flavodoxin  61.41 
 
 		 184 aa  245  2e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3424  flavodoxin/nitric oxide synthase  67.03 
 
 		 184 aa  245  3e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2573  putative flavodoxin  62.09 
 
 		 184 aa  237  6.999999999999999e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.620204  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0554  flavodoxin/nitric oxide synthase  66.85 
 
 		 184 aa  231  5e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.519186 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2899  putative flavodoxin  60.11 
 
 		 184 aa  227  9e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2888  tryptophan repressor-binding protein  59.34 
 
 		 184 aa  226  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.386778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3121  putative flavodoxin  57.61 
 
 		 183 aa  223  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.197452  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4981  flavodoxin/nitric oxide synthase  57.69 
 
 		 185 aa  221  4.9999999999999996e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6542  flavodoxin/nitric oxide synthase  58.56 
 
 		 196 aa  218  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381266 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5693  flavodoxin/nitric oxide synthase  58.01 
 
 		 196 aa  216  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6057  flavodoxin/nitric oxide synthase  58.01 
 
 		 196 aa  216  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.244111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5160  flavodoxin/nitric oxide synthase  59.12 
 
 		 190 aa  214  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294272  normal  0.65126 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2929  putative flavodoxin  59.44 
 
 		 193 aa  212  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03044  tryptophan repressor binding protein  58.51 
 
 		 191 aa  212  2.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2449  tryptophan repressor binding protein  56.61 
 
 		 218 aa  206  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3414  flavodoxin/nitric oxide synthase  55.98 
 
 		 190 aa  201  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2791  flavodoxin/nitric oxide synthase  56.52 
 
 		 190 aa  200  9e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0315  flavodoxin/nitric oxide synthase  56.52 
 
 		 190 aa  200  9e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4521  hypothetical protein  54.7 
 
 		 196 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0923053  normal  0.429536 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3113  flavodoxin domain-containing protein  56.68 
 
 		 237 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0234  flavodoxin/nitric oxide synthase  55.08 
 
 		 190 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4063  hypothetical protein  54.7 
 
 		 196 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0979244  normal  0.350489 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0022  flavodoxin domain-containing protein  56.15 
 
 		 264 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4044  flavodoxin/nitric oxide synthase  56.28 
 
 		 204 aa  198  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0392595 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0242  flavodoxin/nitric oxide synthase  54.55 
 
 		 190 aa  197  7e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  hitchhiker  0.00000000952931 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0456  flavodoxin/nitric oxide synthase  55.37 
 
 		 211 aa  196  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3854  tryptophan repressor binding protein  56.15 
 
 		 191 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2589  flavodoxin domain-containing protein  56.15 
 
 		 191 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3792  tryptophan repressor binding protein  56.15 
 
 		 191 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0417483  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3520  flavodoxin domain-containing protein  56.15 
 
 		 191 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1966  flavodoxin domain-containing protein  56.15 
 
 		 191 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.952042  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3127  flavodoxin domain-containing protein  55.61 
 
 		 191 aa  195  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3529  multimeric flavodoxin WrbA  55.61 
 
 		 191 aa  195  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0295  flavodoxin/nitric oxide synthase  54.01 
 
 		 190 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000113497 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2207  putative TRP repressor binding protein  53.72 
 
 		 190 aa  192  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.503271 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2874  flavodoxin/nitric oxide synthase  53.44 
 
 		 191 aa  192  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00256934  hitchhiker  0.000000000000114365 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2405  putative TRP repressor binding protein-like protein  53.19 
 
 		 190 aa  190  8e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.570978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2011  flavodoxin/nitric oxide synthase  54.05 
 
 		 190 aa  190  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.61613  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3679  flavodoxin/nitric oxide synthase  56.15 
 
 		 190 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0287676  hitchhiker  0.00000000000590116 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0278  flavoprotein  56.68 
 
 		 190 aa  184  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000962932 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1090  NADPH-dependent FMN reductase  50 
 
 		 213 aa  175  3e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.665175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1832  NADPH-dependent FMN reductase  49.47 
 
 		 188 aa  166  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.238885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4944  hypothetical protein  49.18 
 
 		 203 aa  165  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0236073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4867  flavodoxin/nitric oxide synthase  47.12 
 
 		 206 aa  156  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392234  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4769  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.74 
 
 		 201 aa  155  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.217595 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3284  NADPH-dependent FMN reductase  44.44 
 
 		 192 aa  149  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.951999 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1709  NADPH-dependent FMN reductase  46.35 
 
 		 189 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0120762  normal  0.0625376 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1959  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.09 
 
 		 189 aa  144  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0633  putative TRP repressor binding protein  41.94 
 
 		 190 aa  140  8e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0476  tryptophan repressor binding protein  40.86 
 
 		 189 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0416  flavodoxin/nitric oxide synthase  40.86 
 
 		 189 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.43833  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0487  multimeric flavodoxin  49.65 
 
 		 159 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1129  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.55 
 
 		 205 aa  124  6e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.92249 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1254  TRP repressor binding protein  36.87 
 
 		 200 aa  122  3e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.128964  normal  0.538833 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1570  NADPH-dependent FMN reductase  35.16 
 
 		 213 aa  117  7.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.101574  hitchhiker  0.00239279 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2904  NADPH-dependent FMN reductase  37.63 
 
 		 186 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1421  NADPH-dependent FMN reductase  37.82 
 
 		 187 aa  115  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.9217  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2684  tryptophan repressor binding protein  38.62 
 
 		 195 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.501722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001005  multimeric flavodoxin WrbA  35.68 
 
 		 194 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2749  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.38 
 
 		 184 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1044  tryptophan repressor binding protein  38.92 
 
 		 178 aa  107  9.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3518  multimeric flavodoxin WrbA  35.71 
 
 		 189 aa  106  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07059  oxidoreductase  43.38 
 
 		 135 aa  105  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1213  tryptophan repressor binding protein  40 
 
 		 205 aa  100  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0487623 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0105  TrpR binding protein WrbA  31.07 
 
 		 204 aa  89.7  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1333  hypothetical protein  42.73 
 
 		 162 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0614  hypothetical protein  42.73 
 
 		 162 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0804749  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0541  hypothetical protein  42.73 
 
 		 162 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  27.94 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  31.53 
 
 		 199 aa  81.3  0.000000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6057  TrpR binding protein WrbA  28.22 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186902  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4089  flavoprotein WrbA  31.88 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6613  TrpR binding protein WrbA  27.45 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280289 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1538  tryptophan repressor binding protein  42.2 
 
 		 109 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4647  TrpR binding protein WrbA  31.31 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1384  TrpR binding protein WrbA  31.03 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.106085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4280  TrpR binding protein WrbA  31.31 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0620  TrpR binding protein WrbA  29.41 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0460  TrpR binding protein WrbA  29.41 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1561  tryptophan repressor binding protein  41.28 
 
 		 109 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.789174  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6131  TrpR binding protein WrbA  26.96 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5766  TrpR binding protein WrbA  26.96 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4797  TrpR binding protein WrbA  30.19 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153134  normal  0.829265 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1932  TrpR binding protein WrbA  31.03 
 
 		 199 aa  74.7  0.0000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.66734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1014  TrpR binding protein WrbA  31.22 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2521  Trp repressor-binding protein  29.56 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2508  TrpR binding protein WrbA  29.41 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272355  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.52 
 
 		 160 aa  73.6  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5841  TrpR binding protein WrbA  26.96 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.823521 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3831  TrpR binding protein WrbA  31.68 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.872601 
 
 
-
 
NC_004310  BR1049  TrpR binding protein WrbA  31.22 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1148  flavoprotein WrbA  29.13 
 
 		 201 aa  72  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6077  TrpR binding protein WrbA  26.47 
 
 		 200 aa  72  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.201338  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>