More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3518 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3518  multimeric flavodoxin WrbA  100 
 
 		 189 aa  382  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1421  NADPH-dependent FMN reductase  57.3 
 
 		 187 aa  236  1e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.9217  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001005  multimeric flavodoxin WrbA  46.28 
 
 		 194 aa  174  9e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07059  oxidoreductase  53.97 
 
 		 135 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1832  NADPH-dependent FMN reductase  42.49 
 
 		 188 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.238885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1709  NADPH-dependent FMN reductase  42.21 
 
 		 189 aa  136  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0120762  normal  0.0625376 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3284  NADPH-dependent FMN reductase  41.71 
 
 		 192 aa  133  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.951999 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4867  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.3 
 
 		 206 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392234  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1959  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.9 
 
 		 189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2573  putative flavodoxin  41.45 
 
 		 184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.620204  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1090  NADPH-dependent FMN reductase  39.8 
 
 		 213 aa  125  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.665175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4769  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.49 
 
 		 201 aa  123  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.217595 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0633  putative TRP repressor binding protein  38.3 
 
 		 190 aa  123  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0476  tryptophan repressor binding protein  36.6 
 
 		 189 aa  121  7e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3028  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.49 
 
 		 184 aa  119  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305562  normal  0.30268 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4944  hypothetical protein  38.22 
 
 		 203 aa  119  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0236073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2684  tryptophan repressor binding protein  44.33 
 
 		 195 aa  118  6e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.501722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2749  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.92 
 
 		 184 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0416  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.08 
 
 		 189 aa  117  7.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.43833  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0041  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.11 
 
 		 184 aa  117  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2888  tryptophan repressor-binding protein  38.46 
 
 		 184 aa  114  6e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.386778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0242  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.54 
 
 		 190 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  hitchhiker  0.00000000952931 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2874  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.44 
 
 		 191 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00256934  hitchhiker  0.000000000000114365 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0295  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.62 
 
 		 190 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000113497 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0234  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.42 
 
 		 190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3679  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.95 
 
 		 190 aa  112  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0287676  hitchhiker  0.00000000000590116 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3414  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.42 
 
 		 190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2899  putative flavodoxin  37.89 
 
 		 184 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2791  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.42 
 
 		 190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0315  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.42 
 
 		 190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3113  flavodoxin domain-containing protein  39.36 
 
 		 237 aa  111  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2449  tryptophan repressor binding protein  39.18 
 
 		 218 aa  111  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3121  putative flavodoxin  34.55 
 
 		 183 aa  110  9e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.197452  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3582  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.32 
 
 		 184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105689  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2904  NADPH-dependent FMN reductase  41.92 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1522  putative flavodoxin  35.2 
 
 		 184 aa  108  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0022  flavodoxin domain-containing protein  38.3 
 
 		 264 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3520  flavodoxin domain-containing protein  38.3 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3854  tryptophan repressor binding protein  38.3 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2589  flavodoxin domain-containing protein  38.3 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2456  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.71 
 
 		 184 aa  106  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3792  tryptophan repressor binding protein  38.3 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0417483  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1966  flavodoxin domain-containing protein  38.3 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.952042  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1570  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 		 213 aa  105  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.101574  hitchhiker  0.00239279 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0278  flavoprotein  37.89 
 
 		 190 aa  106  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000962932 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3529  multimeric flavodoxin WrbA  37.77 
 
 		 191 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2551  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.85 
 
 		 184 aa  105  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03044  tryptophan repressor binding protein  34.87 
 
 		 191 aa  105  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3127  flavodoxin domain-containing protein  37.77 
 
 		 191 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1129  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.91 
 
 		 205 aa  104  8e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.92249 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4981  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.84 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2207  putative TRP repressor binding protein  33.85 
 
 		 190 aa  102  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.503271 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1180  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.37 
 
 		 183 aa  102  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2405  putative TRP repressor binding protein-like protein  34.36 
 
 		 190 aa  101  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.570978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5160  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.68 
 
 		 190 aa  101  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294272  normal  0.65126 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2011  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.55 
 
 		 190 aa  100  9e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.61613  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1254  TRP repressor binding protein  34.43 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.128964  normal  0.538833 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1213  tryptophan repressor binding protein  40.91 
 
 		 205 aa  98.6  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0487623 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4044  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.08 
 
 		 204 aa  95.9  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0392595 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3424  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.79 
 
 		 184 aa  95.5  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1044  tryptophan repressor binding protein  33.86 
 
 		 178 aa  93.6  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6542  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.59 
 
 		 196 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381266 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0487  multimeric flavodoxin  40.58 
 
 		 159 aa  94  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1256  flavoprotein WrbA  32.34 
 
 		 204 aa  93.2  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5693  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.84 
 
 		 196 aa  92  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6057  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.84 
 
 		 196 aa  92  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.244111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0456  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.57 
 
 		 211 aa  91.7  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2929  putative flavodoxin  40.15 
 
 		 193 aa  91.7  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4521  hypothetical protein  35.04 
 
 		 196 aa  89.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0923053  normal  0.429536 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0554  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.41 
 
 		 184 aa  89.4  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.519186 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22540  putative flavodoxin  39.39 
 
 		 184 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000135401  hitchhiker  0.0000186487 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0958  flavoprotein WrbA  33.17 
 
 		 204 aa  89  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4063  hypothetical protein  35.04 
 
 		 196 aa  89  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0979244  normal  0.350489 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5355  flavoprotein WrbA  33.66 
 
 		 199 aa  85.1  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.272087  normal  0.149509 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0105  TrpR binding protein WrbA  30.81 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3387  TrpR binding protein WrbA  33.98 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0637331 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2368  TrpR binding protein WrbA  31.53 
 
 		 199 aa  81.3  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.598358  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0804  TrpR binding protein WrbA  35.57 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  29.9 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1384  TrpR binding protein WrbA  31.63 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.106085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2247  flavoprotein WrbA  31.73 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1746  Trp repressor-binding protein  30.3 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1050  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.65 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0284539  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4797  TrpR binding protein WrbA  31.31 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153134  normal  0.829265 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6057  TrpR binding protein WrbA  30.35 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2508  TrpR binding protein WrbA  31.58 
 
 		 203 aa  77.8  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272355  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2843  TrpR binding protein WrbA  31.03 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0896  flavoprotein WrbA  31.68 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4647  TrpR binding protein WrbA  30.46 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0771  TrpR binding protein WrbA  33.78 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4280  TrpR binding protein WrbA  30.46 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1078  TrpR binding protein WrbA  31.37 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1183  TrpR binding protein WrbA  31.37 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.165059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1229  TrpR binding protein WrbA  31.37 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.570385 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1194  TrpR binding protein WrbA  31.37 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1214  TrpR binding protein WrbA  31.37 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.332262 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  28.43 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6613  TrpR binding protein WrbA  28.92 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280289 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5766  TrpR binding protein WrbA  28.92 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6131  TrpR binding protein WrbA  28.92 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.629081 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>