222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0487 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0487  multimeric flavodoxin  100 
 
 		 159 aa  320  5e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4867  flavodoxin/nitric oxide synthase  65.75 
 
 		 206 aa  191  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392234  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1832  NADPH-dependent FMN reductase  62.32 
 
 		 188 aa  176  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.238885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1090  NADPH-dependent FMN reductase  62.22 
 
 		 213 aa  174  4e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.665175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4944  hypothetical protein  60.87 
 
 		 203 aa  168  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0236073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0476  tryptophan repressor binding protein  57.55 
 
 		 189 aa  163  6.9999999999999995e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3284  NADPH-dependent FMN reductase  57.04 
 
 		 192 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.951999 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0416  flavodoxin/nitric oxide synthase  57.55 
 
 		 189 aa  161  3e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.43833  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1709  NADPH-dependent FMN reductase  61.48 
 
 		 189 aa  159  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0120762  normal  0.0625376 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1959  flavodoxin/nitric oxide synthase  54.61 
 
 		 189 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2405  putative TRP repressor binding protein-like protein  50 
 
 		 190 aa  149  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.570978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2011  flavodoxin/nitric oxide synthase  50 
 
 		 190 aa  149  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.61613  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2207  putative TRP repressor binding protein  49.31 
 
 		 190 aa  147  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.503271 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0633  putative TRP repressor binding protein  53.02 
 
 		 190 aa  145  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4769  flavodoxin/nitric oxide synthase  52.11 
 
 		 201 aa  141  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.217595 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2589  flavodoxin domain-containing protein  49.3 
 
 		 191 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3520  flavodoxin domain-containing protein  49.3 
 
 		 191 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3854  tryptophan repressor binding protein  49.3 
 
 		 191 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1966  flavodoxin domain-containing protein  49.3 
 
 		 191 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.952042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3792  tryptophan repressor binding protein  49.3 
 
 		 191 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0417483  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0022  flavodoxin domain-containing protein  49.65 
 
 		 264 aa  134  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0234  flavodoxin/nitric oxide synthase  48.25 
 
 		 190 aa  134  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3113  flavodoxin domain-containing protein  49.65 
 
 		 237 aa  134  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3127  flavodoxin domain-containing protein  48.59 
 
 		 191 aa  133  9e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3529  multimeric flavodoxin WrbA  48.59 
 
 		 191 aa  133  9e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3679  flavodoxin/nitric oxide synthase  49.64 
 
 		 190 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0287676  hitchhiker  0.00000000000590116 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0242  flavodoxin/nitric oxide synthase  47.55 
 
 		 190 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  hitchhiker  0.00000000952931 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2874  flavodoxin/nitric oxide synthase  47.92 
 
 		 191 aa  132  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00256934  hitchhiker  0.000000000000114365 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0295  flavodoxin/nitric oxide synthase  47.55 
 
 		 190 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000113497 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1213  tryptophan repressor binding protein  53.52 
 
 		 205 aa  131  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0487623 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0278  flavoprotein  48.91 
 
 		 190 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000962932 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3028  flavodoxin/nitric oxide synthase  52.48 
 
 		 184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305562  normal  0.30268 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4063  hypothetical protein  48.95 
 
 		 196 aa  127  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0979244  normal  0.350489 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4521  hypothetical protein  48.25 
 
 		 196 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0923053  normal  0.429536 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2456  flavodoxin/nitric oxide synthase  49.65 
 
 		 184 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0614  hypothetical protein  57.55 
 
 		 162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0804749  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1333  hypothetical protein  57.55 
 
 		 162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0541  hypothetical protein  57.55 
 
 		 162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3414  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.07 
 
 		 190 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2551  flavodoxin/nitric oxide synthase  49.28 
 
 		 184 aa  125  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0041  flavodoxin/nitric oxide synthase  50.72 
 
 		 184 aa  125  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2791  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.45 
 
 		 190 aa  123  9e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0315  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.45 
 
 		 190 aa  123  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5160  flavodoxin/nitric oxide synthase  49.64 
 
 		 190 aa  123  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294272  normal  0.65126 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2749  flavodoxin/nitric oxide synthase  49.64 
 
 		 184 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03044  tryptophan repressor binding protein  44.29 
 
 		 191 aa  122  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2449  tryptophan repressor binding protein  47.76 
 
 		 218 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22540  putative flavodoxin  46.76 
 
 		 184 aa  121  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000135401  hitchhiker  0.0000186487 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2899  putative flavodoxin  50 
 
 		 184 aa  120  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5693  flavodoxin/nitric oxide synthase  46.48 
 
 		 196 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6057  flavodoxin/nitric oxide synthase  46.48 
 
 		 196 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.244111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6542  flavodoxin/nitric oxide synthase  46.48 
 
 		 196 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381266 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2573  putative flavodoxin  49.28 
 
 		 184 aa  118  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.620204  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1561  tryptophan repressor binding protein  56.19 
 
 		 109 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.789174  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1180  flavodoxin/nitric oxide synthase  48.48 
 
 		 183 aa  116  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0554  flavodoxin/nitric oxide synthase  47.76 
 
 		 184 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.519186 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2888  tryptophan repressor-binding protein  50 
 
 		 184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.386778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3582  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.65 
 
 		 184 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105689  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1538  tryptophan repressor binding protein  54.29 
 
 		 109 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0456  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.65 
 
 		 211 aa  113  8.999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3424  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.65 
 
 		 184 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1522  putative flavodoxin  42.55 
 
 		 184 aa  110  8.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4981  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.71 
 
 		 185 aa  110  9e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3121  putative flavodoxin  43.38 
 
 		 183 aa  108  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.197452  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2929  putative flavodoxin  45.39 
 
 		 193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1129  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.11 
 
 		 205 aa  108  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.92249 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1254  TRP repressor binding protein  42.86 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.128964  normal  0.538833 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1421  NADPH-dependent FMN reductase  45 
 
 		 187 aa  105  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.9217  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07059  oxidoreductase  43.7 
 
 		 135 aa  104  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4044  flavodoxin/nitric oxide synthase  49.65 
 
 		 204 aa  104  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0392595 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1570  NADPH-dependent FMN reductase  40.15 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.101574  hitchhiker  0.00239279 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001005  multimeric flavodoxin WrbA  43.7 
 
 		 194 aa  101  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3518  multimeric flavodoxin WrbA  40.58 
 
 		 189 aa  94  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2904  NADPH-dependent FMN reductase  38.85 
 
 		 186 aa  92  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2684  tryptophan repressor binding protein  39.29 
 
 		 195 aa  90.1  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.501722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1044  tryptophan repressor binding protein  38.13 
 
 		 178 aa  84.7  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1050  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.57 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0284539  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3387  TrpR binding protein WrbA  30.99 
 
 		 204 aa  60.5  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0637331 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2508  TrpR binding protein WrbA  34.04 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272355  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5355  flavoprotein WrbA  31.88 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.272087  normal  0.149509 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0142  flavoprotein WrbA  31.69 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2126  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.41 
 
 		 198 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5291  TrpR binding protein WrbA  28.06 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.759442 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0804  TrpR binding protein WrbA  37.5 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2843  TrpR binding protein WrbA  36.36 
 
 		 199 aa  54.3  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5419  flavoprotein WrbA  31.72 
 
 		 209 aa  53.9  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4633  hypothetical protein  31.13 
 
 		 226 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0958  flavoprotein WrbA  28.89 
 
 		 204 aa  53.5  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4564  TrpR binding protein WrbA  28.06 
 
 		 208 aa  53.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0566  multimeric flavodoxin WrbA-like protein  34.53 
 
 		 172 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0771  TrpR binding protein WrbA  37.66 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2806  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.06 
 
 		 204 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.54892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0520  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.03 
 
 		 184 aa  53.1  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  28.78 
 
 		 200 aa  52.4  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2368  TrpR binding protein WrbA  36.36 
 
 		 199 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.598358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2414  flavoprotein WrbA  27.54 
 
 		 200 aa  51.6  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1341  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.26 
 
 		 201 aa  51.6  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.519594  normal  0.441102 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  27.21 
 
 		 199 aa  51.2  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0870  NADPH-dependent FMN reductase  35.8 
 
 		 195 aa  51.2  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000162046  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5841  TrpR binding protein WrbA  35.06 
 
 		 200 aa  50.8  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.823521 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>