More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0870 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0870  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 		 195 aa  400  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000162046  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0549  NADPH-dependent FMN reductase  61.26 
 
 		 199 aa  258  4e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0489  NADPH-dependent FMN reductase  53.93 
 
 		 206 aa  228  3e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3039  NADPH-dependent FMN reductase  53.85 
 
 		 202 aa  228  5e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.301206 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2465  NADPH-dependent FMN reductase  51.85 
 
 		 202 aa  223  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0621  NADPH-dependent FMN reductase  58.2 
 
 		 201 aa  215  2.9999999999999998e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.295503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1510  NADPH-dependent FMN reductase  47.87 
 
 		 202 aa  207  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  40.72 
 
 		 193 aa  135  4e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  43.48 
 
 		 187 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0163  NADPH-dependent FMN reductase  39.79 
 
 		 195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  37.88 
 
 		 193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  38.46 
 
 		 194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  38.38 
 
 		 193 aa  125  3e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  37.88 
 
 		 193 aa  125  5e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  38.02 
 
 		 193 aa  122  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1505  NADPH-dependent FMN reductase  37.42 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0421  NADPH-dependent FMN reductase  38.04 
 
 		 197 aa  105  3e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0414  NADPH-dependent FMN reductase  37.8 
 
 		 197 aa  105  6e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0486  NADPH-dependent FMN reductase  34.15 
 
 		 197 aa  99.8  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.260904  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  33.01 
 
 		 207 aa  99  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0321  NADPH-dependent FMN reductase  36.59 
 
 		 197 aa  98.6  5e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.378386  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5355  flavoprotein WrbA  34.21 
 
 		 199 aa  92  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.272087  normal  0.149509 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2381  NADPH-dependent FMN reductase  31.01 
 
 		 195 aa  90.1  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.19679e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0316  NADPH-dependent FMN reductase  37.91 
 
 		 212 aa  89.4  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  32.63 
 
 		 223 aa  87.4  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0109  NADPH-dependent FMN reductase  29.38 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0722  NADPH-dependent FMN reductase  27.92 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.658969  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1623  hypothetical protein  31.87 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  30.77 
 
 		 192 aa  82.8  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2377  NADPH-dependent FMN reductase  28.43 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000848109  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  27.36 
 
 		 191 aa  81.6  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1241  NADPH-dependent FMN reductase  40.78 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  35.9 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1746  Trp repressor-binding protein  30.57 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1072  NADPH-dependent FMN reductase  34.31 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2535  NADPH-dependent FMN reductase  26.77 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.437841 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1441  NADPH-dependent FMN reductase  30.63 
 
 		 192 aa  77.8  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0252  iron-sulfur flavoprotein  33.33 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.488898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1385  iron-sulfur flavoprotein  27.86 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1050  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.89 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0284539  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0179  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  26.15 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4797  TrpR binding protein WrbA  32.17 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153134  normal  0.829265 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0755  NADPH-dependent FMN reductase  29.8 
 
 		 213 aa  74.7  0.0000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.263848  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  30.82 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0428  NADPH-dependent FMN reductase  32.97 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.75 
 
 		 160 aa  73.9  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03195  hypothetical protein  34.38 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002786  Trp repressor-binding protein  29.38 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1256  flavoprotein WrbA  33.59 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2979  NADPH-dependent FMN reductase  29.29 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.670971 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1043  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.603654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0274  hypothetical protein  33.06 
 
 		 168 aa  72.4  0.000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.367825  normal  0.693938 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  32.7 
 
 		 206 aa  72  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3831  TrpR binding protein WrbA  30.07 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.872601 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0284  NADPH-dependent FMN reductase  29.03 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1148  flavoprotein WrbA  40 
 
 		 201 aa  72  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0896  flavoprotein WrbA  31.48 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2925  NADPH-dependent FMN reductase  28.79 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000194359  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4647  TrpR binding protein WrbA  27.92 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4280  TrpR binding protein WrbA  27.92 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  32.31 
 
 		 220 aa  71.2  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0017  NADPH-dependent FMN reductase  25.91 
 
 		 194 aa  71.2  0.000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3284  NADPH-dependent FMN reductase  35.17 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.951999 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3773  NADPH-dependent FMN reductase  31.28 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.65168  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2330  NADPH-dependent FMN reductase  33.12 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  0.0193614 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1264  NADPH-dependent FMN reductase  27.92 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.246056  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2261  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  0.127615 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0277  NADPH-dependent FMN reductase  28.43 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1442  NADPH-dependent FMN reductase  30.16 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.103462  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  37.96 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3305  iron-sulfur flavoprotein  29.73 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.328284  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1637  NADPH-dependent FMN reductase  27.64 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0800599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2368  TrpR binding protein WrbA  30.77 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.598358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0958  flavoprotein WrbA  32.06 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0631  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.08 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0325  NADPH-dependent FMN reductase  29.15 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6613  TrpR binding protein WrbA  31.51 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4633  hypothetical protein  28.95 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6131  TrpR binding protein WrbA  31.51 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0105  TrpR binding protein WrbA  41.46 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0071  NADPH-dependent FMN reductase  37.29 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109479  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0301  NADPH-dependent FMN reductase  34.62 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.354287  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5766  TrpR binding protein WrbA  31.51 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1507  NADPH-dependent FMN reductase  28.03 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.569037  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  27.98 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1170  FMN reductase, NADPH-dependent  30.67 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0650  NADPH-dependent FMN reductase  25.39 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1543  NADPH-dependent FMN reductase  25.76 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0882991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  31.51 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0158  NADPH-dependent FMN reductase  27 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0396  flavoprotein WrbA  37.36 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6057  TrpR binding protein WrbA  34.35 
 
 		 200 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6351  TrpR binding protein WrbA  30.14 
 
 		 200 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0293  NADPH-dependent FMN reductase  28.66 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000996855  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1421  NADPH-dependent FMN reductase  34.39 
 
 		 187 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.9217  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1057  NADPH-dependent FMN reductase  26.9 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.840292  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1029  NADPH-dependent FMN reductase  33.6 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.153649  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0173  multimeric flavodoxin WrbA  26.63 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000913866  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0991  NADPH-dependent FMN reductase  27.41 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.451509  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2899  putative flavodoxin  33.33 
 
 		 184 aa  67  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  0.54123 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>