239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0325 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0325  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
188 aa  386  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0650  NADPH-dependent FMN reductase  64.17 
 
 
190 aa  260  8e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1385  iron-sulfur flavoprotein  60.64 
 
 
191 aa  260  8e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0277  NADPH-dependent FMN reductase  61.17 
 
 
199 aa  257  6e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0991  NADPH-dependent FMN reductase  60.64 
 
 
199 aa  256  1e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.451509  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2925  NADPH-dependent FMN reductase  63.1 
 
 
193 aa  255  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000194359  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1487  NADPH-dependent FMN reductase  58.51 
 
 
198 aa  254  5e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.535714  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  60.64 
 
 
191 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1637  NADPH-dependent FMN reductase  60.11 
 
 
191 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0800599  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2535  NADPH-dependent FMN reductase  58.29 
 
 
191 aa  242  1.9999999999999999e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.437841 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0109  NADPH-dependent FMN reductase  59.57 
 
 
191 aa  234  8e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1057  NADPH-dependent FMN reductase  56.15 
 
 
190 aa  216  1e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.840292  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1170  FMN reductase, NADPH-dependent  55.49 
 
 
207 aa  216  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1029  iron-sulfur flavoprotein  55.08 
 
 
190 aa  215  2e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.343926  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  54.3 
 
 
206 aa  215  2.9999999999999998e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  51.6 
 
 
192 aa  214  8e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1441  NADPH-dependent FMN reductase  51.85 
 
 
192 aa  213  9.999999999999999e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2979  NADPH-dependent FMN reductase  54.26 
 
 
204 aa  211  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.670971 
 
 
-
 
NC_002936  DET1244  NADPH-dependent FMN reductase  55.08 
 
 
190 aa  210  1e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1543  NADPH-dependent FMN reductase  51.34 
 
 
193 aa  210  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0882991  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1623  hypothetical protein  51.32 
 
 
194 aa  209  2e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1043  NADPH-dependent FMN reductase  50 
 
 
192 aa  207  8e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.603654  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  51.91 
 
 
204 aa  206  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1770  NADPH-dependent FMN reductase  56.68 
 
 
190 aa  206  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000383709  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1264  NADPH-dependent FMN reductase  51.34 
 
 
200 aa  201  5e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.246056  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0017  NADPH-dependent FMN reductase  50.27 
 
 
194 aa  195  3e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0179  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  47.57 
 
 
211 aa  194  6e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1507  NADPH-dependent FMN reductase  51.32 
 
 
194 aa  194  6e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.569037  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0284  NADPH-dependent FMN reductase  48.11 
 
 
211 aa  193  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  48.91 
 
 
205 aa  193  1e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0301  NADPH-dependent FMN reductase  47.03 
 
 
211 aa  191  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.354287  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0722  NADPH-dependent FMN reductase  47.57 
 
 
211 aa  190  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.658969  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2381  NADPH-dependent FMN reductase  46.03 
 
 
195 aa  181  4.0000000000000006e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.19679e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1959  NADPH-dependent FMN reductase  44.32 
 
 
211 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.783003  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0293  NADPH-dependent FMN reductase  42.78 
 
 
208 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000996855  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1178  NADPH-dependent FMN reductase  44.86 
 
 
223 aa  166  1e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  39.04 
 
 
208 aa  159  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1058  NADPH-dependent FMN reductase  41.18 
 
 
192 aa  155  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0797  hypothetical protein  42.02 
 
 
189 aa  150  8.999999999999999e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000338584 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0909  NADPH-dependent FMN reductase  42.54 
 
 
206 aa  150  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0780942  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11340  multimeric flavodoxin WrbA  45.86 
 
 
208 aa  149  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0869  NADPH-dependent FMN reductase  43.09 
 
 
206 aa  149  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00401648  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1487  NADPH-dependent FMN reductase  43.41 
 
 
207 aa  148  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.22855  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3584  NADPH-dependent FMN reductase  42.25 
 
 
212 aa  144  7.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000299171  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0948  NADPH-dependent FMN reductase  45.05 
 
 
211 aa  142  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105461  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0173  multimeric flavodoxin WrbA  39.78 
 
 
206 aa  141  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000913866  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0225  NADPH-dependent FMN reductase  39.89 
 
 
189 aa  141  5e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.545185  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2588  NADPH-dependent FMN reductase  41.94 
 
 
210 aa  137  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122146  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1620  NADPH-dependent FMN reductase  42.86 
 
 
211 aa  135  5e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  40.51 
 
 
193 aa  125  3e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  39.49 
 
 
193 aa  125  5e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1956  NADPH-dependent FMN reductase  38.12 
 
 
204 aa  120  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000522685  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  39.49 
 
 
193 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  36.6 
 
 
194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2419  NADPH-dependent FMN reductase  34.9 
 
 
189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.873931  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  37.11 
 
 
193 aa  103  2e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  30.81 
 
 
183 aa  93.2  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  32.8 
 
 
187 aa  90.9  9e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0316  NADPH-dependent FMN reductase  34.62 
 
 
212 aa  90.1  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  34.44 
 
 
207 aa  85.5  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2377  NADPH-dependent FMN reductase  29.35 
 
 
209 aa  84.3  9e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000848109  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  31.75 
 
 
223 aa  84  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  33.16 
 
 
211 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2482  NADPH-dependent FMN reductase  32.95 
 
 
222 aa  83.2  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.801364  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  29.03 
 
 
186 aa  82.4  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0321  NADPH-dependent FMN reductase  28.11 
 
 
197 aa  82  0.000000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.378386  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  32.64 
 
 
220 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3773  NADPH-dependent FMN reductase  32.12 
 
 
220 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.65168  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0755  NADPH-dependent FMN reductase  30.26 
 
 
213 aa  80.9  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.263848  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0413  NADPH-dependent FMN reductase  32.24 
 
 
182 aa  80.5  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.72676  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1442  NADPH-dependent FMN reductase  42.31 
 
 
217 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1505  NADPH-dependent FMN reductase  29.26 
 
 
197 aa  79  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  29.19 
 
 
186 aa  78.6  0.00000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0630  NADPH-dependent FMN reductase  27.81 
 
 
233 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0414  NADPH-dependent FMN reductase  29.26 
 
 
197 aa  77.4  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0252  iron-sulfur flavoprotein  29.51 
 
 
227 aa  76.6  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.488898  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  28.42 
 
 
193 aa  76.6  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  35.66 
 
 
217 aa  77  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  40.38 
 
 
217 aa  76.6  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0421  NADPH-dependent FMN reductase  28.79 
 
 
197 aa  76.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0486  NADPH-dependent FMN reductase  26.26 
 
 
197 aa  76.3  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.260904  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3523  NADPH-dependent FMN reductase  40.38 
 
 
218 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2580  iron-sulfur flavoprotein  40.38 
 
 
222 aa  75.5  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29861  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1467  NADPH-dependent FMN reductase  38.83 
 
 
216 aa  75.5  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  31.49 
 
 
214 aa  75.1  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1851  NADPH-dependent FMN reductase  33.01 
 
 
204 aa  75.1  0.0000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0492811  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  28.65 
 
 
186 aa  74.7  0.0000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1381  NADPH-dependent FMN reductase  39.81 
 
 
216 aa  74.7  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196943  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0163  NADPH-dependent FMN reductase  30.11 
 
 
195 aa  74.7  0.0000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  32.18 
 
 
214 aa  74.3  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0408  NADPH-dependent FMN reductase  30.46 
 
 
225 aa  73.9  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1125  NADPH-dependent FMN reductase  31.25 
 
 
217 aa  74.3  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000715162  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2261  NADPH-dependent FMN reductase  30.95 
 
 
222 aa  72  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  0.127615 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3039  NADPH-dependent FMN reductase  33.16 
 
 
202 aa  72.4  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.301206 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0018  NADPH-dependent FMN reductase  39.42 
 
 
228 aa  72  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1584  NADPH-dependent FMN reductase  34.78 
 
 
220 aa  72  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0870  NADPH-dependent FMN reductase  29.15 
 
 
195 aa  70.5  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000162046  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0549  NADPH-dependent FMN reductase  31.87 
 
 
199 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  36.84 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>