More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0489 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0489  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
206 aa  419  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3039  NADPH-dependent FMN reductase  65.48 
 
 
202 aa  267  1e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.301206 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1510  NADPH-dependent FMN reductase  56.63 
 
 
202 aa  237  6.999999999999999e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0870  NADPH-dependent FMN reductase  53.93 
 
 
195 aa  236  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000162046  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2465  NADPH-dependent FMN reductase  55.05 
 
 
202 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0549  NADPH-dependent FMN reductase  49.25 
 
 
199 aa  224  9e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0621  NADPH-dependent FMN reductase  60.1 
 
 
201 aa  222  3e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.295503  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  40.51 
 
 
194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  40.1 
 
 
193 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  40.1 
 
 
193 aa  128  6e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  39.59 
 
 
193 aa  126  3e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  40.78 
 
 
193 aa  123  2e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0163  NADPH-dependent FMN reductase  38.73 
 
 
195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  37.93 
 
 
187 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  36.93 
 
 
193 aa  111  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  39.35 
 
 
207 aa  102  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1505  NADPH-dependent FMN reductase  33.17 
 
 
197 aa  96.7  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0421  NADPH-dependent FMN reductase  33.17 
 
 
197 aa  95.1  6e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0414  NADPH-dependent FMN reductase  32.5 
 
 
197 aa  93.6  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0486  NADPH-dependent FMN reductase  33.13 
 
 
197 aa  90.5  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.260904  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0321  NADPH-dependent FMN reductase  34.36 
 
 
197 aa  89.7  3e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.378386  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0252  iron-sulfur flavoprotein  31.86 
 
 
227 aa  86.7  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.488898  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0316  NADPH-dependent FMN reductase  36.18 
 
 
212 aa  86.7  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2381  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
195 aa  83.6  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.19679e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2377  NADPH-dependent FMN reductase  30.05 
 
 
209 aa  82.8  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000848109  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0755  NADPH-dependent FMN reductase  31.73 
 
 
213 aa  81.6  0.000000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.263848  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  37.91 
 
 
223 aa  77.4  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2330  NADPH-dependent FMN reductase  34.88 
 
 
224 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  0.0193614 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  37.01 
 
 
204 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  29.44 
 
 
191 aa  77  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1385  iron-sulfur flavoprotein  34.34 
 
 
191 aa  74.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0109  NADPH-dependent FMN reductase  30.05 
 
 
191 aa  74.7  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1507  NADPH-dependent FMN reductase  34.12 
 
 
194 aa  72.4  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.569037  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0017  NADPH-dependent FMN reductase  33.54 
 
 
194 aa  72.4  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1442  NADPH-dependent FMN reductase  39.45 
 
 
217 aa  72  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  34.23 
 
 
208 aa  71.6  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  34.42 
 
 
206 aa  71.6  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1170  FMN reductase, NADPH-dependent  31.84 
 
 
207 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1637  NADPH-dependent FMN reductase  34.39 
 
 
191 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0800599  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2535  NADPH-dependent FMN reductase  31.1 
 
 
191 aa  70.5  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.437841 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  37.61 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0274  hypothetical protein  46.91 
 
 
168 aa  69.7  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.367825  normal  0.693938 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0018  NADPH-dependent FMN reductase  36.45 
 
 
228 aa  69.7  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.63 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0325  NADPH-dependent FMN reductase  42.45 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1148  flavoprotein WrbA  36.26 
 
 
201 aa  68.9  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  35.78 
 
 
217 aa  68.9  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  38.53 
 
 
214 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  38.53 
 
 
186 aa  68.6  0.00000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  38.53 
 
 
186 aa  68.6  0.00000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  35.09 
 
 
185 aa  68.6  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  28.65 
 
 
192 aa  68.2  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  29.21 
 
 
205 aa  68.2  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2979  NADPH-dependent FMN reductase  39.81 
 
 
204 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.670971 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1072  NADPH-dependent FMN reductase  32.64 
 
 
212 aa  67.8  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1623  hypothetical protein  31.37 
 
 
194 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0991  NADPH-dependent FMN reductase  31.82 
 
 
199 aa  67.4  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.451509  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0277  NADPH-dependent FMN reductase  31.82 
 
 
199 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0179  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  28.11 
 
 
211 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1851  NADPH-dependent FMN reductase  36.32 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0492811  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2414  flavoprotein WrbA  39.24 
 
 
200 aa  67  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5355  flavoprotein WrbA  31.89 
 
 
199 aa  66.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.272087  normal  0.149509 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0396  flavoprotein WrbA  35.16 
 
 
212 aa  67.4  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  37.14 
 
 
214 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1746  Trp repressor-binding protein  31.78 
 
 
186 aa  66.2  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1264  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
200 aa  66.6  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.246056  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1487  NADPH-dependent FMN reductase  33.94 
 
 
198 aa  66.6  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.535714  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  37.61 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1029  NADPH-dependent FMN reductase  31.29 
 
 
222 aa  66.2  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.153649  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1441  NADPH-dependent FMN reductase  30.72 
 
 
192 aa  66.2  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0722  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
211 aa  66.6  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.658969  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1130  NADPH-dependent FMN reductase  34.58 
 
 
182 aa  65.9  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03195  hypothetical protein  36.71 
 
 
190 aa  65.9  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6077  TrpR binding protein WrbA  35.16 
 
 
200 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.201338  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3523  NADPH-dependent FMN reductase  35.24 
 
 
218 aa  65.1  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1256  flavoprotein WrbA  32.84 
 
 
204 aa  65.1  0.0000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1676  hypothetical protein  33.33 
 
 
200 aa  64.7  0.0000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  hitchhiker  0.000000298375 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5841  TrpR binding protein WrbA  35.16 
 
 
200 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.823521 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1988  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  37.82 
 
 
321 aa  63.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0292793  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6351  TrpR binding protein WrbA  37.18 
 
 
200 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0620  TrpR binding protein WrbA  37.18 
 
 
200 aa  64.7  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2580  iron-sulfur flavoprotein  34.86 
 
 
222 aa  64.3  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29861  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  39.42 
 
 
211 aa  64.3  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0105  TrpR binding protein WrbA  36.71 
 
 
204 aa  63.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0460  TrpR binding protein WrbA  37.18 
 
 
200 aa  64.7  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6613  TrpR binding protein WrbA  34.07 
 
 
200 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.280289 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2097  NADPH-dependent FMN reductase  36.04 
 
 
236 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  34.07 
 
 
200 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5766  TrpR binding protein WrbA  34.07 
 
 
200 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6131  TrpR binding protein WrbA  34.07 
 
 
200 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2234  flavoprotein WrbA  40.79 
 
 
206 aa  62.8  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.710258  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002786  Trp repressor-binding protein  35.44 
 
 
189 aa  62.4  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  39.47 
 
 
199 aa  62.8  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0650  NADPH-dependent FMN reductase  31.06 
 
 
190 aa  62  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0293  NADPH-dependent FMN reductase  28.66 
 
 
208 aa  62.4  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000996855  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4797  TrpR binding protein WrbA  36.71 
 
 
199 aa  62  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153134  normal  0.829265 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2482  NADPH-dependent FMN reductase  32.03 
 
 
222 aa  62  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.801364  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1043  NADPH-dependent FMN reductase  28.12 
 
 
192 aa  62  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.603654  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6057  TrpR binding protein WrbA  31.87 
 
 
200 aa  62  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186902  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2261  NADPH-dependent FMN reductase  31.21 
 
 
222 aa  61.6  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  0.127615 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>