More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1251 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
186 aa  381  1e-105  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  89.25 
 
 
186 aa  341  2.9999999999999997e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  87.1 
 
 
186 aa  338  2.9999999999999998e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  34.22 
 
 
191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  33.15 
 
 
185 aa  103  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  32.31 
 
 
193 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0017  NADPH-dependent FMN reductase  34.76 
 
 
194 aa  102  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0722  NADPH-dependent FMN reductase  33.68 
 
 
211 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.658969  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1441  NADPH-dependent FMN reductase  34.9 
 
 
192 aa  102  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  32.8 
 
 
183 aa  102  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0650  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
190 aa  102  5e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2272  NADPH-dependent FMN reductase  35.32 
 
 
197 aa  101  5e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1385  iron-sulfur flavoprotein  34.76 
 
 
191 aa  101  6e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1149  NADPH-dependent FMN reductase  43.56 
 
 
208 aa  101  7e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.285301  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  32.8 
 
 
208 aa  99.8  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1543  NADPH-dependent FMN reductase  31.55 
 
 
193 aa  99.8  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0882991  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  37.04 
 
 
187 aa  100  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  32.63 
 
 
193 aa  99.8  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1507  NADPH-dependent FMN reductase  34.22 
 
 
194 aa  99  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.569037  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1487  NADPH-dependent FMN reductase  29.03 
 
 
198 aa  98.6  5e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.535714  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1637  NADPH-dependent FMN reductase  34.22 
 
 
191 aa  98.6  5e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0800599  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  29.74 
 
 
193 aa  98.6  5e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  42.57 
 
 
210 aa  98.6  5e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  32.11 
 
 
193 aa  98.2  7e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2381  NADPH-dependent FMN reductase  31.02 
 
 
195 aa  97.4  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.19679e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1043  NADPH-dependent FMN reductase  34.21 
 
 
192 aa  97.1  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.603654  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  44.55 
 
 
211 aa  95.9  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0991  NADPH-dependent FMN reductase  31.55 
 
 
199 aa  96.3  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.451509  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0277  NADPH-dependent FMN reductase  31.55 
 
 
199 aa  95.9  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0293  NADPH-dependent FMN reductase  32.98 
 
 
208 aa  95.9  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000996855  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0179  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  31.25 
 
 
211 aa  95.5  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0413  NADPH-dependent FMN reductase  30.65 
 
 
182 aa  95.5  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.72676  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2991  NADPH-dependent FMN reductase  32.26 
 
 
185 aa  94.4  9e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  34.92 
 
 
192 aa  93.6  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  32.64 
 
 
194 aa  94  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  31.63 
 
 
206 aa  92.4  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1815  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  42.02 
 
 
224 aa  92.4  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1244  NADPH-dependent FMN reductase  40.31 
 
 
190 aa  92  4e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1623  hypothetical protein  31.94 
 
 
194 aa  91.7  5e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1029  iron-sulfur flavoprotein  39.37 
 
 
190 aa  91.3  7e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.343926  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2330  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
224 aa  90.9  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  0.0193614 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  28.18 
 
 
182 aa  90.9  9e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0159  NADPH-dependent FMN reductase  32.98 
 
 
203 aa  90.5  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1959  NADPH-dependent FMN reductase  28.49 
 
 
211 aa  90.5  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.783003  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1770  NADPH-dependent FMN reductase  44.34 
 
 
190 aa  89.4  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000383709  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1057  NADPH-dependent FMN reductase  45.1 
 
 
190 aa  89  4e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.840292  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  33.15 
 
 
220 aa  88.2  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1264  NADPH-dependent FMN reductase  30.57 
 
 
200 aa  88.2  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.246056  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  29.28 
 
 
186 aa  88.2  7e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3773  NADPH-dependent FMN reductase  32.07 
 
 
220 aa  87.8  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.65168  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0301  NADPH-dependent FMN reductase  28.21 
 
 
211 aa  87.8  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.354287  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2535  NADPH-dependent FMN reductase  40.43 
 
 
191 aa  87.4  9e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.437841 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0166  NADPH-dependent FMN reductase  40.78 
 
 
196 aa  87.8  9e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0284  NADPH-dependent FMN reductase  28.21 
 
 
211 aa  87.8  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2979  NADPH-dependent FMN reductase  29.41 
 
 
204 aa  87.4  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.670971 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0308  NADPH-dependent FMN reductase  34.65 
 
 
204 aa  86.7  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.471384 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  31.18 
 
 
206 aa  86.3  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2733  NADPH-dependent FMN reductase  31.5 
 
 
204 aa  86.3  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1851  NADPH-dependent FMN reductase  35.95 
 
 
204 aa  86.3  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0492811  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0316  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 
212 aa  86.7  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0076  NADPH-dependent FMN reductase  32.67 
 
 
202 aa  85.9  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.399945  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2849  NADPH-dependent FMN reductase  39.09 
 
 
192 aa  85.9  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
205 aa  85.5  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  31.02 
 
 
204 aa  84.7  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0938  NADPH-dependent FMN reductase  30.98 
 
 
220 aa  84.3  8e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2925  NADPH-dependent FMN reductase  29.41 
 
 
193 aa  84.3  9e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000194359  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  36.28 
 
 
193 aa  84  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0109  NADPH-dependent FMN reductase  28.27 
 
 
191 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2997  NADPH-dependent FMN reductase  31.33 
 
 
184 aa  84  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0315889  normal  0.693807 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0909  NADPH-dependent FMN reductase  28.65 
 
 
206 aa  83.6  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0780942  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2817  NADPH-dependent FMN reductase  40.21 
 
 
194 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1988  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  36.52 
 
 
321 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0292793  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1498  NADPH-dependent FMN reductase  30.34 
 
 
185 aa  83.6  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0869  NADPH-dependent FMN reductase  29.19 
 
 
206 aa  83.2  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00401648  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0309  NADPH-dependent FMN reductase  34.51 
 
 
212 aa  83.2  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0303  NADPH-dependent FMN reductase  36.45 
 
 
199 aa  82.8  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0954  NADPH-dependent FMN reductase  34.71 
 
 
184 aa  82.8  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0784  NADPH-dependent FMN reductase  30.11 
 
 
179 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0275  NADPH-dependent FMN reductase  37.27 
 
 
178 aa  82  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0374  NADPH-dependent FMN reductase  31.5 
 
 
188 aa  82  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.4772 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1505  NADPH-dependent FMN reductase  38.74 
 
 
197 aa  82.4  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11340  multimeric flavodoxin WrbA  30.43 
 
 
208 aa  82  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00930  NADPH-dependent FMN reductase  36.89 
 
 
173 aa  82  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407777  normal  0.42644 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1130  NADPH-dependent FMN reductase  36.88 
 
 
182 aa  81.6  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1371  NADPH-dependent FMN reductase  36.21 
 
 
190 aa  82  0.000000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2738  NADPH-dependent FMN reductase  35.66 
 
 
199 aa  81.6  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1182  NADPH-dependent FMN reductase  36.21 
 
 
190 aa  81.6  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000238882  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0727  NADPH-dependent FMN reductase  28.79 
 
 
204 aa  81.3  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1487  NADPH-dependent FMN reductase  28.19 
 
 
207 aa  80.9  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.22855  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0321  NADPH-dependent FMN reductase  39 
 
 
197 aa  80.9  0.000000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.378386  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0077  NADPH-dependent FMN reductase  31.9 
 
 
208 aa  80.9  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0486  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 
197 aa  80.5  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.260904  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1102  iron-sulfur flavoprotein  35.66 
 
 
182 aa  80.5  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000321891  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2732  NADPH-dependent FMN reductase  30.92 
 
 
209 aa  80.1  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1152  NADPH-dependent FMN reductase  35.34 
 
 
190 aa  80.1  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000059068  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1677  EIF-4a family ATP-dependent RNA helicase  30.05 
 
 
195 aa  79.3  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.42151  hitchhiker  0.000000240044 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1676  hypothetical protein  35.29 
 
 
200 aa  79  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  hitchhiker  0.000000298375 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0158  NADPH-dependent FMN reductase  35.14 
 
 
206 aa  79  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  36.19 
 
 
207 aa  79  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0797  hypothetical protein  27.53 
 
 
189 aa  79  0.00000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000338584 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>