234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0309 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0309  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
212 aa  438  9.999999999999999e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0076  NADPH-dependent FMN reductase  55.67 
 
 
202 aa  230  1e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.399945  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0158  NADPH-dependent FMN reductase  53.88 
 
 
206 aa  224  9e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2732  NADPH-dependent FMN reductase  51.58 
 
 
209 aa  204  1e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1676  hypothetical protein  41.84 
 
 
200 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  hitchhiker  0.000000298375 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0159  NADPH-dependent FMN reductase  43.72 
 
 
203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2733  NADPH-dependent FMN reductase  41.87 
 
 
204 aa  155  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0077  NADPH-dependent FMN reductase  42.65 
 
 
208 aa  155  5.0000000000000005e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2817  NADPH-dependent FMN reductase  42.54 
 
 
194 aa  144  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0308  NADPH-dependent FMN reductase  37.31 
 
 
204 aa  141  9e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.471384 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1182  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 
190 aa  131  6.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000238882  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1152  NADPH-dependent FMN reductase  36.9 
 
 
190 aa  131  7.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000059068  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1371  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 
190 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0303  NADPH-dependent FMN reductase  33.68 
 
 
199 aa  126  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2120  NADPH-dependent FMN reductase  34.64 
 
 
208 aa  125  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0276138  normal  0.10387 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1677  EIF-4a family ATP-dependent RNA helicase  33.85 
 
 
195 aa  124  1e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.42151  hitchhiker  0.000000240044 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2849  NADPH-dependent FMN reductase  37.17 
 
 
192 aa  120  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1392  NADPH-dependent FMN reductase  33.16 
 
 
201 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1498  NADPH-dependent FMN reductase  33.85 
 
 
185 aa  101  7e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2738  NADPH-dependent FMN reductase  28.65 
 
 
199 aa  97.1  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1815  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  47 
 
 
224 aa  94.7  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0080  NADPH-dependent FMN reductase  30.98 
 
 
201 aa  93.6  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0166  NADPH-dependent FMN reductase  29.23 
 
 
196 aa  89  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1619  NADPH-dependent FMN reductase  38.78 
 
 
179 aa  89  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3622  NADPH-dependent FMN reductase  29.32 
 
 
191 aa  89  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  27.08 
 
 
185 aa  87.4  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  27.06 
 
 
217 aa  87.8  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1442  NADPH-dependent FMN reductase  26.24 
 
 
217 aa  86.3  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  27.51 
 
 
214 aa  86.7  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  40.4 
 
 
210 aa  86.3  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0772  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  32.28 
 
 
193 aa  85.5  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.806618  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  28.04 
 
 
214 aa  85.5  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1149  NADPH-dependent FMN reductase  40.4 
 
 
208 aa  85.1  7e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.285301  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  27.37 
 
 
186 aa  84.3  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1320  NADPH-dependent FMN reductase  32.65 
 
 
179 aa  83.6  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.654727  normal  0.0975932 
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  34.51 
 
 
186 aa  83.2  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  35.24 
 
 
193 aa  82.8  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  36.19 
 
 
193 aa  83.2  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0275  NADPH-dependent FMN reductase  35.05 
 
 
178 aa  82.4  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1131  hypothetical protein  31.72 
 
 
179 aa  82.8  0.000000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 
220 aa  82  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  32.38 
 
 
194 aa  82.4  0.000000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  35.92 
 
 
193 aa  82  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  35.35 
 
 
193 aa  81.6  0.000000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2330  NADPH-dependent FMN reductase  37 
 
 
224 aa  81.6  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  0.0193614 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  33.65 
 
 
186 aa  81.6  0.000000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0125  NADPH-dependent FMN reductase  29.73 
 
 
190 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18210  NADPH-dependent FMN reductase  43.43 
 
 
177 aa  81.3  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1988  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  30.16 
 
 
321 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0292793  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3773  NADPH-dependent FMN reductase  38 
 
 
220 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.65168  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2213  NADPH-dependent FMN reductase  27.85 
 
 
189 aa  80.5  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0120  hypothetical protein  25.77 
 
 
200 aa  80.5  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0671  NADPH-dependent FMN reductase  35.33 
 
 
239 aa  79.3  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.610211 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  33.57 
 
 
183 aa  79.3  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  34.48 
 
 
193 aa  79  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0018  NADPH-dependent FMN reductase  28.28 
 
 
228 aa  78.6  0.00000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  26.46 
 
 
217 aa  78.6  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  32.74 
 
 
186 aa  78.6  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1188  NADPH-dependent FMN reductase  32.57 
 
 
180 aa  78.2  0.00000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.646638 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0938  NADPH-dependent FMN reductase  41.35 
 
 
220 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0133  NADPH-dependent FMN reductase  26.74 
 
 
191 aa  77  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000492716  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0988  NADPH-dependent FMN reductase  28.65 
 
 
294 aa  77  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.327411  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1285  NADPH-dependent FMN reductase  27.64 
 
 
197 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.497649  normal  0.389555 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  35.35 
 
 
211 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1381  NADPH-dependent FMN reductase  28.17 
 
 
216 aa  75.9  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196943  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  30.97 
 
 
187 aa  75.5  0.0000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0893  NADPH-dependent FMN reductase  26.73 
 
 
200 aa  75.1  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0408  NADPH-dependent FMN reductase  38.83 
 
 
225 aa  75.1  0.0000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0784  NADPH-dependent FMN reductase  32.67 
 
 
179 aa  74.7  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0677  iron-sulfur flavoprotein  33.33 
 
 
250 aa  74.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0441  iron-sulfur flavoprotein  31.25 
 
 
194 aa  74.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  37 
 
 
223 aa  74.3  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0017  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
194 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0374  NADPH-dependent FMN reductase  33.67 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.4772 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1241  NADPH-dependent FMN reductase  25.77 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  30.3 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3468  multimeric flavodoxin WrbA family protein  37.37 
 
 
183 aa  73.2  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.177131  decreased coverage  0.000563166 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0542  iron-sulfur flavoprotein, putative  30.06 
 
 
204 aa  73.2  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.423785  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2856  NADPH-dependent FMN reductase  29.32 
 
 
210 aa  72.4  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2272  NADPH-dependent FMN reductase  33.91 
 
 
197 aa  72  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0521  NADPH-dependent FMN reductase  35.58 
 
 
217 aa  71.6  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0748  iron-sulfur flavoprotein  27.32 
 
 
195 aa  70.9  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.203042 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  27.93 
 
 
192 aa  70.9  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0163  NADPH-dependent FMN reductase  37.84 
 
 
195 aa  70.9  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1442  NADPH-dependent FMN reductase  36 
 
 
224 aa  71.2  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.103462  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  39 
 
 
204 aa  70.5  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  31.5 
 
 
191 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1125  NADPH-dependent FMN reductase  33.65 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000715162  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  36.7 
 
 
206 aa  69.7  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3523  NADPH-dependent FMN reductase  34.31 
 
 
218 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0954  NADPH-dependent FMN reductase  29.53 
 
 
184 aa  69.7  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2991  NADPH-dependent FMN reductase  32.73 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18130  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
172 aa  68.9  0.00000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.340395  normal  0.960689 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  32.32 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  35 
 
 
221 aa  68.6  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  31.31 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2997  NADPH-dependent FMN reductase  30.61 
 
 
184 aa  68.6  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0315889  normal  0.693807 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0357  hypothetical protein  33.33 
 
 
211 aa  68.2  0.00000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3141  iron-sulfur flavoprotein  33.67 
 
 
178 aa  68.2  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.087899  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2261  NADPH-dependent FMN reductase  38 
 
 
222 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  0.127615 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>