266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1130 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1130  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
182 aa  369  1e-101  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1102  iron-sulfur flavoprotein  84.62 
 
 
182 aa  310  4.999999999999999e-84  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000321891  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3141  iron-sulfur flavoprotein  39.13 
 
 
178 aa  89.7  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.087899  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0677  iron-sulfur flavoprotein  40.83 
 
 
250 aa  84.3  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0784  NADPH-dependent FMN reductase  35.96 
 
 
179 aa  84  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1619  NADPH-dependent FMN reductase  36.29 
 
 
179 aa  82.8  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0130  NADPH-dependent FMN reductase  41.28 
 
 
224 aa  82.8  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  36.88 
 
 
186 aa  81.6  0.000000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2612  iron-sulfur flavoprotein  36.67 
 
 
246 aa  82  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2991  NADPH-dependent FMN reductase  31.69 
 
 
185 aa  81.6  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0158  NADPH-dependent FMN reductase  37.61 
 
 
206 aa  81.3  0.000000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  40.38 
 
 
214 aa  78.2  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0275  NADPH-dependent FMN reductase  35.38 
 
 
178 aa  77.8  0.00000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  38.46 
 
 
185 aa  77.4  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0018  NADPH-dependent FMN reductase  35.14 
 
 
228 aa  77.4  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0076  NADPH-dependent FMN reductase  38.53 
 
 
202 aa  77.4  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.399945  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1072  NADPH-dependent FMN reductase  41.35 
 
 
212 aa  77  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0672  NADPH-dependent FMN reductase  39.09 
 
 
263 aa  77.4  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.594291 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  34.75 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2463  hypothetical protein  38.79 
 
 
202 aa  76.3  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000389494  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  35.46 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0722  NADPH-dependent FMN reductase  34.12 
 
 
211 aa  76.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.658969  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0857  NADPH-dependent FMN reductase  31.61 
 
 
262 aa  75.9  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  38.21 
 
 
193 aa  75.9  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  28.73 
 
 
183 aa  75.9  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1320  NADPH-dependent FMN reductase  32 
 
 
179 aa  75.1  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.654727  normal  0.0975932 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
214 aa  75.1  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3622  NADPH-dependent FMN reductase  39.05 
 
 
191 aa  75.1  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1851  NADPH-dependent FMN reductase  38.21 
 
 
204 aa  74.7  0.0000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0492811  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  38.21 
 
 
193 aa  74.7  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2997  NADPH-dependent FMN reductase  39.09 
 
 
184 aa  74.3  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0315889  normal  0.693807 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  36.43 
 
 
221 aa  74.3  0.0000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1676  hypothetical protein  36.45 
 
 
200 aa  74.3  0.0000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  hitchhiker  0.000000298375 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1467  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
216 aa  73.6  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1442  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
217 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  35.58 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
217 aa  73.6  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0797  hypothetical protein  40 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000338584 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  34.62 
 
 
217 aa  73.2  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0869  NADPH-dependent FMN reductase  31.74 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00401648  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  37.4 
 
 
193 aa  72.4  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  36.28 
 
 
194 aa  72  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0909  NADPH-dependent FMN reductase  31.14 
 
 
206 aa  72  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0780942  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2817  NADPH-dependent FMN reductase  38.18 
 
 
194 aa  72.4  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1508  NADPH-dependent FMN reductase  37.84 
 
 
216 aa  72  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.25275  decreased coverage  0.00823646 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1131  hypothetical protein  36 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
182 aa  72  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0487  NADPH-dependent FMN reductase  35.14 
 
 
199 aa  71.2  0.000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.671634  normal  0.453927 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1381  NADPH-dependent FMN reductase  36.54 
 
 
216 aa  70.9  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196943  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0671  NADPH-dependent FMN reductase  38.1 
 
 
239 aa  70.5  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.610211 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2580  iron-sulfur flavoprotein  36.54 
 
 
222 aa  70.9  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29861  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1182  NADPH-dependent FMN reductase  34.86 
 
 
190 aa  70.5  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000238882  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1638  NADPH-dependent FMN reductase  31.41 
 
 
187 aa  70.5  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0739804  normal  0.913531 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  39.05 
 
 
223 aa  70.5  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  40.38 
 
 
204 aa  70.9  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  34.95 
 
 
207 aa  70.1  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_002936  DET1371  NADPH-dependent FMN reductase  33.94 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1441  NADPH-dependent FMN reductase  34.42 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0632  NADPH-dependent FMN reductase  35.34 
 
 
201 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1125  NADPH-dependent FMN reductase  33.65 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000715162  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1505  NADPH-dependent FMN reductase  39.81 
 
 
197 aa  69.7  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0521  NADPH-dependent FMN reductase  35.58 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0284  NADPH-dependent FMN reductase  34.86 
 
 
211 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3707  NADPH-dependent FMN reductase  31.37 
 
 
208 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0930977 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0755  NADPH-dependent FMN reductase  35.11 
 
 
213 aa  69.3  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.263848  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2213  NADPH-dependent FMN reductase  36.19 
 
 
189 aa  68.9  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0301  NADPH-dependent FMN reductase  34.86 
 
 
211 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.354287  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1498  NADPH-dependent FMN reductase  38.46 
 
 
185 aa  68.9  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3523  NADPH-dependent FMN reductase  30.82 
 
 
218 aa  68.6  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0374  NADPH-dependent FMN reductase  36.45 
 
 
188 aa  68.6  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.4772 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0727  NADPH-dependent FMN reductase  31.38 
 
 
204 aa  68.6  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00930  NADPH-dependent FMN reductase  34.62 
 
 
173 aa  68.6  0.00000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407777  normal  0.42644 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  36.19 
 
 
208 aa  68.2  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2732  NADPH-dependent FMN reductase  33.63 
 
 
209 aa  68.2  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2377  NADPH-dependent FMN reductase  37.38 
 
 
209 aa  67.8  0.00000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000848109  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0163  NADPH-dependent FMN reductase  37.74 
 
 
195 aa  68.2  0.00000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  34.62 
 
 
212 aa  68.2  0.00000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1988  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  38.46 
 
 
321 aa  67.8  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0292793  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1152  NADPH-dependent FMN reductase  28.74 
 
 
190 aa  67.8  0.00000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000059068  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0293  NADPH-dependent FMN reductase  37.14 
 
 
208 aa  67.4  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000996855  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  34.78 
 
 
211 aa  67  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0225  NADPH-dependent FMN reductase  33.13 
 
 
189 aa  67  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.545185  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1178  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
223 aa  66.2  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1046  hypothetical protein  35.19 
 
 
187 aa  66.6  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.882215 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0489  NADPH-dependent FMN reductase  34.58 
 
 
206 aa  65.9  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3724  NADPH-dependent FMN reductase  32.52 
 
 
213 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00781596  normal  0.326737 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1188  NADPH-dependent FMN reductase  30.91 
 
 
180 aa  65.9  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.646638 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0421  NADPH-dependent FMN reductase  38.83 
 
 
197 aa  65.5  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0486  NADPH-dependent FMN reductase  31.16 
 
 
197 aa  65.1  0.0000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.260904  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2535  NADPH-dependent FMN reductase  33.96 
 
 
191 aa  64.7  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.437841 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1029  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
222 aa  64.7  0.0000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.153649  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0414  NADPH-dependent FMN reductase  36.89 
 
 
197 aa  64.3  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2647  NADPH-dependent FMN reductase  36.15 
 
 
209 aa  64.7  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000475353  normal  0.334507 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1442  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 
224 aa  64.7  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.103462  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18210  NADPH-dependent FMN reductase  27.35 
 
 
177 aa  64.3  0.0000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1264  NADPH-dependent FMN reductase  34.62 
 
 
200 aa  64.3  0.0000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.246056  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1959  NADPH-dependent FMN reductase  31.69 
 
 
211 aa  64.3  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.783003  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1241  NADPH-dependent FMN reductase  38.46 
 
 
189 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2419  NADPH-dependent FMN reductase  32.59 
 
 
189 aa  63.9  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.873931  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  34.92 
 
 
205 aa  63.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>