218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1508 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1508  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
216 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.25275  decreased coverage  0.00823646 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  63.21 
 
 
217 aa  288  6e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  62.26 
 
 
217 aa  282  2.0000000000000002e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1442  NADPH-dependent FMN reductase  61.79 
 
 
217 aa  279  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3523  NADPH-dependent FMN reductase  62.91 
 
 
218 aa  276  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  61.03 
 
 
214 aa  269  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0018  NADPH-dependent FMN reductase  60.56 
 
 
228 aa  267  8.999999999999999e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2580  iron-sulfur flavoprotein  58.69 
 
 
222 aa  265  4e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29861  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  60 
 
 
214 aa  264  7e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1467  NADPH-dependent FMN reductase  61.72 
 
 
216 aa  259  2e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1381  NADPH-dependent FMN reductase  58.77 
 
 
216 aa  252  3e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196943  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2097  NADPH-dependent FMN reductase  55.76 
 
 
236 aa  249  2e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0521  NADPH-dependent FMN reductase  55.45 
 
 
217 aa  249  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1125  NADPH-dependent FMN reductase  54.29 
 
 
217 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000715162  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1799  NADPH-dependent FMN reductase  51.42 
 
 
216 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0357  hypothetical protein  37.67 
 
 
211 aa  144  1e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1522  NADPH-dependent FMN reductase  41.12 
 
 
212 aa  142  5e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00760  hypothetical protein  42.59 
 
 
211 aa  135  5e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.62232  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  40.31 
 
 
186 aa  90.9  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0158  NADPH-dependent FMN reductase  30.09 
 
 
206 aa  91.3  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1676  hypothetical protein  37.84 
 
 
200 aa  87.8  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  hitchhiker  0.000000298375 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0374  NADPH-dependent FMN reductase  32.72 
 
 
188 aa  85.9  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.4772 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  40.78 
 
 
185 aa  82.4  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1149  NADPH-dependent FMN reductase  31.02 
 
 
208 aa  81.6  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.285301  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2997  NADPH-dependent FMN reductase  32.08 
 
 
184 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0315889  normal  0.693807 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2213  NADPH-dependent FMN reductase  33.59 
 
 
189 aa  80.9  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  30.09 
 
 
210 aa  79.3  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1507  NADPH-dependent FMN reductase  33.13 
 
 
194 aa  78.6  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.569037  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  38.83 
 
 
193 aa  79  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 
223 aa  78.2  0.00000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  38.83 
 
 
193 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0076  NADPH-dependent FMN reductase  31.03 
 
 
202 aa  77.8  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.399945  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  38.83 
 
 
193 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0722  NADPH-dependent FMN reductase  30.49 
 
 
211 aa  76.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.658969  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2120  NADPH-dependent FMN reductase  38.24 
 
 
208 aa  77  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0276138  normal  0.10387 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1498  NADPH-dependent FMN reductase  39.81 
 
 
185 aa  77  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  36.21 
 
 
182 aa  77  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0316  NADPH-dependent FMN reductase  30.57 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0487  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 
199 aa  75.5  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.671634  normal  0.453927 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  32.32 
 
 
211 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  39.45 
 
 
207 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  39.06 
 
 
205 aa  75.1  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0650  NADPH-dependent FMN reductase  33.59 
 
 
190 aa  74.3  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2732  NADPH-dependent FMN reductase  29.38 
 
 
209 aa  73.6  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0671  NADPH-dependent FMN reductase  39.62 
 
 
239 aa  73.6  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.610211 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0893  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
200 aa  73.6  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2330  NADPH-dependent FMN reductase  37.14 
 
 
224 aa  73.9  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  0.0193614 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  37.5 
 
 
212 aa  73.9  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
204 aa  73.9  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  36.54 
 
 
206 aa  73.9  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0017  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
194 aa  73.2  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  42.86 
 
 
221 aa  73.2  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  35.92 
 
 
194 aa  72.8  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1170  FMN reductase, NADPH-dependent  44.66 
 
 
207 aa  72.8  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1441  NADPH-dependent FMN reductase  37.21 
 
 
192 aa  71.6  0.000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1623  hypothetical protein  34.88 
 
 
194 aa  71.6  0.000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1130  NADPH-dependent FMN reductase  37.84 
 
 
182 aa  72  0.000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0468  NADPH-dependent FMN reductase  32.2 
 
 
205 aa  70.9  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0704146  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1392  NADPH-dependent FMN reductase  34.91 
 
 
201 aa  71.2  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  34.11 
 
 
191 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0772  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  30.5 
 
 
193 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.806618  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1497  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.88 
 
 
198 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.250529  normal  0.118401 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3622  NADPH-dependent FMN reductase  29.6 
 
 
191 aa  69.7  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0284  NADPH-dependent FMN reductase  36.45 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1241  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
189 aa  69.7  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0109  NADPH-dependent FMN reductase  39.42 
 
 
191 aa  69.3  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3305  iron-sulfur flavoprotein  40 
 
 
222 aa  68.9  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.328284  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0293  NADPH-dependent FMN reductase  39.29 
 
 
208 aa  69.3  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000996855  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  36.94 
 
 
208 aa  68.9  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0277  NADPH-dependent FMN reductase  31.82 
 
 
199 aa  68.9  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0991  NADPH-dependent FMN reductase  32.56 
 
 
199 aa  68.9  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.451509  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1637  NADPH-dependent FMN reductase  31.78 
 
 
191 aa  68.6  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0800599  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1487  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
198 aa  68.9  0.00000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.535714  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  39.42 
 
 
220 aa  68.6  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  35.94 
 
 
206 aa  68.6  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0301  NADPH-dependent FMN reductase  32.56 
 
 
211 aa  68.6  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.354287  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0797  hypothetical protein  28.09 
 
 
189 aa  68.6  0.00000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000338584 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2272  NADPH-dependent FMN reductase  34.78 
 
 
197 aa  68.2  0.00000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0408  NADPH-dependent FMN reductase  38.1 
 
 
225 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0325  NADPH-dependent FMN reductase  36.15 
 
 
188 aa  67.8  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_002936  DET1371  NADPH-dependent FMN reductase  32.69 
 
 
190 aa  67  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1385  iron-sulfur flavoprotein  38.32 
 
 
191 aa  67  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1102  iron-sulfur flavoprotein  34.23 
 
 
182 aa  67.4  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000321891  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1770  NADPH-dependent FMN reductase  35.77 
 
 
190 aa  67  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000383709  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0909  NADPH-dependent FMN reductase  27.44 
 
 
206 aa  67  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0780942  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1620  NADPH-dependent FMN reductase  38.68 
 
 
211 aa  67.4  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1264  NADPH-dependent FMN reductase  32.56 
 
 
200 aa  66.6  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.246056  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1043  NADPH-dependent FMN reductase  35.66 
 
 
192 aa  66.2  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.603654  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0309  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0954  NADPH-dependent FMN reductase  37.19 
 
 
184 aa  66.6  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3773  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
220 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.65168  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2817  NADPH-dependent FMN reductase  28.35 
 
 
194 aa  65.9  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2463  hypothetical protein  30.25 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000389494  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1046  hypothetical protein  37.5 
 
 
187 aa  65.9  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.882215 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00930  NADPH-dependent FMN reductase  27.92 
 
 
173 aa  66.2  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407777  normal  0.42644 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2612  iron-sulfur flavoprotein  31.76 
 
 
246 aa  65.9  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2261  NADPH-dependent FMN reductase  35.24 
 
 
222 aa  65.9  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  0.127615 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0080  NADPH-dependent FMN reductase  26.23 
 
 
201 aa  65.5  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2588  NADPH-dependent FMN reductase  33.96 
 
 
210 aa  65.5  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122146  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1182  NADPH-dependent FMN reductase  32.69 
 
 
190 aa  65.1  0.0000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000238882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>