More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2279 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 		 221 aa  457  9.999999999999999e-129  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1442  NADPH-dependent FMN reductase  62.9 
 
 		 224 aa  286  2e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.103462  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  46.58 
 
 		 223 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2482  NADPH-dependent FMN reductase  44.8 
 
 		 222 aa  191  6e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.801364  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2261  NADPH-dependent FMN reductase  43.44 
 
 		 222 aa  186  3e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  0.127615 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0408  NADPH-dependent FMN reductase  42.99 
 
 		 225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1029  NADPH-dependent FMN reductase  46.61 
 
 		 222 aa  178  5.999999999999999e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.153649  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3305  iron-sulfur flavoprotein  42.08 
 
 		 222 aa  177  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.328284  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1584  NADPH-dependent FMN reductase  41.07 
 
 		 220 aa  168  5e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2330  NADPH-dependent FMN reductase  41.52 
 
 		 224 aa  158  8e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  0.0193614 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1626  NADPH-dependent FMN reductase  38.01 
 
 		 220 aa  141  8e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.65491  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  39.02 
 
 		 220 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1815  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  37.44 
 
 		 224 aa  135  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3773  NADPH-dependent FMN reductase  37.07 
 
 		 220 aa  132  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.65168  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0938  NADPH-dependent FMN reductase  35.48 
 
 		 220 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0857  NADPH-dependent FMN reductase  31.6 
 
 		 262 aa  99.8  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2272  NADPH-dependent FMN reductase  50 
 
 		 197 aa  91.7  8e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1498  NADPH-dependent FMN reductase  35.06 
 
 		 185 aa  90.9  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0727  NADPH-dependent FMN reductase  33.81 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  32.98 
 
 		 193 aa  89.7  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_002936  DET1244  NADPH-dependent FMN reductase  30.85 
 
 		 190 aa  88.2  8e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  32.46 
 
 		 193 aa  87.8  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  33.7 
 
 		 183 aa  87  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  36.25 
 
 		 186 aa  86.7  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  32.46 
 
 		 193 aa  87  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  44.34 
 
 		 217 aa  86.3  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0671  NADPH-dependent FMN reductase  38.89 
 
 		 239 aa  85.9  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.610211 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  45.28 
 
 		 214 aa  85.9  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1057  NADPH-dependent FMN reductase  30.85 
 
 		 190 aa  85.5  6e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.840292  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  46.23 
 
 		 214 aa  85.1  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2580  iron-sulfur flavoprotein  42.86 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29861  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1442  NADPH-dependent FMN reductase  43.4 
 
 		 217 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  43.4 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  44 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  38.67 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0316  NADPH-dependent FMN reductase  42.42 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0672  NADPH-dependent FMN reductase  38.89 
 
 		 263 aa  82  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.594291 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0722  NADPH-dependent FMN reductase  33.97 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.658969  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1029  iron-sulfur flavoprotein  29.26 
 
 		 190 aa  81.6  0.000000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.343926  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0018  NADPH-dependent FMN reductase  42.31 
 
 		 228 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  42 
 
 		 194 aa  80.9  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3707  NADPH-dependent FMN reductase  40.48 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0930977 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 187 aa  80.9  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0521  NADPH-dependent FMN reductase  43.4 
 
 		 217 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  31.22 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  36.51 
 
 		 185 aa  80.1  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1676  hypothetical protein  31.28 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  hitchhiker  0.000000298375 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  44.23 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2120  NADPH-dependent FMN reductase  41.41 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0276138  normal  0.10387 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0293  NADPH-dependent FMN reductase  33.87 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000996855  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  31.45 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  30.53 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  32.67 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  31.94 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  39.6 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  32.28 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1149  NADPH-dependent FMN reductase  40.59 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.285301  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1046  hypothetical protein  38.83 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.882215 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1770  NADPH-dependent FMN reductase  40.78 
 
 		 190 aa  78.2  0.00000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000383709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1102  iron-sulfur flavoprotein  38.58 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000321891  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0414  NADPH-dependent FMN reductase  36.48 
 
 		 197 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0413  NADPH-dependent FMN reductase  29.21 
 
 		 182 aa  77.8  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.72676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1851  NADPH-dependent FMN reductase  38.3 
 
 		 204 aa  78.2  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0492811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1505  NADPH-dependent FMN reductase  37.42 
 
 		 197 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18210  NADPH-dependent FMN reductase  39.42 
 
 		 177 aa  78.2  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2381  NADPH-dependent FMN reductase  33.8 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.19679e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0374  NADPH-dependent FMN reductase  37.86 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.4772 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0017  NADPH-dependent FMN reductase  33.7 
 
 		 194 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  35.12 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0748  iron-sulfur flavoprotein  31.89 
 
 		 195 aa  76.3  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.203042 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0954  NADPH-dependent FMN reductase  33.7 
 
 		 184 aa  75.5  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0109  NADPH-dependent FMN reductase  36.55 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0991  NADPH-dependent FMN reductase  34.44 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.451509  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1637  NADPH-dependent FMN reductase  32.35 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0800599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2612  iron-sulfur flavoprotein  40.2 
 
 		 246 aa  75.1  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1959  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.783003  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1125  NADPH-dependent FMN reductase  38.68 
 
 		 217 aa  74.7  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000715162  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1130  NADPH-dependent FMN reductase  36.43 
 
 		 182 aa  74.3  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1638  NADPH-dependent FMN reductase  29.93 
 
 		 187 aa  74.3  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0739804  normal  0.913531 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1241  NADPH-dependent FMN reductase  37.21 
 
 		 189 aa  74.3  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3523  NADPH-dependent FMN reductase  38.68 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00930  NADPH-dependent FMN reductase  30.72 
 
 		 173 aa  73.6  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407777  normal  0.42644 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0284  NADPH-dependent FMN reductase  32.07 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2991  NADPH-dependent FMN reductase  33.08 
 
 		 185 aa  73.9  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1619  NADPH-dependent FMN reductase  38.38 
 
 		 179 aa  73.9  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1182  NADPH-dependent FMN reductase  37 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000238882  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0163  NADPH-dependent FMN reductase  32.65 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0784  NADPH-dependent FMN reductase  38 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2997  NADPH-dependent FMN reductase  38 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0315889  normal  0.693807 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0486  NADPH-dependent FMN reductase  32.92 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.260904  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2732  NADPH-dependent FMN reductase  37 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1508  NADPH-dependent FMN reductase  42.86 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.25275  decreased coverage  0.00823646 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11340  multimeric flavodoxin WrbA  31.87 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0755  NADPH-dependent FMN reductase  33.17 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.263848  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1371  NADPH-dependent FMN reductase  37 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1108  NADPH-dependent FMN reductase  36.79 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0421  NADPH-dependent FMN reductase  36.25 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0277  NADPH-dependent FMN reductase  33.77 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0094  NADPH-dependent FMN reductase  31.06 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0301  NADPH-dependent FMN reductase  31.52 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.354287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>