266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1102 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1102  iron-sulfur flavoprotein  100 
 
 		 182 aa  369  1e-101  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000321891  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1130  NADPH-dependent FMN reductase  84.62 
 
 		 182 aa  310  4.999999999999999e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3141  iron-sulfur flavoprotein  38.71 
 
 		 178 aa  86.3  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.087899  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3622  NADPH-dependent FMN reductase  41.9 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2991  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  35.66 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  35.66 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0722  NADPH-dependent FMN reductase  34.5 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.658969  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  35.66 
 
 		 186 aa  80.1  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0784  NADPH-dependent FMN reductase  37.72 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  36.54 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0225  NADPH-dependent FMN reductase  32.6 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.545185  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  38.58 
 
 		 221 aa  78.2  0.00000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0797  hypothetical protein  40.62 
 
 		 189 aa  77.4  0.00000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000338584 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1619  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 179 aa  77.4  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1072  NADPH-dependent FMN reductase  41.51 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1638  NADPH-dependent FMN reductase  33.97 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0739804  normal  0.913531 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0869  NADPH-dependent FMN reductase  31.14 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00401648  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0130  NADPH-dependent FMN reductase  36.7 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0857  NADPH-dependent FMN reductase  30.97 
 
 		 262 aa  74.7  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1131  hypothetical protein  37.1 
 
 		 179 aa  74.7  0.0000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0076  NADPH-dependent FMN reductase  35.78 
 
 		 202 aa  74.3  0.0000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.399945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  37.14 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  36.59 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0275  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 178 aa  73.9  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0677  iron-sulfur flavoprotein  38.33 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0672  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.594291 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0018  NADPH-dependent FMN reductase  33.64 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00930  NADPH-dependent FMN reductase  36.79 
 
 		 173 aa  73.6  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407777  normal  0.42644 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0909  NADPH-dependent FMN reductase  30.54 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0780942  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  35.4 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  34.62 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  35.58 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  35.77 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  36.54 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0293  NADPH-dependent FMN reductase  36.19 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000996855  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  36.59 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0158  NADPH-dependent FMN reductase  33.94 
 
 		 206 aa  72  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1442  NADPH-dependent FMN reductase  34.62 
 
 		 217 aa  72  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1467  NADPH-dependent FMN reductase  26.19 
 
 		 216 aa  71.2  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0301  NADPH-dependent FMN reductase  33.94 
 
 		 211 aa  71.2  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.354287  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0284  NADPH-dependent FMN reductase  33.94 
 
 		 211 aa  71.2  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  34.62 
 
 		 212 aa  71.2  0.000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1320  NADPH-dependent FMN reductase  30.4 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.654727  normal  0.0975932 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2612  iron-sulfur flavoprotein  32.5 
 
 		 246 aa  71.2  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  34.62 
 
 		 217 aa  71.2  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  27.07 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  35.58 
 
 		 214 aa  70.9  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18210  NADPH-dependent FMN reductase  29.91 
 
 		 177 aa  70.5  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  36.19 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  35.77 
 
 		 193 aa  70.9  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2997  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 		 184 aa  70.9  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0315889  normal  0.693807 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2463  hypothetical protein  37.93 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000389494  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1178  NADPH-dependent FMN reductase  36.61 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0727  NADPH-dependent FMN reductase  30.85 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0487  NADPH-dependent FMN reductase  35.14 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.671634  normal  0.453927 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0017  NADPH-dependent FMN reductase  35.2 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1676  hypothetical protein  35.51 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  hitchhiker  0.000000298375 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  36.79 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1988  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  37.5 
 
 		 321 aa  69.3  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0292793  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2580  iron-sulfur flavoprotein  34.62 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29861  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2213  NADPH-dependent FMN reductase  34.29 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1959  NADPH-dependent FMN reductase  29.71 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.783003  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1441  NADPH-dependent FMN reductase  31.82 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  31.79 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0521  NADPH-dependent FMN reductase  32.69 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  35.58 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2272  NADPH-dependent FMN reductase  38.46 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2097  NADPH-dependent FMN reductase  32.73 
 
 		 236 aa  68.2  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1371  NADPH-dependent FMN reductase  31.19 
 
 		 190 aa  67.8  0.00000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1182  NADPH-dependent FMN reductase  31.82 
 
 		 190 aa  67.8  0.00000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000238882  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  34.92 
 
 		 205 aa  67.8  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1381  NADPH-dependent FMN reductase  32.69 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196943  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1498  NADPH-dependent FMN reductase  36.54 
 
 		 185 aa  67  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2979  NADPH-dependent FMN reductase  34.91 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.670971 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  34.16 
 
 		 211 aa  67  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1508  NADPH-dependent FMN reductase  34.23 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.25275  decreased coverage  0.00823646 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1507  NADPH-dependent FMN reductase  34.65 
 
 		 194 aa  67  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.569037  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1241  NADPH-dependent FMN reductase  38.46 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0632  NADPH-dependent FMN reductase  35.34 
 
 		 201 aa  67  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0179  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  29.48 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2817  NADPH-dependent FMN reductase  35.45 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0413  NADPH-dependent FMN reductase  31.29 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.72676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  28.32 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2535  NADPH-dependent FMN reductase  31.13 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.437841 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0133  NADPH-dependent FMN reductase  30.97 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000492716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0163  NADPH-dependent FMN reductase  34.91 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1505  NADPH-dependent FMN reductase  32.87 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0671  NADPH-dependent FMN reductase  35.24 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.610211 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1125  NADPH-dependent FMN reductase  31.73 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000715162  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2732  NADPH-dependent FMN reductase  30.97 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3707  NADPH-dependent FMN reductase  30.72 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0930977 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1188  NADPH-dependent FMN reductase  29.09 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.646638 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  41.51 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0755  NADPH-dependent FMN reductase  35.11 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.263848  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1442  NADPH-dependent FMN reductase  30.67 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.103462  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0421  NADPH-dependent FMN reductase  32.87 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0374  NADPH-dependent FMN reductase  33.64 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.4772 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1152  NADPH-dependent FMN reductase  30.28 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000059068  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1620  NADPH-dependent FMN reductase  35.58 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.199489 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>