259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3141 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3141  iron-sulfur flavoprotein  100 
 
 
178 aa  370  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.087899  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0784  NADPH-dependent FMN reductase  51.96 
 
 
179 aa  191  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1619  NADPH-dependent FMN reductase  49.43 
 
 
179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0275  NADPH-dependent FMN reductase  50 
 
 
178 aa  177  1e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1320  NADPH-dependent FMN reductase  42.78 
 
 
179 aa  150  5.9999999999999996e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.654727  normal  0.0975932 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1188  NADPH-dependent FMN reductase  39.24 
 
 
180 aa  111  7.000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.646638 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3468  multimeric flavodoxin WrbA family protein  42.15 
 
 
183 aa  102  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.177131  decreased coverage  0.000563166 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1498  NADPH-dependent FMN reductase  43.64 
 
 
185 aa  91.3  7e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0677  iron-sulfur flavoprotein  40.87 
 
 
250 aa  90.9  8e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18210  NADPH-dependent FMN reductase  31.03 
 
 
177 aa  89.7  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1130  NADPH-dependent FMN reductase  39.13 
 
 
182 aa  89.7  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1102  iron-sulfur flavoprotein  38.71 
 
 
182 aa  86.3  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000321891  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1676  hypothetical protein  40.4 
 
 
200 aa  86.3  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  hitchhiker  0.000000298375 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1131  hypothetical protein  30.51 
 
 
179 aa  84.7  6e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0076  NADPH-dependent FMN reductase  40.2 
 
 
202 aa  82.4  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.399945  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0158  NADPH-dependent FMN reductase  42.16 
 
 
206 aa  82  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0672  NADPH-dependent FMN reductase  38.53 
 
 
263 aa  81.6  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.594291 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2612  iron-sulfur flavoprotein  39.42 
 
 
246 aa  81.3  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  38.78 
 
 
186 aa  81.3  0.000000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2849  NADPH-dependent FMN reductase  40.78 
 
 
192 aa  81.3  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00930  NADPH-dependent FMN reductase  40.4 
 
 
173 aa  80.5  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407777  normal  0.42644 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0130  NADPH-dependent FMN reductase  36.15 
 
 
224 aa  80.5  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  37.76 
 
 
185 aa  79.3  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  36.27 
 
 
182 aa  79  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0954  NADPH-dependent FMN reductase  35.1 
 
 
184 aa  78.6  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0671  NADPH-dependent FMN reductase  39.6 
 
 
239 aa  78.2  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.610211 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2817  NADPH-dependent FMN reductase  37.86 
 
 
194 aa  77.8  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2732  NADPH-dependent FMN reductase  34.62 
 
 
209 aa  77.8  0.00000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  36.61 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3305  iron-sulfur flavoprotein  39 
 
 
222 aa  75.9  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.328284  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2521  NADPH-dependent FMN reductase  30.48 
 
 
230 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0133  NADPH-dependent FMN reductase  38.61 
 
 
191 aa  75.5  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000492716  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  35.24 
 
 
186 aa  75.1  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0727  NADPH-dependent FMN reductase  42.57 
 
 
204 aa  74.7  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1677  EIF-4a family ATP-dependent RNA helicase  41.12 
 
 
195 aa  74.7  0.0000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.42151  hitchhiker  0.000000240044 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  36.73 
 
 
187 aa  73.9  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3308  NADPH-dependent FMN reductase  33.59 
 
 
311 aa  73.6  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000769762  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  35.24 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  34.82 
 
 
214 aa  72  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0166  NADPH-dependent FMN reductase  29.74 
 
 
196 aa  71.2  0.000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  37.96 
 
 
220 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  32.54 
 
 
186 aa  70.5  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3622  NADPH-dependent FMN reductase  36.73 
 
 
191 aa  70.5  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1046  hypothetical protein  39.39 
 
 
187 aa  70.5  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.882215 
 
 
-
 
NC_002936  DET1371  NADPH-dependent FMN reductase  27.44 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0018  NADPH-dependent FMN reductase  33.01 
 
 
228 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2261  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  0.127615 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0857  NADPH-dependent FMN reductase  35.54 
 
 
262 aa  70.1  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3773  NADPH-dependent FMN reductase  37.04 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.65168  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1988  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  39.62 
 
 
321 aa  69.3  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0292793  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0408  NADPH-dependent FMN reductase  38 
 
 
225 aa  69.3  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0333  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.61 
 
 
222 aa  68.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.977725  normal  0.107763 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  33.65 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1072  NADPH-dependent FMN reductase  34.95 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1152  NADPH-dependent FMN reductase  26.22 
 
 
190 aa  68.6  0.00000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000059068  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  33.64 
 
 
217 aa  68.6  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1029  NADPH-dependent FMN reductase  39 
 
 
222 aa  68.6  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.153649  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1182  NADPH-dependent FMN reductase  24.46 
 
 
190 aa  68.2  0.00000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000238882  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2272  NADPH-dependent FMN reductase  33.03 
 
 
197 aa  68.2  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0309  NADPH-dependent FMN reductase  33.67 
 
 
212 aa  68.2  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  35 
 
 
221 aa  67.8  0.00000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  30.77 
 
 
193 aa  67.8  0.00000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  35 
 
 
223 aa  67.4  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
193 aa  67.4  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0159  NADPH-dependent FMN reductase  34.31 
 
 
203 aa  67  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0077  NADPH-dependent FMN reductase  35.92 
 
 
208 aa  65.9  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2463  hypothetical protein  37.14 
 
 
202 aa  65.9  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000389494  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0163  NADPH-dependent FMN reductase  36.27 
 
 
195 aa  65.9  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2629  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.52 
 
 
344 aa  65.9  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  37.25 
 
 
193 aa  65.9  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0632  NADPH-dependent FMN reductase  35.19 
 
 
201 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3523  NADPH-dependent FMN reductase  32.41 
 
 
218 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1815  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  38.38 
 
 
224 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0303  NADPH-dependent FMN reductase  34.31 
 
 
199 aa  65.5  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0893  NADPH-dependent FMN reductase  34 
 
 
200 aa  65.5  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2097  NADPH-dependent FMN reductase  35.09 
 
 
236 aa  65.5  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2482  NADPH-dependent FMN reductase  36 
 
 
222 aa  65.1  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.801364  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  34.62 
 
 
194 aa  65.1  0.0000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1584  NADPH-dependent FMN reductase  36 
 
 
220 aa  65.1  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18130  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 
172 aa  65.1  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.340395  normal  0.960689 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  37.25 
 
 
193 aa  64.7  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  31.78 
 
 
217 aa  65.1  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1492  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.69 
 
 
540 aa  64.7  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 
204 aa  64.3  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2580  iron-sulfur flavoprotein  27.97 
 
 
222 aa  63.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29861  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2991  NADPH-dependent FMN reductase  33.96 
 
 
185 aa  63.9  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1266  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.28 
 
 
562 aa  63.5  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1442  NADPH-dependent FMN reductase  30.84 
 
 
217 aa  63.2  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0374  NADPH-dependent FMN reductase  31.73 
 
 
188 aa  63.2  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.4772 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1851  NADPH-dependent FMN reductase  37.86 
 
 
204 aa  63.2  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0492811  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1381  NADPH-dependent FMN reductase  29.66 
 
 
216 aa  63.2  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196943  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0521  NADPH-dependent FMN reductase  28.26 
 
 
217 aa  63.2  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  28.71 
 
 
191 aa  62.8  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  33.88 
 
 
212 aa  62.4  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0308  NADPH-dependent FMN reductase  33.98 
 
 
204 aa  62  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.471384 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  30.3 
 
 
205 aa  62  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  36.73 
 
 
211 aa  62  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1508  NADPH-dependent FMN reductase  30.83 
 
 
216 aa  61.6  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.25275  decreased coverage  0.00823646 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0468  NADPH-dependent FMN reductase  32.11 
 
 
205 aa  62  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0704146  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1467  NADPH-dependent FMN reductase  32.41 
 
 
216 aa  61.6  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>