256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0076 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0076  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
202 aa  421  1e-117  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.399945  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0158  NADPH-dependent FMN reductase  64.1 
 
 
206 aa  278  3e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0309  NADPH-dependent FMN reductase  55.67 
 
 
212 aa  230  1e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1676  hypothetical protein  50 
 
 
200 aa  229  2e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  hitchhiker  0.000000298375 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2732  NADPH-dependent FMN reductase  53.93 
 
 
209 aa  220  9.999999999999999e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0159  NADPH-dependent FMN reductase  40.89 
 
 
203 aa  173  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0308  NADPH-dependent FMN reductase  42.05 
 
 
204 aa  165  4e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.471384 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0077  NADPH-dependent FMN reductase  39.5 
 
 
208 aa  160  8.000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2733  NADPH-dependent FMN reductase  39.39 
 
 
204 aa  158  6e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2817  NADPH-dependent FMN reductase  40.43 
 
 
194 aa  155  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2120  NADPH-dependent FMN reductase  37.04 
 
 
208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0276138  normal  0.10387 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1392  NADPH-dependent FMN reductase  37.57 
 
 
201 aa  143  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1677  EIF-4a family ATP-dependent RNA helicase  39.47 
 
 
195 aa  142  3e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.42151  hitchhiker  0.000000240044 
 
 
-
 
NC_002936  DET1371  NADPH-dependent FMN reductase  38.62 
 
 
190 aa  140  9e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0303  NADPH-dependent FMN reductase  35.35 
 
 
199 aa  139  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1152  NADPH-dependent FMN reductase  37.04 
 
 
190 aa  137  1e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000059068  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1182  NADPH-dependent FMN reductase  36.51 
 
 
190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000238882  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2849  NADPH-dependent FMN reductase  33.69 
 
 
192 aa  118  7e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0166  NADPH-dependent FMN reductase  34.52 
 
 
196 aa  114  7.999999999999999e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0120  hypothetical protein  31 
 
 
200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1498  NADPH-dependent FMN reductase  35.6 
 
 
185 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0080  NADPH-dependent FMN reductase  31.5 
 
 
201 aa  111  9e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2738  NADPH-dependent FMN reductase  29.79 
 
 
199 aa  105  6e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  30.53 
 
 
186 aa  100  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1149  NADPH-dependent FMN reductase  42.42 
 
 
208 aa  95.5  4e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.285301  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  42.42 
 
 
210 aa  94.7  8e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1988  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.16 
 
 
321 aa  93.2  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0292793  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1619  NADPH-dependent FMN reductase  35.22 
 
 
179 aa  93.6  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  45.19 
 
 
220 aa  93.2  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1815  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  45.1 
 
 
224 aa  92  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  30.93 
 
 
183 aa  92  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1241  NADPH-dependent FMN reductase  32.14 
 
 
189 aa  90.5  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  35.14 
 
 
187 aa  90.5  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3773  NADPH-dependent FMN reductase  43.27 
 
 
220 aa  90.5  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.65168  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1131  hypothetical protein  32.8 
 
 
179 aa  90.5  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2330  NADPH-dependent FMN reductase  31.28 
 
 
224 aa  89.7  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  0.0193614 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 
193 aa  89  4e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  37.96 
 
 
185 aa  88.6  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0374  NADPH-dependent FMN reductase  30.53 
 
 
188 aa  89  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.4772 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  37.72 
 
 
193 aa  88.6  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 
193 aa  88.6  6e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  41 
 
 
211 aa  87.8  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  39.05 
 
 
194 aa  87.4  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  26.46 
 
 
182 aa  87.8  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0125  NADPH-dependent FMN reductase  31.77 
 
 
190 aa  87.4  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  38.61 
 
 
193 aa  87.4  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18210  NADPH-dependent FMN reductase  35.97 
 
 
177 aa  87  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0988  NADPH-dependent FMN reductase  30.95 
 
 
294 aa  87.4  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.327411  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1320  NADPH-dependent FMN reductase  39.22 
 
 
179 aa  86.7  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.654727  normal  0.0975932 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2213  NADPH-dependent FMN reductase  31.85 
 
 
189 aa  87  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0671  NADPH-dependent FMN reductase  38.13 
 
 
239 aa  87  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.610211 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0018  NADPH-dependent FMN reductase  31.16 
 
 
228 aa  87  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  40.4 
 
 
212 aa  86.7  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1381  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
216 aa  86.3  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196943  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  32.67 
 
 
186 aa  85.9  4e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3622  NADPH-dependent FMN reductase  32.91 
 
 
191 aa  85.9  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  38.83 
 
 
193 aa  85.9  4e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1486  NADPH-dependent FMN reductase  34.85 
 
 
200 aa  84  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  29.19 
 
 
214 aa  84  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  30.81 
 
 
214 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0784  NADPH-dependent FMN reductase  29.95 
 
 
179 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  32 
 
 
186 aa  83.2  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2272  NADPH-dependent FMN reductase  29.74 
 
 
197 aa  82.8  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0275  NADPH-dependent FMN reductase  30.81 
 
 
178 aa  82.4  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0772  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  28.8 
 
 
193 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.806618  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3141  iron-sulfur flavoprotein  40.2 
 
 
178 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.087899  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  32 
 
 
186 aa  82.4  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2997  NADPH-dependent FMN reductase  24.74 
 
 
184 aa  81.6  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0315889  normal  0.693807 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0413  NADPH-dependent FMN reductase  29.53 
 
 
182 aa  81.6  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.72676  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3468  multimeric flavodoxin WrbA family protein  38.24 
 
 
183 aa  81.3  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.177131  decreased coverage  0.000563166 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0748  iron-sulfur flavoprotein  29.89 
 
 
195 aa  80.9  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.203042 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0521  NADPH-dependent FMN reductase  26.6 
 
 
217 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00930  NADPH-dependent FMN reductase  36.17 
 
 
173 aa  80.9  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407777  normal  0.42644 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  29.41 
 
 
217 aa  80.9  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0441  iron-sulfur flavoprotein  41.84 
 
 
194 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0727  NADPH-dependent FMN reductase  38.46 
 
 
204 aa  79.7  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  39 
 
 
223 aa  79.7  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1467  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 
216 aa  79.7  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1188  NADPH-dependent FMN reductase  40.19 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.646638 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0133  NADPH-dependent FMN reductase  25.67 
 
 
191 aa  79.7  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000492716  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  36.11 
 
 
192 aa  79  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1029  NADPH-dependent FMN reductase  41 
 
 
222 aa  79  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.153649  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1638  NADPH-dependent FMN reductase  32.14 
 
 
187 aa  78.6  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0739804  normal  0.913531 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0954  NADPH-dependent FMN reductase  34.55 
 
 
184 aa  78.2  0.00000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3305  iron-sulfur flavoprotein  41 
 
 
222 aa  78.2  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.328284  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1125  NADPH-dependent FMN reductase  34.62 
 
 
217 aa  77.8  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000715162  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1072  NADPH-dependent FMN reductase  36.89 
 
 
212 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  24.49 
 
 
206 aa  77.8  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1508  NADPH-dependent FMN reductase  31.03 
 
 
216 aa  77.8  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.25275  decreased coverage  0.00823646 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1130  NADPH-dependent FMN reductase  38.53 
 
 
182 aa  77.4  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0130  NADPH-dependent FMN reductase  27.55 
 
 
224 aa  77.8  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0542  iron-sulfur flavoprotein, putative  28.42 
 
 
204 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.423785  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1285  NADPH-dependent FMN reductase  40.82 
 
 
197 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.497649  normal  0.389555 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0316  NADPH-dependent FMN reductase  36.54 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2991  NADPH-dependent FMN reductase  34.58 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1584  NADPH-dependent FMN reductase  28.87 
 
 
220 aa  75.9  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1442  NADPH-dependent FMN reductase  39 
 
 
224 aa  76.3  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.103462  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2580  iron-sulfur flavoprotein  33.33 
 
 
222 aa  75.9  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29861  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18130  NADPH-dependent FMN reductase  39.05 
 
 
172 aa  75.9  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.340395  normal  0.960689 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0938  NADPH-dependent FMN reductase  40.38 
 
 
220 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>