258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1815 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1815  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 		 224 aa  464  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  55 
 
 		 220 aa  275  4e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3773  NADPH-dependent FMN reductase  55.45 
 
 		 220 aa  275  5e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.65168  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0938  NADPH-dependent FMN reductase  56.36 
 
 		 220 aa  246  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1584  NADPH-dependent FMN reductase  43.18 
 
 		 220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1029  NADPH-dependent FMN reductase  41.44 
 
 		 222 aa  167  8e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.153649  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2482  NADPH-dependent FMN reductase  38.64 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.801364  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0408  NADPH-dependent FMN reductase  39.27 
 
 		 225 aa  164  8e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2261  NADPH-dependent FMN reductase  40.18 
 
 		 222 aa  164  9e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  0.127615 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  38.91 
 
 		 223 aa  163  3e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3305  iron-sulfur flavoprotein  38.39 
 
 		 222 aa  161  6e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.328284  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2330  NADPH-dependent FMN reductase  36.65 
 
 		 224 aa  161  9e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  0.0193614 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1626  NADPH-dependent FMN reductase  38.46 
 
 		 220 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.65491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  37.44 
 
 		 221 aa  135  4e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1442  NADPH-dependent FMN reductase  34.07 
 
 		 224 aa  131  6e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.103462  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  45.38 
 
 		 186 aa  105  7e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  43.7 
 
 		 186 aa  104  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  41.67 
 
 		 194 aa  97.4  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  41.67 
 
 		 193 aa  94.4  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  41.67 
 
 		 193 aa  94.4  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0309  NADPH-dependent FMN reductase  47 
 
 		 212 aa  94.7  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  41.67 
 
 		 193 aa  93.6  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0158  NADPH-dependent FMN reductase  47.06 
 
 		 206 aa  92.8  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  42.02 
 
 		 186 aa  92.4  4e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0076  NADPH-dependent FMN reductase  45.1 
 
 		 202 aa  92  7e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.399945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1498  NADPH-dependent FMN reductase  38.46 
 
 		 185 aa  91.7  8e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1392  NADPH-dependent FMN reductase  46.08 
 
 		 201 aa  91.3  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  39.5 
 
 		 183 aa  90.5  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1676  hypothetical protein  44.9 
 
 		 200 aa  89.7  3e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  hitchhiker  0.000000298375 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  38.17 
 
 		 185 aa  89  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2732  NADPH-dependent FMN reductase  41.18 
 
 		 209 aa  88.2  9e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  44.55 
 
 		 211 aa  88.2  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2817  NADPH-dependent FMN reductase  43.88 
 
 		 194 aa  88.2  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  36.84 
 
 		 187 aa  87.4  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0857  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 		 262 aa  87  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  43 
 
 		 193 aa  85.5  6e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 		 186 aa  85.1  8e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1677  EIF-4a family ATP-dependent RNA helicase  45.1 
 
 		 195 aa  85.1  9e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.42151  hitchhiker  0.000000240044 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2272  NADPH-dependent FMN reductase  44.55 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1149  NADPH-dependent FMN reductase  39 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.285301  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1619  NADPH-dependent FMN reductase  42 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  41 
 
 		 182 aa  82.4  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0671  NADPH-dependent FMN reductase  39.81 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.610211 
 
 
-
 
NC_002936  DET1371  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 		 190 aa  82  0.000000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1152  NADPH-dependent FMN reductase  36.54 
 
 		 190 aa  81.6  0.000000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000059068  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1182  NADPH-dependent FMN reductase  36.54 
 
 		 190 aa  81.6  0.000000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000238882  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18210  NADPH-dependent FMN reductase  38 
 
 		 177 aa  80.1  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  38 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0275  NADPH-dependent FMN reductase  39.8 
 
 		 178 aa  80.1  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0374  NADPH-dependent FMN reductase  30.81 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.4772 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  39.04 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2120  NADPH-dependent FMN reductase  42.42 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0276138  normal  0.10387 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0163  NADPH-dependent FMN reductase  46.94 
 
 		 195 aa  78.6  0.00000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2849  NADPH-dependent FMN reductase  38.46 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2997  NADPH-dependent FMN reductase  37.37 
 
 		 184 aa  78.2  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0315889  normal  0.693807 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1188  NADPH-dependent FMN reductase  39.6 
 
 		 180 aa  77  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.646638 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0130  NADPH-dependent FMN reductase  41.18 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0727  NADPH-dependent FMN reductase  28.5 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1851  NADPH-dependent FMN reductase  34.33 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0492811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0748  iron-sulfur flavoprotein  31.39 
 
 		 195 aa  76.3  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.203042 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  37.04 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0672  NADPH-dependent FMN reductase  36.84 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.594291 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  35.81 
 
 		 205 aa  74.7  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1543  NADPH-dependent FMN reductase  32.77 
 
 		 193 aa  74.7  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0882991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3707  NADPH-dependent FMN reductase  33.93 
 
 		 208 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0930977 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3016  iron-sulfur flavoprotein  40.23 
 
 		 93 aa  73.6  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.718636  normal  0.0259997 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1241  NADPH-dependent FMN reductase  41.18 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  39 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0316  NADPH-dependent FMN reductase  31.07 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  38 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2260  NADPH-dependent FMN reductase  32.89 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2991  NADPH-dependent FMN reductase  33.85 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0449  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.1 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.536624  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  38.1 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  36.49 
 
 		 204 aa  72  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  36.49 
 
 		 206 aa  72  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3308  NADPH-dependent FMN reductase  39.62 
 
 		 311 aa  71.6  0.000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000769762  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0159  NADPH-dependent FMN reductase  39 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1385  iron-sulfur flavoprotein  42.31 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1486  NADPH-dependent FMN reductase  43 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1638  NADPH-dependent FMN reductase  31.16 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0739804  normal  0.913531 
 
 
-
 
NC_002936  DET1244  NADPH-dependent FMN reductase  39.34 
 
 		 190 aa  71.6  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  39.05 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1043  NADPH-dependent FMN reductase  33.11 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.603654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  39.05 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0166  NADPH-dependent FMN reductase  37.37 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  41.75 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1170  FMN reductase, NADPH-dependent  33.78 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0486  NADPH-dependent FMN reductase  30.63 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.260904  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1125  NADPH-dependent FMN reductase  34.29 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000715162  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1442  NADPH-dependent FMN reductase  38.1 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  39.42 
 
 		 191 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0109  NADPH-dependent FMN reductase  39.81 
 
 		 191 aa  67.8  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0650  NADPH-dependent FMN reductase  41.18 
 
 		 190 aa  67  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2535  NADPH-dependent FMN reductase  39.81 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.437841 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0325  NADPH-dependent FMN reductase  41.11 
 
 		 188 aa  67  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0991  NADPH-dependent FMN reductase  39.81 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.451509  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0784  NADPH-dependent FMN reductase  35 
 
 		 179 aa  67  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1057  NADPH-dependent FMN reductase  36.89 
 
 		 190 aa  67  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.840292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>