243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0748 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0748  iron-sulfur flavoprotein  100 
 
 
195 aa  402  1e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.203042 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  44.44 
 
 
182 aa  167  8e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0374  NADPH-dependent FMN reductase  44.51 
 
 
188 aa  158  6e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.4772 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2997  NADPH-dependent FMN reductase  46.02 
 
 
184 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0315889  normal  0.693807 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1241  NADPH-dependent FMN reductase  42.37 
 
 
189 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  37.93 
 
 
185 aa  122  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  35.43 
 
 
186 aa  105  4e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0772  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  34.25 
 
 
193 aa  105  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.806618  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2213  NADPH-dependent FMN reductase  31.84 
 
 
189 aa  98.6  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0158  NADPH-dependent FMN reductase  34.05 
 
 
206 aa  97.4  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  34.34 
 
 
223 aa  95.9  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1498  NADPH-dependent FMN reductase  36.88 
 
 
185 aa  93.6  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1046  hypothetical protein  34.68 
 
 
187 aa  93.2  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.882215 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0893  NADPH-dependent FMN reductase  30.53 
 
 
200 aa  92.4  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3622  NADPH-dependent FMN reductase  35.57 
 
 
191 aa  92  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18210  NADPH-dependent FMN reductase  33.92 
 
 
177 aa  90.1  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0125  NADPH-dependent FMN reductase  36.94 
 
 
190 aa  89.4  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0954  NADPH-dependent FMN reductase  37.41 
 
 
184 aa  86.3  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2272  NADPH-dependent FMN reductase  40.8 
 
 
197 aa  86.7  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1486  NADPH-dependent FMN reductase  32.63 
 
 
200 aa  85.5  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  45.65 
 
 
193 aa  85.1  6e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1677  EIF-4a family ATP-dependent RNA helicase  31.87 
 
 
195 aa  85.1  6e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.42151  hitchhiker  0.000000240044 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2330  NADPH-dependent FMN reductase  34.05 
 
 
224 aa  85.1  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  0.0193614 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  45.65 
 
 
193 aa  84.3  9e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  45.65 
 
 
194 aa  83.6  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  32.37 
 
 
220 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  45.65 
 
 
193 aa  83.6  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00930  NADPH-dependent FMN reductase  31.98 
 
 
173 aa  82  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407777  normal  0.42644 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1676  hypothetical protein  28.89 
 
 
200 aa  82  0.000000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  hitchhiker  0.000000298375 
 
 
-
 
NC_002936  DET1371  NADPH-dependent FMN reductase  27.07 
 
 
190 aa  81.6  0.000000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2849  NADPH-dependent FMN reductase  39.05 
 
 
192 aa  81.3  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3773  NADPH-dependent FMN reductase  30.06 
 
 
220 aa  81.3  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.65168  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0076  NADPH-dependent FMN reductase  29.89 
 
 
202 aa  80.9  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.399945  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1467  NADPH-dependent FMN reductase  31.78 
 
 
216 aa  80.5  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  40.57 
 
 
206 aa  80.5  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2732  NADPH-dependent FMN reductase  30.89 
 
 
209 aa  80.5  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  42.39 
 
 
193 aa  80.1  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0727  NADPH-dependent FMN reductase  29.84 
 
 
204 aa  79.7  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1149  NADPH-dependent FMN reductase  39.05 
 
 
208 aa  79.3  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.285301  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0130  NADPH-dependent FMN reductase  30.81 
 
 
224 aa  79  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  39.18 
 
 
210 aa  79  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1182  NADPH-dependent FMN reductase  26.52 
 
 
190 aa  79  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000238882  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1152  NADPH-dependent FMN reductase  26.52 
 
 
190 aa  79  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000059068  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18130  NADPH-dependent FMN reductase  36.07 
 
 
172 aa  77.4  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.340395  normal  0.960689 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2580  iron-sulfur flavoprotein  39.18 
 
 
222 aa  77  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29861  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  41.84 
 
 
214 aa  77  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  37.76 
 
 
217 aa  77  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1442  NADPH-dependent FMN reductase  30.93 
 
 
224 aa  77  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.103462  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2521  NADPH-dependent FMN reductase  35.07 
 
 
230 aa  77  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  31.89 
 
 
221 aa  76.3  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1815  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  31.39 
 
 
224 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  40.21 
 
 
211 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1029  NADPH-dependent FMN reductase  41.49 
 
 
222 aa  75.9  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.153649  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2817  NADPH-dependent FMN reductase  38.54 
 
 
194 aa  75.1  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2120  NADPH-dependent FMN reductase  37 
 
 
208 aa  74.7  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0276138  normal  0.10387 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0671  NADPH-dependent FMN reductase  30.81 
 
 
239 aa  74.7  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.610211 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1381  NADPH-dependent FMN reductase  34.86 
 
 
216 aa  74.7  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196943  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3468  multimeric flavodoxin WrbA family protein  31.33 
 
 
183 aa  74.7  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.177131  decreased coverage  0.000563166 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  40.82 
 
 
214 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0521  NADPH-dependent FMN reductase  37.76 
 
 
217 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1072  NADPH-dependent FMN reductase  38.05 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1131  hypothetical protein  32.48 
 
 
179 aa  73.2  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3523  NADPH-dependent FMN reductase  35.71 
 
 
218 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1442  NADPH-dependent FMN reductase  36.73 
 
 
217 aa  72  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1285  NADPH-dependent FMN reductase  31.02 
 
 
197 aa  72  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.497649  normal  0.389555 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1623  hypothetical protein  29.38 
 
 
194 aa  71.6  0.000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  36.73 
 
 
217 aa  71.6  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
187 aa  71.2  0.000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1125  NADPH-dependent FMN reductase  34.69 
 
 
217 aa  70.9  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000715162  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0018  NADPH-dependent FMN reductase  36.73 
 
 
228 aa  70.9  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0309  NADPH-dependent FMN reductase  27.32 
 
 
212 aa  70.9  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  37.14 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0133  NADPH-dependent FMN reductase  35.58 
 
 
191 aa  69.7  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000492716  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1392  NADPH-dependent FMN reductase  26.88 
 
 
201 aa  70.1  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  35.92 
 
 
192 aa  69.3  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  35.92 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0672  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
263 aa  69.3  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.594291 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1584  NADPH-dependent FMN reductase  40.23 
 
 
220 aa  68.2  0.00000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0080  NADPH-dependent FMN reductase  31.63 
 
 
201 aa  67  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  35.92 
 
 
186 aa  67.4  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2261  NADPH-dependent FMN reductase  40.7 
 
 
222 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  0.127615 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0408  NADPH-dependent FMN reductase  40.7 
 
 
225 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0163  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
195 aa  67  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  35.09 
 
 
183 aa  66.6  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0166  NADPH-dependent FMN reductase  31.96 
 
 
196 aa  66.2  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0938  NADPH-dependent FMN reductase  27.33 
 
 
220 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  34.26 
 
 
193 aa  66.2  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1441  NADPH-dependent FMN reductase  31.53 
 
 
192 aa  65.5  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3305  iron-sulfur flavoprotein  31.11 
 
 
222 aa  65.5  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.328284  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2097  NADPH-dependent FMN reductase  33.65 
 
 
236 aa  65.5  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0017  NADPH-dependent FMN reductase  39.8 
 
 
194 aa  65.5  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
191 aa  65.5  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2733  NADPH-dependent FMN reductase  30.67 
 
 
204 aa  65.1  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2925  NADPH-dependent FMN reductase  37.89 
 
 
193 aa  65.1  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000194359  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2463  hypothetical protein  33.07 
 
 
202 aa  65.1  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000389494  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1619  NADPH-dependent FMN reductase  32.06 
 
 
179 aa  65.1  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0441  iron-sulfur flavoprotein  35.92 
 
 
194 aa  64.3  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  34.74 
 
 
204 aa  64.3  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1507  NADPH-dependent FMN reductase  37.89 
 
 
194 aa  64.3  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.569037  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1043  NADPH-dependent FMN reductase  32.43 
 
 
192 aa  63.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.603654  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>