236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1677 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1677  EIF-4a family ATP-dependent RNA helicase  100 
 
 
195 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.42151  hitchhiker  0.000000240044 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0308  NADPH-dependent FMN reductase  42.29 
 
 
204 aa  159  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.471384 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0159  NADPH-dependent FMN reductase  39.2 
 
 
203 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2733  NADPH-dependent FMN reductase  43.09 
 
 
204 aa  150  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0158  NADPH-dependent FMN reductase  38.58 
 
 
206 aa  150  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0076  NADPH-dependent FMN reductase  39.47 
 
 
202 aa  142  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.399945  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0077  NADPH-dependent FMN reductase  37.76 
 
 
208 aa  141  6e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1392  NADPH-dependent FMN reductase  38.95 
 
 
201 aa  132  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0309  NADPH-dependent FMN reductase  33.85 
 
 
212 aa  124  8.000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1676  hypothetical protein  34.02 
 
 
200 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  hitchhiker  0.000000298375 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2732  NADPH-dependent FMN reductase  38.82 
 
 
209 aa  115  5e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2817  NADPH-dependent FMN reductase  32.16 
 
 
194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2120  NADPH-dependent FMN reductase  32.29 
 
 
208 aa  112  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0276138  normal  0.10387 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1152  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 
190 aa  104  7e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000059068  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1371  NADPH-dependent FMN reductase  29.47 
 
 
190 aa  104  8e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1182  NADPH-dependent FMN reductase  30.53 
 
 
190 aa  103  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000238882  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0303  NADPH-dependent FMN reductase  29.8 
 
 
199 aa  98.6  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2849  NADPH-dependent FMN reductase  30.57 
 
 
192 aa  94.4  9e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1498  NADPH-dependent FMN reductase  33.51 
 
 
185 aa  94.4  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0133  NADPH-dependent FMN reductase  29.65 
 
 
191 aa  93.2  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000492716  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1988  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  37.16 
 
 
321 aa  90.5  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0292793  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  29.69 
 
 
186 aa  88.2  7e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1619  NADPH-dependent FMN reductase  42.16 
 
 
179 aa  85.1  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0748  iron-sulfur flavoprotein  31.87 
 
 
195 aa  85.1  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.203042 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1815  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  45.1 
 
 
224 aa  85.1  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  28.8 
 
 
185 aa  83.6  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0166  NADPH-dependent FMN reductase  30.46 
 
 
196 aa  83.2  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1149  NADPH-dependent FMN reductase  30.35 
 
 
208 aa  82  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.285301  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  29.7 
 
 
210 aa  81.3  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  31.05 
 
 
186 aa  80.5  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  30.05 
 
 
186 aa  79.3  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2381  NADPH-dependent FMN reductase  29.38 
 
 
195 aa  79  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.19679e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3700  NADPH-dependent FMN reductase  30.63 
 
 
167 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.438401  normal  0.207291 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2330  NADPH-dependent FMN reductase  42 
 
 
224 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  0.0193614 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1638  NADPH-dependent FMN reductase  32.73 
 
 
187 aa  76.6  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0739804  normal  0.913531 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0080  NADPH-dependent FMN reductase  27.84 
 
 
201 aa  76.3  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0954  NADPH-dependent FMN reductase  28.04 
 
 
184 aa  75.5  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  38.1 
 
 
194 aa  75.5  0.0000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  38.61 
 
 
193 aa  75.1  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  38.61 
 
 
193 aa  74.7  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3141  iron-sulfur flavoprotein  41.12 
 
 
178 aa  74.7  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.087899  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  38.61 
 
 
193 aa  74.7  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0671  NADPH-dependent FMN reductase  43.14 
 
 
239 aa  74.3  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.610211 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  35 
 
 
183 aa  74.3  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  33.09 
 
 
220 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  31.12 
 
 
204 aa  73.2  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  29.23 
 
 
186 aa  73.6  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1241  NADPH-dependent FMN reductase  30.82 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
182 aa  72.4  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3773  NADPH-dependent FMN reductase  31.65 
 
 
220 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.65168  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  30.71 
 
 
187 aa  72  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  28.1 
 
 
208 aa  71.6  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2991  NADPH-dependent FMN reductase  32.35 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  26.29 
 
 
211 aa  70.9  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0784  NADPH-dependent FMN reductase  29.02 
 
 
179 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0275  NADPH-dependent FMN reductase  38.61 
 
 
178 aa  70.9  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  33.33 
 
 
193 aa  70.5  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3414  NADPH-dependent FMN reductase  30.41 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  32.84 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0772  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  28.75 
 
 
193 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.806618  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1058  NADPH-dependent FMN reductase  41.9 
 
 
192 aa  68.9  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  32.56 
 
 
205 aa  68.9  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0727  NADPH-dependent FMN reductase  34.95 
 
 
204 aa  68.2  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0672  NADPH-dependent FMN reductase  34.27 
 
 
263 aa  68.2  0.00000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.594291 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2738  NADPH-dependent FMN reductase  25.63 
 
 
199 aa  67  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1584  NADPH-dependent FMN reductase  38.24 
 
 
220 aa  66.6  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1131  hypothetical protein  26.2 
 
 
179 aa  66.2  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2272  NADPH-dependent FMN reductase  38.1 
 
 
197 aa  66.2  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1486  NADPH-dependent FMN reductase  31.43 
 
 
200 aa  67  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  29.49 
 
 
193 aa  66.2  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  30.1 
 
 
206 aa  65.5  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0938  NADPH-dependent FMN reductase  27.69 
 
 
220 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0374  NADPH-dependent FMN reductase  29.2 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.4772 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0413  NADPH-dependent FMN reductase  25.52 
 
 
182 aa  65.5  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.72676  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1320  NADPH-dependent FMN reductase  35.29 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.654727  normal  0.0975932 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  35.58 
 
 
221 aa  65.5  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2213  NADPH-dependent FMN reductase  28.67 
 
 
189 aa  65.5  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18210  NADPH-dependent FMN reductase  35.35 
 
 
177 aa  65.5  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1442  NADPH-dependent FMN reductase  37 
 
 
224 aa  65.5  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.103462  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  26.35 
 
 
206 aa  64.7  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2521  NADPH-dependent FMN reductase  34.31 
 
 
230 aa  64.7  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0755  NADPH-dependent FMN reductase  35.92 
 
 
213 aa  64.7  0.0000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.263848  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  38.24 
 
 
192 aa  64.3  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0785  iron-sulfur flavoprotein, putative  28.72 
 
 
207 aa  64.3  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0958732  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0869  NADPH-dependent FMN reductase  35.24 
 
 
206 aa  63.9  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00401648  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0486  NADPH-dependent FMN reductase  28.89 
 
 
197 aa  63.9  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.260904  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0988  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
294 aa  64.3  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.327411  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2260  NADPH-dependent FMN reductase  29.31 
 
 
270 aa  63.9  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3305  iron-sulfur flavoprotein  41.18 
 
 
222 aa  63.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.328284  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3468  multimeric flavodoxin WrbA family protein  34.31 
 
 
183 aa  63.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.177131  decreased coverage  0.000563166 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1072  NADPH-dependent FMN reductase  30.92 
 
 
212 aa  63.2  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2856  NADPH-dependent FMN reductase  25.64 
 
 
210 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1029  NADPH-dependent FMN reductase  37.17 
 
 
222 aa  63.5  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.153649  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1102  iron-sulfur flavoprotein  29.94 
 
 
182 aa  62.8  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000321891  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0909  NADPH-dependent FMN reductase  34.29 
 
 
206 aa  62.8  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0780942  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0857  NADPH-dependent FMN reductase  33.59 
 
 
262 aa  62.4  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2997  NADPH-dependent FMN reductase  31.96 
 
 
184 aa  62  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0315889  normal  0.693807 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0163  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 
195 aa  62  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  34.78 
 
 
223 aa  62  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3622  NADPH-dependent FMN reductase  37.14 
 
 
191 aa  62.4  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.292337 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>