229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2260 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2260  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 		 270 aa  556  1e-157  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0857  NADPH-dependent FMN reductase  50.38 
 
 		 262 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1645  hypothetical protein  58.21 
 
 		 83 aa  92  9e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1736  hypothetical protein  30.65 
 
 		 234 aa  87.4  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.583846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0192  NADPH-dependent FMN reductase  26.92 
 
 		 231 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1746  hypothetical protein  30.08 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  29.83 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3773  NADPH-dependent FMN reductase  32.05 
 
 		 220 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.65168  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1815  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  31.69 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1188  NADPH-dependent FMN reductase  32.56 
 
 		 180 aa  77.8  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.646638 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1737  hypothetical protein  29.03 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1108  NADPH-dependent FMN reductase  34.21 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  29.8 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1029  NADPH-dependent FMN reductase  32.64 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.153649  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2330  NADPH-dependent FMN reductase  25.22 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  0.0193614 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0408  NADPH-dependent FMN reductase  29.17 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2482  NADPH-dependent FMN reductase  28.72 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.801364  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  35.04 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2997  NADPH-dependent FMN reductase  30.92 
 
 		 184 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0315889  normal  0.693807 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1130  NADPH-dependent FMN reductase  38.32 
 
 		 182 aa  71.2  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3305  iron-sulfur flavoprotein  31.37 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.328284  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1442  NADPH-dependent FMN reductase  30.87 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.103462  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1865  NADPH-dependent FMN reductase  23.28 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.599587  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1677  EIF-4a family ATP-dependent RNA helicase  29.89 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.42151  hitchhiker  0.000000240044 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  31.78 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2377  NADPH-dependent FMN reductase  39.67 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000848109  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1043  NADPH-dependent FMN reductase  31.1 
 
 		 192 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.603654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  35 
 
 		 192 aa  68.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2991  NADPH-dependent FMN reductase  32.64 
 
 		 185 aa  68.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  30.46 
 
 		 186 aa  68.6  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1102  iron-sulfur flavoprotein  35.51 
 
 		 182 aa  68.6  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000321891  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1626  NADPH-dependent FMN reductase  26.49 
 
 		 220 aa  68.2  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.65491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2261  NADPH-dependent FMN reductase  29.03 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  0.127615 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1178  NADPH-dependent FMN reductase  34.96 
 
 		 223 aa  67  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1498  NADPH-dependent FMN reductase  32.69 
 
 		 185 aa  67  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1959  NADPH-dependent FMN reductase  33.57 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.783003  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0316  NADPH-dependent FMN reductase  32.77 
 
 		 212 aa  65.1  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  27.51 
 
 		 183 aa  65.5  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1149  NADPH-dependent FMN reductase  36.27 
 
 		 208 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.285301  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  35.19 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0076  NADPH-dependent FMN reductase  31.11 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.399945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0869  NADPH-dependent FMN reductase  31.51 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00401648  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  30.57 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  35.29 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3676  NADPH-dependent FMN reductase  32.56 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0727  NADPH-dependent FMN reductase  34.31 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0909  NADPH-dependent FMN reductase  30.82 
 
 		 206 aa  61.6  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0780942  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1241  NADPH-dependent FMN reductase  29.53 
 
 		 189 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  35.92 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0650  NADPH-dependent FMN reductase  32.77 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2659  NADPH-dependent FMN reductase  33.1 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.385785 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  35.29 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0722  NADPH-dependent FMN reductase  33.05 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.658969  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0293  NADPH-dependent FMN reductase  29.71 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000996855  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1046  hypothetical protein  33.63 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.882215 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1492  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 		 540 aa  60.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0158  NADPH-dependent FMN reductase  28.75 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  32.35 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0938  NADPH-dependent FMN reductase  31.19 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0988  NADPH-dependent FMN reductase  27.48 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.327411  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1441  NADPH-dependent FMN reductase  26.32 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2381  NADPH-dependent FMN reductase  36.89 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.19679e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1584  NADPH-dependent FMN reductase  25.26 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0275  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1264  NADPH-dependent FMN reductase  31.36 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.246056  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  33.94 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1320  NADPH-dependent FMN reductase  38.61 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.654727  normal  0.0975932 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  36.89 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1770  NADPH-dependent FMN reductase  32.71 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000383709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0630  NADPH-dependent FMN reductase  32 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0301  NADPH-dependent FMN reductase  30.22 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.354287  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0671  NADPH-dependent FMN reductase  34.95 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.610211 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 		 194 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0486  NADPH-dependent FMN reductase  31.54 
 
 		 197 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.260904  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0284  NADPH-dependent FMN reductase  30.84 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  36.27 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0133  NADPH-dependent FMN reductase  25 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000492716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1676  hypothetical protein  31.36 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  hitchhiker  0.000000298375 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1523  NADPH-dependent FMN reductase  31.71 
 
 		 284 aa  57  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0017  NADPH-dependent FMN reductase  34.91 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0755  NADPH-dependent FMN reductase  34.88 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.263848  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2213  NADPH-dependent FMN reductase  33.04 
 
 		 189 aa  57  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  35.92 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  29.05 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1266  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.97 
 
 		 562 aa  57  0.0000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2580  iron-sulfur flavoprotein  33.64 
 
 		 222 aa  57  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29861  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2535  NADPH-dependent FMN reductase  33.64 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.437841 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0677  iron-sulfur flavoprotein  37.14 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3141  iron-sulfur flavoprotein  43.84 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.087899  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2732  NADPH-dependent FMN reductase  26.52 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  33.96 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1637  NADPH-dependent FMN reductase  30.22 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0800599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0252  iron-sulfur flavoprotein  35.54 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.488898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1851  NADPH-dependent FMN reductase  30.43 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0492811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1623  hypothetical protein  31.78 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1131  hypothetical protein  33.06 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0784  NADPH-dependent FMN reductase  29.01 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>