221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1492 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1492  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 		 540 aa  1117    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1266  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  55.46 
 
 		 562 aa  663    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2629  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.97 
 
 		 344 aa  287  2.9999999999999996e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0671  NADPH-dependent FMN reductase  31.22 
 
 		 239 aa  127  6e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.610211 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0130  NADPH-dependent FMN reductase  33.82 
 
 		 224 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0677  iron-sulfur flavoprotein  31.65 
 
 		 250 aa  115  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2612  iron-sulfur flavoprotein  28.82 
 
 		 246 aa  108  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0672  NADPH-dependent FMN reductase  29.31 
 
 		 263 aa  92.8  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.594291 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  34.31 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1029  NADPH-dependent FMN reductase  38.24 
 
 		 222 aa  72.4  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.153649  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2261  NADPH-dependent FMN reductase  38.24 
 
 		 222 aa  71.6  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  0.127615 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0408  NADPH-dependent FMN reductase  37.25 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  33.98 
 
 		 208 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0780  Multimeric flavodoxin WrbA-like protein  33 
 
 		 181 aa  68.9  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.706677  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1584  NADPH-dependent FMN reductase  38.24 
 
 		 220 aa  68.6  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1131  hypothetical protein  35.35 
 
 		 179 aa  68.2  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2659  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.385785 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  27.33 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3468  multimeric flavodoxin WrbA family protein  37 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.177131  decreased coverage  0.000563166 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18130  NADPH-dependent FMN reductase  28.46 
 
 		 172 aa  67.4  0.0000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.340395  normal  0.960689 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1188  NADPH-dependent FMN reductase  33.98 
 
 		 180 aa  67.4  0.0000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.646638 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1044  hypothetical protein  29.92 
 
 		 170 aa  67  0.0000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0759  NADPH-dependent FMN reductase  30.71 
 
 		 436 aa  66.6  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0857  NADPH-dependent FMN reductase  35.92 
 
 		 262 aa  66.2  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0045  NADPH-dependent FMN reductase  32.28 
 
 		 431 aa  66.6  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.299294  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0727  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 		 204 aa  66.6  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3305  iron-sulfur flavoprotein  34.31 
 
 		 222 aa  65.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.328284  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18210  NADPH-dependent FMN reductase  35.29 
 
 		 177 aa  65.9  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  30.65 
 
 		 193 aa  65.1  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  39.29 
 
 		 193 aa  65.1  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0133  NADPH-dependent FMN reductase  26.67 
 
 		 191 aa  64.7  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000492716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  41.35 
 
 		 193 aa  64.7  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3141  iron-sulfur flavoprotein  32.69 
 
 		 178 aa  64.7  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.087899  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  39.29 
 
 		 193 aa  64.7  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0772  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  27.14 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.806618  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00930  NADPH-dependent FMN reductase  30.77 
 
 		 173 aa  63.9  0.000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407777  normal  0.42644 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2482  NADPH-dependent FMN reductase  34.31 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.801364  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0062  NADPH-dependent FMN reductase  28.35 
 
 		 435 aa  63.5  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  33.98 
 
 		 186 aa  63.5  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0076  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 202 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.399945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2213  NADPH-dependent FMN reductase  29.41 
 
 		 189 aa  63.2  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0017  NADPH-dependent FMN reductase  32.67 
 
 		 194 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0486  NADPH-dependent FMN reductase  34.17 
 
 		 197 aa  62  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.260904  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3622  NADPH-dependent FMN reductase  31.58 
 
 		 191 aa  62.8  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1736  hypothetical protein  35.64 
 
 		 234 aa  62.4  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.583846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0321  NADPH-dependent FMN reductase  35.64 
 
 		 197 aa  62  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.378386  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  32.35 
 
 		 186 aa  62.4  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13637  Multimeric flavodoxin WrbA  29.37 
 
 		 191 aa  61.6  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1676  hypothetical protein  37.62 
 
 		 200 aa  62  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  hitchhiker  0.000000298375 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2580  iron-sulfur flavoprotein  31.3 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29861  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0938  NADPH-dependent FMN reductase  35.64 
 
 		 220 aa  61.6  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0784  NADPH-dependent FMN reductase  29.7 
 
 		 179 aa  61.2  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1130  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  32.35 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  35.58 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  32.71 
 
 		 214 aa  59.7  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  32.73 
 
 		 194 aa  60.1  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0722  NADPH-dependent FMN reductase  32.04 
 
 		 211 aa  59.7  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.658969  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  37.25 
 
 		 212 aa  59.7  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1737  hypothetical protein  35.64 
 
 		 234 aa  60.1  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  31.37 
 
 		 220 aa  59.3  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1815  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  36.27 
 
 		 224 aa  58.9  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2732  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 209 aa  58.9  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2991  NADPH-dependent FMN reductase  30.84 
 
 		 185 aa  58.9  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1487  NADPH-dependent FMN reductase  32.35 
 
 		 198 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.535714  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0158  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 206 aa  58.9  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0988  NADPH-dependent FMN reductase  25.34 
 
 		 294 aa  59.3  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.327411  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0521  NADPH-dependent FMN reductase  32.17 
 
 		 217 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1102  iron-sulfur flavoprotein  32.41 
 
 		 182 aa  58.9  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000321891  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1385  iron-sulfur flavoprotein  35.92 
 
 		 191 aa  58.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1498  NADPH-dependent FMN reductase  27.27 
 
 		 185 aa  58.5  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1320  NADPH-dependent FMN reductase  31.07 
 
 		 179 aa  58.9  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.654727  normal  0.0975932 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1241  NADPH-dependent FMN reductase  34.31 
 
 		 189 aa  58.5  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2330  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 224 aa  58.5  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  0.0193614 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0179  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  26.26 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1637  NADPH-dependent FMN reductase  31.37 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0800599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  33.94 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1619  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 		 179 aa  57.8  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3773  NADPH-dependent FMN reductase  30.39 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.65168  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1770  NADPH-dependent FMN reductase  36.54 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000383709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  29.57 
 
 		 217 aa  57  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  29.41 
 
 		 185 aa  57  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2733  NADPH-dependent FMN reductase  28.34 
 
 		 204 aa  57  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1746  hypothetical protein  33.66 
 
 		 234 aa  57  0.0000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0449  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.38 
 
 		 256 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.536624  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  31.78 
 
 		 214 aa  56.2  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1638  NADPH-dependent FMN reductase  27.39 
 
 		 187 aa  56.6  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0739804  normal  0.913531 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1523  NADPH-dependent FMN reductase  37.08 
 
 		 284 aa  56.2  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1851  NADPH-dependent FMN reductase  31.78 
 
 		 204 aa  56.2  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0492811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  31.48 
 
 		 217 aa  56.2  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1125  NADPH-dependent FMN reductase  29.91 
 
 		 217 aa  56.2  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000715162  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  30.1 
 
 		 204 aa  55.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0748  iron-sulfur flavoprotein  27.92 
 
 		 195 aa  55.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.203042 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0275  NADPH-dependent FMN reductase  31 
 
 		 178 aa  55.8  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0018  NADPH-dependent FMN reductase  27.84 
 
 		 228 aa  56.2  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2849  NADPH-dependent FMN reductase  32.54 
 
 		 192 aa  55.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3523  NADPH-dependent FMN reductase  28.95 
 
 		 218 aa  55.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2817  NADPH-dependent FMN reductase  34.65 
 
 		 194 aa  55.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1392  NADPH-dependent FMN reductase  33 
 
 		 201 aa  55.1  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.656565 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>