208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0449 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0449  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 		 256 aa  533  1e-150  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.536624  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2612  iron-sulfur flavoprotein  27.62 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00930  NADPH-dependent FMN reductase  39.09 
 
 		 173 aa  80.5  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407777  normal  0.42644 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0677  iron-sulfur flavoprotein  24.39 
 
 		 250 aa  78.6  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0671  NADPH-dependent FMN reductase  26.72 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.610211 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3773  NADPH-dependent FMN reductase  39.05 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.65168  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  37.17 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0130  NADPH-dependent FMN reductase  27.39 
 
 		 224 aa  75.1  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1815  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  38.1 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  37.96 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0784  NADPH-dependent FMN reductase  42.68 
 
 		 179 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0672  NADPH-dependent FMN reductase  26.64 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.594291 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0727  NADPH-dependent FMN reductase  29.38 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2330  NADPH-dependent FMN reductase  32.11 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  0.0193614 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1442  NADPH-dependent FMN reductase  36.04 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.103462  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1619  NADPH-dependent FMN reductase  37.74 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1676  hypothetical protein  37.86 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  hitchhiker  0.000000298375 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  36.45 
 
 		 214 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0722  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 		 211 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.658969  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 223 aa  68.6  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  33.94 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2991  NADPH-dependent FMN reductase  35.14 
 
 		 185 aa  67  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1029  NADPH-dependent FMN reductase  34.29 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.153649  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1188  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.646638 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1584  NADPH-dependent FMN reductase  35.24 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  32.71 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18130  NADPH-dependent FMN reductase  32.79 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.340395  normal  0.960689 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2213  NADPH-dependent FMN reductase  34.55 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1046  hypothetical protein  30.56 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.882215 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  35.51 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0018  NADPH-dependent FMN reductase  38.1 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2272  NADPH-dependent FMN reductase  33.04 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1320  NADPH-dependent FMN reductase  38.39 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.654727  normal  0.0975932 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2261  NADPH-dependent FMN reductase  37.14 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  0.127615 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  34.23 
 
 		 185 aa  65.1  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  35.85 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1467  NADPH-dependent FMN reductase  33.07 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0076  NADPH-dependent FMN reductase  35.24 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.399945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0275  NADPH-dependent FMN reductase  36.54 
 
 		 178 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2732  NADPH-dependent FMN reductase  32.71 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0521  NADPH-dependent FMN reductase  34.58 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2580  iron-sulfur flavoprotein  28.51 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29861  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1381  NADPH-dependent FMN reductase  35.43 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196943  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3622  NADPH-dependent FMN reductase  29.17 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0772  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  32.73 
 
 		 193 aa  62  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.806618  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 221 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1102  iron-sulfur flavoprotein  30.19 
 
 		 182 aa  61.2  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000321891  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0158  NADPH-dependent FMN reductase  35.24 
 
 		 206 aa  61.6  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0179  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  26.92 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0316  NADPH-dependent FMN reductase  34.91 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3305  iron-sulfur flavoprotein  32.38 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.328284  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1507  NADPH-dependent FMN reductase  32.69 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.569037  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  30.91 
 
 		 182 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  29.25 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  37.38 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3141  iron-sulfur flavoprotein  32.04 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.087899  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2997  NADPH-dependent FMN reductase  29.09 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0315889  normal  0.693807 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  33.03 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1130  NADPH-dependent FMN reductase  29.25 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0017  NADPH-dependent FMN reductase  31.73 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1623  hypothetical protein  33.02 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0374  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.4772 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1241  NADPH-dependent FMN reductase  25 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1498  NADPH-dependent FMN reductase  25.7 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1057  NADPH-dependent FMN reductase  36.19 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.840292  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  30.19 
 
 		 193 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_002936  DET1244  NADPH-dependent FMN reductase  32.77 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1029  iron-sulfur flavoprotein  35.24 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.343926  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1385  iron-sulfur flavoprotein  34.29 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2097  NADPH-dependent FMN reductase  35.4 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0293  NADPH-dependent FMN reductase  29.91 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000996855  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0408  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3523  NADPH-dependent FMN reductase  31.78 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0109  NADPH-dependent FMN reductase  32.38 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1492  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.38 
 
 		 540 aa  56.6  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1543  NADPH-dependent FMN reductase  32.38 
 
 		 193 aa  57  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0882991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2482  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 222 aa  57  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.801364  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0650  NADPH-dependent FMN reductase  33.96 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  28.3 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0309  NADPH-dependent FMN reductase  35.92 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  34.58 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1178  NADPH-dependent FMN reductase  32.71 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1264  NADPH-dependent FMN reductase  31.13 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.246056  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  28.3 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18210  NADPH-dependent FMN reductase  28.48 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  28.3 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  30.19 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2381  NADPH-dependent FMN reductase  33.04 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.19679e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0303  NADPH-dependent FMN reductase  34.41 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2535  NADPH-dependent FMN reductase  33.02 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.437841 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1043  NADPH-dependent FMN reductase  32.38 
 
 		 192 aa  55.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.603654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1266  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.36 
 
 		 562 aa  54.7  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  31.48 
 
 		 211 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0284  NADPH-dependent FMN reductase  26.15 
 
 		 211 aa  54.3  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1441  NADPH-dependent FMN reductase  30.77 
 
 		 192 aa  54.3  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0301  NADPH-dependent FMN reductase  26.15 
 
 		 211 aa  54.3  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.354287  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1125  NADPH-dependent FMN reductase  30.36 
 
 		 217 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000715162  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1851  NADPH-dependent FMN reductase  37.74 
 
 		 204 aa  54.3  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0492811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1799  NADPH-dependent FMN reductase  32.11 
 
 		 216 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>