227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1543 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1543  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
193 aa  394  1e-109  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0882991  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1385  iron-sulfur flavoprotein  64.55 
 
 
191 aa  270  8.000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0991  NADPH-dependent FMN reductase  59.26 
 
 
199 aa  243  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.451509  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0277  NADPH-dependent FMN reductase  59.26 
 
 
199 aa  242  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1637  NADPH-dependent FMN reductase  59.79 
 
 
191 aa  241  5e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0800599  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0650  NADPH-dependent FMN reductase  60.32 
 
 
190 aa  241  5e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2925  NADPH-dependent FMN reductase  59.69 
 
 
193 aa  240  7.999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000194359  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1487  NADPH-dependent FMN reductase  56.08 
 
 
198 aa  238  5e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.535714  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  53.44 
 
 
206 aa  215  4e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1043  NADPH-dependent FMN reductase  53.68 
 
 
192 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.603654  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  51.85 
 
 
191 aa  212  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0325  NADPH-dependent FMN reductase  51.34 
 
 
188 aa  210  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0017  NADPH-dependent FMN reductase  53.19 
 
 
194 aa  208  3e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1264  NADPH-dependent FMN reductase  51.85 
 
 
200 aa  209  3e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.246056  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1623  hypothetical protein  51.05 
 
 
194 aa  204  5e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1170  FMN reductase, NADPH-dependent  51.58 
 
 
207 aa  204  5e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2535  NADPH-dependent FMN reductase  51.05 
 
 
191 aa  203  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.437841 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1057  NADPH-dependent FMN reductase  52.91 
 
 
190 aa  201  5e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.840292  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1441  NADPH-dependent FMN reductase  50 
 
 
192 aa  201  8e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1244  NADPH-dependent FMN reductase  53.44 
 
 
190 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1029  iron-sulfur flavoprotein  52.38 
 
 
190 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.343926  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0109  NADPH-dependent FMN reductase  46.56 
 
 
191 aa  199  3e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2979  NADPH-dependent FMN reductase  51.81 
 
 
204 aa  199  3e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.670971 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1507  NADPH-dependent FMN reductase  52.38 
 
 
194 aa  197  7e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.569037  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  48.95 
 
 
205 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1770  NADPH-dependent FMN reductase  54.21 
 
 
190 aa  193  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000383709  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0284  NADPH-dependent FMN reductase  46.56 
 
 
211 aa  193  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0301  NADPH-dependent FMN reductase  46.03 
 
 
211 aa  192  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.354287  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  47.62 
 
 
192 aa  192  3e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  48.11 
 
 
204 aa  191  4e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0179  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  43.39 
 
 
211 aa  179  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0722  NADPH-dependent FMN reductase  42.86 
 
 
211 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.658969  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1959  NADPH-dependent FMN reductase  43.32 
 
 
211 aa  178  4e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.783003  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  42.33 
 
 
208 aa  173  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1178  NADPH-dependent FMN reductase  42.78 
 
 
223 aa  167  1e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0293  NADPH-dependent FMN reductase  39.15 
 
 
208 aa  160  9e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000996855  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2381  NADPH-dependent FMN reductase  41.36 
 
 
195 aa  158  4e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.19679e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1058  NADPH-dependent FMN reductase  43.85 
 
 
192 aa  158  6e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0225  NADPH-dependent FMN reductase  38.83 
 
 
189 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.545185  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1487  NADPH-dependent FMN reductase  38.74 
 
 
207 aa  143  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.22855  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0173  multimeric flavodoxin WrbA  35.98 
 
 
206 aa  136  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000913866  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0869  NADPH-dependent FMN reductase  37.57 
 
 
206 aa  135  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00401648  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0797  hypothetical protein  37.23 
 
 
189 aa  135  4e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000338584 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0909  NADPH-dependent FMN reductase  37.57 
 
 
206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0780942  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1956  NADPH-dependent FMN reductase  38.58 
 
 
204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000522685  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11340  multimeric flavodoxin WrbA  33.33 
 
 
208 aa  123  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1620  NADPH-dependent FMN reductase  37.77 
 
 
211 aa  122  4e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2588  NADPH-dependent FMN reductase  36.7 
 
 
210 aa  120  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122146  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2419  NADPH-dependent FMN reductase  36.32 
 
 
189 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.873931  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0948  NADPH-dependent FMN reductase  37.23 
 
 
211 aa  119  3e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105461  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  37.24 
 
 
193 aa  119  3e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3584  NADPH-dependent FMN reductase  37.44 
 
 
212 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000299171  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  37.24 
 
 
193 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  36.73 
 
 
193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  34.67 
 
 
194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  35.71 
 
 
193 aa  103  2e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  30.85 
 
 
186 aa  100  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  31.55 
 
 
186 aa  99.8  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  31.58 
 
 
186 aa  99  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  32.29 
 
 
193 aa  92.8  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0486  NADPH-dependent FMN reductase  30.32 
 
 
197 aa  92.8  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.260904  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0321  NADPH-dependent FMN reductase  27.66 
 
 
197 aa  83.6  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.378386  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  28.95 
 
 
187 aa  82.4  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2377  NADPH-dependent FMN reductase  29.13 
 
 
209 aa  82.4  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000848109  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1505  NADPH-dependent FMN reductase  28.19 
 
 
197 aa  80.9  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0414  NADPH-dependent FMN reductase  28.19 
 
 
197 aa  80.5  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  30.72 
 
 
207 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 
211 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0630  NADPH-dependent FMN reductase  27.27 
 
 
233 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0252  iron-sulfur flavoprotein  29.26 
 
 
227 aa  77.8  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.488898  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  34.88 
 
 
214 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0421  NADPH-dependent FMN reductase  27.13 
 
 
197 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0316  NADPH-dependent FMN reductase  28.97 
 
 
212 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0521  NADPH-dependent FMN reductase  34.88 
 
 
217 aa  74.7  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1815  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  32.77 
 
 
224 aa  74.7  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0163  NADPH-dependent FMN reductase  30.65 
 
 
195 aa  74.3  0.0000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  36.89 
 
 
223 aa  74.3  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  26.01 
 
 
183 aa  73.9  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0413  NADPH-dependent FMN reductase  26.2 
 
 
182 aa  73.6  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.72676  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  34.4 
 
 
217 aa  73.6  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1442  NADPH-dependent FMN reductase  32.8 
 
 
217 aa  72  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  31.78 
 
 
214 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0159  NADPH-dependent FMN reductase  39.81 
 
 
203 aa  72.4  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2482  NADPH-dependent FMN reductase  30.43 
 
 
222 aa  72.4  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.801364  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1072  NADPH-dependent FMN reductase  31.65 
 
 
212 aa  72.4  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2330  NADPH-dependent FMN reductase  30.46 
 
 
224 aa  72  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  0.0193614 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1851  NADPH-dependent FMN reductase  29.95 
 
 
204 aa  71.6  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0492811  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2817  NADPH-dependent FMN reductase  35.64 
 
 
194 aa  71.6  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1046  hypothetical protein  34.26 
 
 
187 aa  71.2  0.000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.882215 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1381  NADPH-dependent FMN reductase  33.08 
 
 
216 aa  71.2  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196943  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0549  NADPH-dependent FMN reductase  29.49 
 
 
199 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  36.27 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1619  NADPH-dependent FMN reductase  35.65 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1467  NADPH-dependent FMN reductase  34.11 
 
 
216 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1029  NADPH-dependent FMN reductase  30.28 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.153649  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00930  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
173 aa  69.3  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407777  normal  0.42644 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0755  NADPH-dependent FMN reductase  26.24 
 
 
213 aa  68.6  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.263848  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1584  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
220 aa  68.6  0.00000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2732  NADPH-dependent FMN reductase  33.83 
 
 
209 aa  68.2  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0870  NADPH-dependent FMN reductase  25.76 
 
 
195 aa  68.2  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000162046  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>