181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0630 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0630  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 		 233 aa  489  1e-137  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3676  NADPH-dependent FMN reductase  41.15 
 
 		 227 aa  156  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0925  NADPH-dependent FMN reductase  36.31 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.502139  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0225  NADPH-dependent FMN reductase  32.09 
 
 		 189 aa  98.2  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.545185  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0109  NADPH-dependent FMN reductase  30.89 
 
 		 191 aa  94.4  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  31.28 
 
 		 191 aa  92.8  4e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  32.28 
 
 		 208 aa  92  6e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1057  NADPH-dependent FMN reductase  30.48 
 
 		 190 aa  91.3  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.840292  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1385  iron-sulfur flavoprotein  30.34 
 
 		 191 aa  90.9  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1244  NADPH-dependent FMN reductase  31.02 
 
 		 190 aa  89.7  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0722  NADPH-dependent FMN reductase  29.74 
 
 		 211 aa  89  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.658969  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0179  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  29.74 
 
 		 211 aa  88.6  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0293  NADPH-dependent FMN reductase  31.38 
 
 		 208 aa  88.2  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000996855  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1058  NADPH-dependent FMN reductase  30.98 
 
 		 192 aa  88.2  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0301  NADPH-dependent FMN reductase  30.61 
 
 		 211 aa  87.8  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.354287  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2925  NADPH-dependent FMN reductase  27.81 
 
 		 193 aa  86.7  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000194359  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2535  NADPH-dependent FMN reductase  30.37 
 
 		 191 aa  84.7  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.437841 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  30.53 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  29.7 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0284  NADPH-dependent FMN reductase  29.59 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3584  NADPH-dependent FMN reductase  27.27 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000299171  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1029  iron-sulfur flavoprotein  30.41 
 
 		 190 aa  81.3  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.343926  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1487  NADPH-dependent FMN reductase  29.89 
 
 		 198 aa  81.3  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.535714  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0797  hypothetical protein  27.96 
 
 		 189 aa  80.5  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000338584 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  32.85 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2381  NADPH-dependent FMN reductase  27.53 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.19679e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0991  NADPH-dependent FMN reductase  27.75 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.451509  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  32.85 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0321  NADPH-dependent FMN reductase  29.1 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.378386  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1637  NADPH-dependent FMN reductase  27.23 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0800599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1543  NADPH-dependent FMN reductase  27.27 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0882991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0325  NADPH-dependent FMN reductase  27.81 
 
 		 188 aa  77.8  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0650  NADPH-dependent FMN reductase  27.13 
 
 		 190 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  32.12 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1507  NADPH-dependent FMN reductase  30.89 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.569037  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0017  NADPH-dependent FMN reductase  30.73 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0869  NADPH-dependent FMN reductase  25.67 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00401648  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0277  NADPH-dependent FMN reductase  26.18 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11340  multimeric flavodoxin WrbA  28.11 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1623  hypothetical protein  27.6 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0909  NADPH-dependent FMN reductase  25.67 
 
 		 206 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0780942  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  27.69 
 
 		 193 aa  74.3  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1178  NADPH-dependent FMN reductase  27.18 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2979  NADPH-dependent FMN reductase  28.88 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.670971 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  31.01 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1487  NADPH-dependent FMN reductase  24.73 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.22855  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2419  NADPH-dependent FMN reductase  27.51 
 
 		 189 aa  71.2  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.873931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0486  NADPH-dependent FMN reductase  28.65 
 
 		 197 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.260904  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1959  NADPH-dependent FMN reductase  27.78 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.783003  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1043  NADPH-dependent FMN reductase  27.89 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.603654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2588  NADPH-dependent FMN reductase  28.73 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122146  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1170  FMN reductase, NADPH-dependent  28.14 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1264  NADPH-dependent FMN reductase  25.77 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.246056  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  30.29 
 
 		 205 aa  68.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  25.67 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0130  NADPH-dependent FMN reductase  38.83 
 
 		 224 aa  67  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0755  NADPH-dependent FMN reductase  29.19 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.263848  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1441  NADPH-dependent FMN reductase  26.15 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  26.29 
 
 		 193 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2377  NADPH-dependent FMN reductase  26.77 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000848109  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  28.1 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  30.53 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  27.45 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1371  NADPH-dependent FMN reductase  29.2 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  26.74 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1152  NADPH-dependent FMN reductase  29.2 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000059068  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1620  NADPH-dependent FMN reductase  27.07 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0252  iron-sulfur flavoprotein  29.95 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.488898  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  30.37 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0948  NADPH-dependent FMN reductase  25 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3773  NADPH-dependent FMN reductase  29.63 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.65168  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1182  NADPH-dependent FMN reductase  28.18 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000238882  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1815  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  34.15 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1505  NADPH-dependent FMN reductase  28.42 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0857  NADPH-dependent FMN reductase  31.33 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  27.78 
 
 		 182 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2817  NADPH-dependent FMN reductase  32 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0870  NADPH-dependent FMN reductase  32.93 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000162046  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  31.5 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0316  NADPH-dependent FMN reductase  29.69 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3141  iron-sulfur flavoprotein  33.67 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.087899  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1770  NADPH-dependent FMN reductase  30.23 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000383709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0629  multimeric flavodoxin WrbA-like  29.08 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.155338  normal  0.090437 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0159  NADPH-dependent FMN reductase  29.13 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0166  NADPH-dependent FMN reductase  27.74 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2330  NADPH-dependent FMN reductase  25 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  0.0193614 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0173  multimeric flavodoxin WrbA  22.96 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000913866  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0549  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1072  NADPH-dependent FMN reductase  25 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  29.13 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0414  NADPH-dependent FMN reductase  25.4 
 
 		 197 aa  54.7  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2580  iron-sulfur flavoprotein  31.73 
 
 		 222 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29861  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1510  NADPH-dependent FMN reductase  27.74 
 
 		 202 aa  54.3  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0938  NADPH-dependent FMN reductase  29.2 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3039  NADPH-dependent FMN reductase  30.19 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.301206 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0308  NADPH-dependent FMN reductase  29.46 
 
 		 204 aa  53.5  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.471384 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  24.39 
 
 		 211 aa  53.5  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 		 186 aa  52.8  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1130  NADPH-dependent FMN reductase  28 
 
 		 182 aa  52.8  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0076  NADPH-dependent FMN reductase  30.69 
 
 		 202 aa  52  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.399945  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>