230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1170 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1170  FMN reductase, NADPH-dependent  100 
 
 
207 aa  427  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  71.78 
 
 
205 aa  318  3e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  67.51 
 
 
204 aa  297  8e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  64.97 
 
 
206 aa  279  3e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1385  iron-sulfur flavoprotein  56.76 
 
 
191 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1441  NADPH-dependent FMN reductase  57.53 
 
 
192 aa  231  5e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1043  NADPH-dependent FMN reductase  56.99 
 
 
192 aa  229  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.603654  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  55.68 
 
 
191 aa  227  9e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2535  NADPH-dependent FMN reductase  53.68 
 
 
191 aa  223  2e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.437841 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0650  NADPH-dependent FMN reductase  55.43 
 
 
190 aa  219  1.9999999999999999e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1623  hypothetical protein  54.3 
 
 
194 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0325  NADPH-dependent FMN reductase  55.49 
 
 
188 aa  216  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1487  NADPH-dependent FMN reductase  51.35 
 
 
198 aa  214  8e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.535714  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1264  NADPH-dependent FMN reductase  52.85 
 
 
200 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.246056  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0991  NADPH-dependent FMN reductase  51.89 
 
 
199 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.451509  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0277  NADPH-dependent FMN reductase  51.35 
 
 
199 aa  211  7.999999999999999e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1637  NADPH-dependent FMN reductase  51.35 
 
 
191 aa  211  7.999999999999999e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0800599  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2925  NADPH-dependent FMN reductase  53.51 
 
 
193 aa  210  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000194359  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1543  NADPH-dependent FMN reductase  51.58 
 
 
193 aa  204  6e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0882991  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2979  NADPH-dependent FMN reductase  54.95 
 
 
204 aa  203  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.670971 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0109  NADPH-dependent FMN reductase  50.81 
 
 
191 aa  201  7e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1029  iron-sulfur flavoprotein  48.11 
 
 
190 aa  186  2e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.343926  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1244  NADPH-dependent FMN reductase  48.9 
 
 
190 aa  186  3e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1057  NADPH-dependent FMN reductase  48.35 
 
 
190 aa  186  3e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.840292  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0722  NADPH-dependent FMN reductase  46.39 
 
 
211 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.658969  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  44.86 
 
 
192 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0017  NADPH-dependent FMN reductase  47.8 
 
 
194 aa  176  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1959  NADPH-dependent FMN reductase  47.03 
 
 
211 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.783003  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0284  NADPH-dependent FMN reductase  43.65 
 
 
211 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0179  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  45.41 
 
 
211 aa  169  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0301  NADPH-dependent FMN reductase  44.32 
 
 
211 aa  167  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.354287  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1507  NADPH-dependent FMN reductase  45.36 
 
 
194 aa  162  3e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.569037  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1770  NADPH-dependent FMN reductase  47.37 
 
 
190 aa  161  8.000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000383709  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1178  NADPH-dependent FMN reductase  45.95 
 
 
223 aa  157  9e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  36.87 
 
 
208 aa  150  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0293  NADPH-dependent FMN reductase  40.43 
 
 
208 aa  150  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000996855  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1058  NADPH-dependent FMN reductase  41.62 
 
 
192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0797  hypothetical protein  39.11 
 
 
189 aa  138  4.999999999999999e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000338584 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2381  NADPH-dependent FMN reductase  37.37 
 
 
195 aa  138  6e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.19679e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11340  multimeric flavodoxin WrbA  37.36 
 
 
208 aa  125  3e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0225  NADPH-dependent FMN reductase  36.41 
 
 
189 aa  125  5e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.545185  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1487  NADPH-dependent FMN reductase  37.89 
 
 
207 aa  124  7e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.22855  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0869  NADPH-dependent FMN reductase  36.76 
 
 
206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00401648  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0909  NADPH-dependent FMN reductase  36.76 
 
 
206 aa  118  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0780942  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0173  multimeric flavodoxin WrbA  34.01 
 
 
206 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000913866  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1956  NADPH-dependent FMN reductase  36.98 
 
 
204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000522685  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3584  NADPH-dependent FMN reductase  35.83 
 
 
212 aa  107  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000299171  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  34.92 
 
 
193 aa  106  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  33.86 
 
 
194 aa  106  3e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  34.92 
 
 
193 aa  105  6e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0948  NADPH-dependent FMN reductase  37.23 
 
 
211 aa  104  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105461  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1620  NADPH-dependent FMN reductase  36.02 
 
 
211 aa  102  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2419  NADPH-dependent FMN reductase  33.15 
 
 
189 aa  102  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.873931  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  37.89 
 
 
193 aa  102  6e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2588  NADPH-dependent FMN reductase  35.64 
 
 
210 aa  101  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122146  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
207 aa  96.3  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0316  NADPH-dependent FMN reductase  41.8 
 
 
212 aa  92.4  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  32.8 
 
 
193 aa  90.1  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1638  NADPH-dependent FMN reductase  32.9 
 
 
187 aa  86.7  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0739804  normal  0.913531 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  32.68 
 
 
187 aa  87  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  43.81 
 
 
214 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  39.39 
 
 
220 aa  81.6  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  33.13 
 
 
193 aa  80.9  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  36.15 
 
 
217 aa  81.3  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2330  NADPH-dependent FMN reductase  41.46 
 
 
224 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  0.0193614 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3773  NADPH-dependent FMN reductase  39.39 
 
 
220 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.65168  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0252  iron-sulfur flavoprotein  33.5 
 
 
227 aa  79.3  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.488898  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1505  NADPH-dependent FMN reductase  31.69 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  29.26 
 
 
186 aa  78.6  0.00000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0321  NADPH-dependent FMN reductase  28.96 
 
 
197 aa  78.6  0.00000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.378386  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1125  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
217 aa  78.2  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000715162  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  36.72 
 
 
223 aa  78.2  0.00000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2991  NADPH-dependent FMN reductase  34.44 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  40.95 
 
 
214 aa  77.8  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  40.2 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  38.39 
 
 
217 aa  76.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2580  iron-sulfur flavoprotein  39.05 
 
 
222 aa  76.3  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29861  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  28.42 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0421  NADPH-dependent FMN reductase  32.61 
 
 
197 aa  76.6  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0486  NADPH-dependent FMN reductase  30.6 
 
 
197 aa  75.9  0.0000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.260904  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3523  NADPH-dependent FMN reductase  43.4 
 
 
218 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0414  NADPH-dependent FMN reductase  31.15 
 
 
197 aa  75.9  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0018  NADPH-dependent FMN reductase  40.2 
 
 
228 aa  75.5  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0549  NADPH-dependent FMN reductase  32.52 
 
 
199 aa  75.1  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2817  NADPH-dependent FMN reductase  36.63 
 
 
194 aa  75.1  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1988  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.37 
 
 
321 aa  74.7  0.0000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0292793  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1442  NADPH-dependent FMN reductase  39.29 
 
 
217 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0163  NADPH-dependent FMN reductase  34.23 
 
 
195 aa  74.3  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  39.22 
 
 
210 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  39.22 
 
 
211 aa  74.3  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1626  NADPH-dependent FMN reductase  36.25 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.65491  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0408  NADPH-dependent FMN reductase  31.43 
 
 
225 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  32 
 
 
186 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2377  NADPH-dependent FMN reductase  31.52 
 
 
209 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000848109  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  27.13 
 
 
186 aa  73.9  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1508  NADPH-dependent FMN reductase  44.66 
 
 
216 aa  72.8  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.25275  decreased coverage  0.00823646 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0755  NADPH-dependent FMN reductase  36.13 
 
 
213 aa  72.8  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.263848  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0784  NADPH-dependent FMN reductase  36 
 
 
179 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1149  NADPH-dependent FMN reductase  36.61 
 
 
208 aa  72.8  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.285301  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  35.17 
 
 
221 aa  72  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>