199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3584 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3584  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 		 212 aa  442  1e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000299171  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0948  NADPH-dependent FMN reductase  75.47 
 
 		 211 aa  322  4e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1620  NADPH-dependent FMN reductase  74.06 
 
 		 211 aa  313  9e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2588  NADPH-dependent FMN reductase  72.04 
 
 		 210 aa  300  1e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122146  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0869  NADPH-dependent FMN reductase  63.51 
 
 		 206 aa  271  5.000000000000001e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00401648  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0909  NADPH-dependent FMN reductase  63.03 
 
 		 206 aa  271  7e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0780942  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1487  NADPH-dependent FMN reductase  52.83 
 
 		 207 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.22855  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0173  multimeric flavodoxin WrbA  50 
 
 		 206 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000913866  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11340  multimeric flavodoxin WrbA  49.05 
 
 		 208 aa  215  4e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1956  NADPH-dependent FMN reductase  52.34 
 
 		 204 aa  198  3.9999999999999996e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000522685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0301  NADPH-dependent FMN reductase  45.33 
 
 		 211 aa  187  8e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.354287  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0284  NADPH-dependent FMN reductase  44.86 
 
 		 211 aa  185  4e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0179  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  45.33 
 
 		 211 aa  180  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0293  NADPH-dependent FMN reductase  44.39 
 
 		 208 aa  180  1e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000996855  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0722  NADPH-dependent FMN reductase  44.39 
 
 		 211 aa  180  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.658969  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1959  NADPH-dependent FMN reductase  42.99 
 
 		 211 aa  171  5.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.783003  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1178  NADPH-dependent FMN reductase  45.37 
 
 		 223 aa  168  6e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  40.19 
 
 		 208 aa  149  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0325  NADPH-dependent FMN reductase  42.25 
 
 		 188 aa  144  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0225  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 		 189 aa  141  8e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.545185  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2979  NADPH-dependent FMN reductase  39.02 
 
 		 204 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.670971 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0109  NADPH-dependent FMN reductase  38.62 
 
 		 191 aa  138  4.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2925  NADPH-dependent FMN reductase  42.35 
 
 		 193 aa  136  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000194359  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1385  iron-sulfur flavoprotein  40.21 
 
 		 191 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0650  NADPH-dependent FMN reductase  39.89 
 
 		 190 aa  133  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1264  NADPH-dependent FMN reductase  37.31 
 
 		 200 aa  132  5e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.246056  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1057  NADPH-dependent FMN reductase  40.21 
 
 		 190 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.840292  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  38.62 
 
 		 191 aa  129  3e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1029  iron-sulfur flavoprotein  38.62 
 
 		 190 aa  128  6e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.343926  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0797  hypothetical protein  36.41 
 
 		 189 aa  127  9.000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000338584 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1637  NADPH-dependent FMN reductase  39.47 
 
 		 191 aa  127  9.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0800599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  38.62 
 
 		 192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1244  NADPH-dependent FMN reductase  39.47 
 
 		 190 aa  124  1e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0991  NADPH-dependent FMN reductase  37.04 
 
 		 199 aa  123  2e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.451509  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1487  NADPH-dependent FMN reductase  38.62 
 
 		 198 aa  124  2e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.535714  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0277  NADPH-dependent FMN reductase  36.51 
 
 		 199 aa  122  3e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2535  NADPH-dependent FMN reductase  38.1 
 
 		 191 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.437841 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2381  NADPH-dependent FMN reductase  34.21 
 
 		 195 aa  120  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.19679e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  37.04 
 
 		 206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2419  NADPH-dependent FMN reductase  34.76 
 
 		 189 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.873931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1507  NADPH-dependent FMN reductase  36.79 
 
 		 194 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.569037  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1543  NADPH-dependent FMN reductase  37.44 
 
 		 193 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0882991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1441  NADPH-dependent FMN reductase  37.89 
 
 		 192 aa  117  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1770  NADPH-dependent FMN reductase  40.74 
 
 		 190 aa  115  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000383709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1043  NADPH-dependent FMN reductase  35.98 
 
 		 192 aa  115  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.603654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 		 204 aa  112  5e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1170  FMN reductase, NADPH-dependent  35.83 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0017  NADPH-dependent FMN reductase  34.69 
 
 		 194 aa  105  6e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  33.66 
 
 		 205 aa  104  8e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1623  hypothetical protein  34.21 
 
 		 194 aa  103  3e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  31.28 
 
 		 193 aa  96.3  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 194 aa  95.9  4e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  32.29 
 
 		 193 aa  95.5  5e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  32.29 
 
 		 193 aa  92  5e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1058  NADPH-dependent FMN reductase  33.51 
 
 		 192 aa  91.3  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0630  NADPH-dependent FMN reductase  27.27 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0755  NADPH-dependent FMN reductase  29.91 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.263848  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  27.6 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1125  NADPH-dependent FMN reductase  32.54 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000715162  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  31.43 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  27.69 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  29.15 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  28.15 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  26.29 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1182  NADPH-dependent FMN reductase  33.96 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000238882  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  33.64 
 
 		 214 aa  68.2  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1371  NADPH-dependent FMN reductase  32.08 
 
 		 190 aa  67.8  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  28.29 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  31.78 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  34.58 
 
 		 214 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1152  NADPH-dependent FMN reductase  32.08 
 
 		 190 aa  67  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000059068  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  30.69 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  34.58 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  30.43 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3773  NADPH-dependent FMN reductase  33.64 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.65168  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  32.67 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1467  NADPH-dependent FMN reductase  33.64 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1149  NADPH-dependent FMN reductase  28.89 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.285301  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1381  NADPH-dependent FMN reductase  32.71 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196943  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0486  NADPH-dependent FMN reductase  27.66 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.260904  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0316  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2580  iron-sulfur flavoprotein  32.71 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29861  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2377  NADPH-dependent FMN reductase  27.09 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000848109  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  31.78 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3523  NADPH-dependent FMN reductase  25.86 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0321  NADPH-dependent FMN reductase  25.95 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.378386  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  27.41 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1102  iron-sulfur flavoprotein  33.65 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000321891  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2991  NADPH-dependent FMN reductase  25.86 
 
 		 185 aa  62  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  27.03 
 
 		 221 aa  62  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0521  NADPH-dependent FMN reductase  31.78 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1442  NADPH-dependent FMN reductase  31.78 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0487  NADPH-dependent FMN reductase  27.62 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.671634  normal  0.453927 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0414  NADPH-dependent FMN reductase  25.63 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2097  NADPH-dependent FMN reductase  30.09 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  25 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2272  NADPH-dependent FMN reductase  30.39 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1241  NADPH-dependent FMN reductase  33.65 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>