256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1743 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 		 214 aa  449  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  93.9 
 
 		 214 aa  425  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  76.17 
 
 		 217 aa  348  3e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1442  NADPH-dependent FMN reductase  75.12 
 
 		 217 aa  340  8e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  71.09 
 
 		 217 aa  323  1e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0018  NADPH-dependent FMN reductase  69.19 
 
 		 228 aa  308  2.9999999999999997e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2580  iron-sulfur flavoprotein  62.15 
 
 		 222 aa  280  1e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29861  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1508  NADPH-dependent FMN reductase  61.03 
 
 		 216 aa  269  2e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.25275  decreased coverage  0.00823646 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3523  NADPH-dependent FMN reductase  60.38 
 
 		 218 aa  264  8e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0521  NADPH-dependent FMN reductase  58.29 
 
 		 217 aa  256  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1381  NADPH-dependent FMN reductase  54.67 
 
 		 216 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196943  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1467  NADPH-dependent FMN reductase  53.05 
 
 		 216 aa  242  3e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2097  NADPH-dependent FMN reductase  54.55 
 
 		 236 aa  241  5e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1125  NADPH-dependent FMN reductase  53.55 
 
 		 217 aa  238  4e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000715162  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1799  NADPH-dependent FMN reductase  51.16 
 
 		 216 aa  224  9e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0357  hypothetical protein  38.86 
 
 		 211 aa  142  5e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1522  NADPH-dependent FMN reductase  38.86 
 
 		 212 aa  138  6e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00760  hypothetical protein  39.53 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.62232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  51.92 
 
 		 185 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  50 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2213  NADPH-dependent FMN reductase  37.91 
 
 		 189 aa  102  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  40.85 
 
 		 191 aa  96.3  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0772  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  36.25 
 
 		 193 aa  95.5  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.806618  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2330  NADPH-dependent FMN reductase  46.23 
 
 		 224 aa  95.5  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  0.0193614 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1676  hypothetical protein  39.83 
 
 		 200 aa  94.7  9e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  hitchhiker  0.000000298375 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  48.65 
 
 		 207 aa  94.7  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1149  NADPH-dependent FMN reductase  39.26 
 
 		 208 aa  93.2  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.285301  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  37.78 
 
 		 193 aa  93.2  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  43.27 
 
 		 193 aa  92.4  5e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  42.31 
 
 		 194 aa  92  5e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  43.27 
 
 		 193 aa  92  6e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  41.9 
 
 		 206 aa  92  7e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0893  NADPH-dependent FMN reductase  33.14 
 
 		 200 aa  91.7  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  39.62 
 
 		 182 aa  91.7  8e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  46.67 
 
 		 205 aa  91.3  9e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0158  NADPH-dependent FMN reductase  33.85 
 
 		 206 aa  91.3  9e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0671  NADPH-dependent FMN reductase  43.93 
 
 		 239 aa  90.9  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.610211 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  42.86 
 
 		 204 aa  91.3  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  37.78 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1623  hypothetical protein  45.37 
 
 		 194 aa  89.7  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0722  NADPH-dependent FMN reductase  37.96 
 
 		 211 aa  88.2  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.658969  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0109  NADPH-dependent FMN reductase  43.81 
 
 		 191 aa  87.4  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1498  NADPH-dependent FMN reductase  40.38 
 
 		 185 aa  86.7  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2997  NADPH-dependent FMN reductase  43.27 
 
 		 184 aa  86.3  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0315889  normal  0.693807 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0309  NADPH-dependent FMN reductase  27.51 
 
 		 212 aa  86.7  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  42.45 
 
 		 223 aa  85.9  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  45.28 
 
 		 221 aa  85.9  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3622  NADPH-dependent FMN reductase  39.09 
 
 		 191 aa  85.5  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1046  hypothetical protein  40 
 
 		 187 aa  85.5  5e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.882215 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1619  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 		 179 aa  85.5  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  41.35 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1507  NADPH-dependent FMN reductase  32.5 
 
 		 194 aa  84.3  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.569037  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0076  NADPH-dependent FMN reductase  30.81 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.399945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0125  NADPH-dependent FMN reductase  37.43 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  39.05 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  31.32 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0316  NADPH-dependent FMN reductase  45.71 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  41.44 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1170  FMN reductase, NADPH-dependent  43.81 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0374  NADPH-dependent FMN reductase  39.05 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.4772 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  34.07 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1441  NADPH-dependent FMN reductase  38.89 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2272  NADPH-dependent FMN reductase  41.9 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  41.9 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1043  NADPH-dependent FMN reductase  37.96 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.603654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  39.05 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3773  NADPH-dependent FMN reductase  37.14 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.65168  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1637  NADPH-dependent FMN reductase  38.18 
 
 		 191 aa  82  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0800599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2732  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2120  NADPH-dependent FMN reductase  35.92 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0276138  normal  0.10387 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0784  NADPH-dependent FMN reductase  34.51 
 
 		 179 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2817  NADPH-dependent FMN reductase  33.06 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1264  NADPH-dependent FMN reductase  34.62 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.246056  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1770  NADPH-dependent FMN reductase  38.71 
 
 		 190 aa  79.7  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000383709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0408  NADPH-dependent FMN reductase  38.68 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0130  NADPH-dependent FMN reductase  37.93 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1392  NADPH-dependent FMN reductase  36.27 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  36.7 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1487  NADPH-dependent FMN reductase  31.18 
 
 		 198 aa  79  0.00000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.535714  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1620  NADPH-dependent FMN reductase  34.71 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0301  NADPH-dependent FMN reductase  34.26 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.354287  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1241  NADPH-dependent FMN reductase  39.62 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1058  NADPH-dependent FMN reductase  38.52 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  35.78 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0632  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1130  NADPH-dependent FMN reductase  40.38 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0284  NADPH-dependent FMN reductase  34.26 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0991  NADPH-dependent FMN reductase  37.27 
 
 		 199 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.451509  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0293  NADPH-dependent FMN reductase  36.21 
 
 		 208 aa  77.8  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000996855  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1584  NADPH-dependent FMN reductase  37.74 
 
 		 220 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1543  NADPH-dependent FMN reductase  34.88 
 
 		 193 aa  77.8  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0882991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00930  NADPH-dependent FMN reductase  32.77 
 
 		 173 aa  77.4  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407777  normal  0.42644 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0748  iron-sulfur flavoprotein  41.84 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.203042 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  35.78 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1815  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3141  iron-sulfur flavoprotein  36.61 
 
 		 178 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.087899  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0017  NADPH-dependent FMN reductase  35.48 
 
 		 194 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0650  NADPH-dependent FMN reductase  28.18 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1371  NADPH-dependent FMN reductase  32.82 
 
 		 190 aa  76.3  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2261  NADPH-dependent FMN reductase  36.79 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  0.127615 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>