197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_00760 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_00760  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  442  1e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.62232  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1522  NADPH-dependent FMN reductase  59.62 
 
 
212 aa  244  9e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2580  iron-sulfur flavoprotein  42.33 
 
 
222 aa  168  6e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29861  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  40.74 
 
 
217 aa  160  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  41.4 
 
 
214 aa  157  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0018  NADPH-dependent FMN reductase  38.03 
 
 
228 aa  154  9e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1125  NADPH-dependent FMN reductase  38.6 
 
 
217 aa  154  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000715162  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1508  NADPH-dependent FMN reductase  42.59 
 
 
216 aa  153  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.25275  decreased coverage  0.00823646 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1442  NADPH-dependent FMN reductase  39.07 
 
 
217 aa  152  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1467  NADPH-dependent FMN reductase  39.07 
 
 
216 aa  152  4e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  39.53 
 
 
214 aa  151  5.9999999999999996e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  39.07 
 
 
217 aa  149  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1381  NADPH-dependent FMN reductase  38.6 
 
 
216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196943  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0521  NADPH-dependent FMN reductase  39.15 
 
 
217 aa  144  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3523  NADPH-dependent FMN reductase  39.53 
 
 
218 aa  144  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2097  NADPH-dependent FMN reductase  38.99 
 
 
236 aa  142  4e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0357  hypothetical protein  36.32 
 
 
211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1799  NADPH-dependent FMN reductase  35.48 
 
 
216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2213  NADPH-dependent FMN reductase  32.43 
 
 
189 aa  85.1  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0374  NADPH-dependent FMN reductase  39.42 
 
 
188 aa  77.8  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.4772 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1676  hypothetical protein  36.63 
 
 
200 aa  75.9  0.0000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  hitchhiker  0.000000298375 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0158  NADPH-dependent FMN reductase  38.74 
 
 
206 aa  73.2  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2997  NADPH-dependent FMN reductase  36.54 
 
 
184 aa  72.4  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0315889  normal  0.693807 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  37.25 
 
 
193 aa  70.9  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  37.25 
 
 
193 aa  70.9  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1507  NADPH-dependent FMN reductase  35.85 
 
 
194 aa  70.1  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.569037  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  36.54 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  37.25 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0772  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  31.29 
 
 
193 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.806618  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1392  NADPH-dependent FMN reductase  37.62 
 
 
201 aa  69.3  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2261  NADPH-dependent FMN reductase  36.54 
 
 
222 aa  68.6  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  0.127615 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0468  NADPH-dependent FMN reductase  26.89 
 
 
205 aa  68.6  0.00000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0704146  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  36.27 
 
 
194 aa  68.2  0.00000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1815  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  41.35 
 
 
224 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1626  NADPH-dependent FMN reductase  35.58 
 
 
220 aa  67.8  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.65491  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3622  NADPH-dependent FMN reductase  35.78 
 
 
191 aa  67  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2419  NADPH-dependent FMN reductase  35.35 
 
 
189 aa  67  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.873931  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0408  NADPH-dependent FMN reductase  33.96 
 
 
225 aa  67  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0784  NADPH-dependent FMN reductase  31.03 
 
 
179 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1498  NADPH-dependent FMN reductase  34.62 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2330  NADPH-dependent FMN reductase  33.65 
 
 
224 aa  65.9  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  0.0193614 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0076  NADPH-dependent FMN reductase  36.04 
 
 
202 aa  65.1  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.399945  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  33.98 
 
 
212 aa  64.7  0.0000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1487  NADPH-dependent FMN reductase  34.29 
 
 
198 aa  64.7  0.0000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.535714  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1320  NADPH-dependent FMN reductase  35.4 
 
 
179 aa  64.3  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.654727  normal  0.0975932 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  39.22 
 
 
193 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1619  NADPH-dependent FMN reductase  30.48 
 
 
179 aa  63.5  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0309  NADPH-dependent FMN reductase  35.45 
 
 
212 aa  63.2  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  33.01 
 
 
182 aa  63.2  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  32.41 
 
 
191 aa  63.2  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0275  NADPH-dependent FMN reductase  29.66 
 
 
178 aa  63.2  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1285  NADPH-dependent FMN reductase  31.58 
 
 
197 aa  62.8  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.497649  normal  0.389555 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3305  iron-sulfur flavoprotein  33.96 
 
 
222 aa  62  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.328284  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0109  NADPH-dependent FMN reductase  31.37 
 
 
191 aa  62  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2463  hypothetical protein  28.57 
 
 
202 aa  62  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000389494  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  25.32 
 
 
186 aa  62  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0893  NADPH-dependent FMN reductase  31.21 
 
 
200 aa  62  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1637  NADPH-dependent FMN reductase  33.02 
 
 
191 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0800599  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1029  NADPH-dependent FMN reductase  33.02 
 
 
222 aa  61.2  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.153649  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2272  NADPH-dependent FMN reductase  32.48 
 
 
197 aa  60.8  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  31.19 
 
 
206 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  32.69 
 
 
223 aa  60.1  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1770  NADPH-dependent FMN reductase  33.65 
 
 
190 aa  60.5  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000383709  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1584  NADPH-dependent FMN reductase  39.05 
 
 
220 aa  60.5  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0991  NADPH-dependent FMN reductase  34.26 
 
 
199 aa  60.1  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.451509  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2482  NADPH-dependent FMN reductase  29.25 
 
 
222 aa  60.1  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.801364  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1442  NADPH-dependent FMN reductase  28.08 
 
 
224 aa  59.7  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.103462  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3308  NADPH-dependent FMN reductase  35.24 
 
 
311 aa  59.3  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000769762  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  31.07 
 
 
204 aa  59.3  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1170  FMN reductase, NADPH-dependent  30.39 
 
 
207 aa  58.9  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0017  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
194 aa  58.9  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  31.37 
 
 
205 aa  58.9  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  30.51 
 
 
211 aa  58.9  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1620  NADPH-dependent FMN reductase  30.56 
 
 
211 aa  58.9  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0797  hypothetical protein  32.35 
 
 
189 aa  58.5  0.00000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000338584 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1152  NADPH-dependent FMN reductase  26.92 
 
 
190 aa  58.5  0.00000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000059068  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18130  NADPH-dependent FMN reductase  28.76 
 
 
172 aa  58.5  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.340395  normal  0.960689 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2120  NADPH-dependent FMN reductase  32.04 
 
 
208 aa  58.5  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0276138  normal  0.10387 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1241  NADPH-dependent FMN reductase  29.13 
 
 
189 aa  58.2  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0120  hypothetical protein  35.96 
 
 
200 aa  58.2  0.00000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0166  NADPH-dependent FMN reductase  31.53 
 
 
196 aa  58.2  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1182  NADPH-dependent FMN reductase  23.67 
 
 
190 aa  58.2  0.00000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000238882  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2588  NADPH-dependent FMN reductase  29.52 
 
 
210 aa  57.8  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122146  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  35.58 
 
 
220 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0277  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
199 aa  57.4  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1371  NADPH-dependent FMN reductase  26.92 
 
 
190 aa  57.4  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  26.85 
 
 
193 aa  57  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3773  NADPH-dependent FMN reductase  35.58 
 
 
220 aa  57.4  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.65168  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2732  NADPH-dependent FMN reductase  32.67 
 
 
209 aa  57  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0487  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 
199 aa  57  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.671634  normal  0.453927 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0632  NADPH-dependent FMN reductase  26.32 
 
 
201 aa  56.6  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  29.13 
 
 
210 aa  57  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0672  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
263 aa  56.6  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.594291 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0719  Multimeric flavodoxin WrbA-like protein  24.2 
 
 
248 aa  57  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.96421  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1385  iron-sulfur flavoprotein  31.48 
 
 
191 aa  56.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0325  NADPH-dependent FMN reductase  33.01 
 
 
188 aa  56.2  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1149  NADPH-dependent FMN reductase  29.13 
 
 
208 aa  56.6  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.285301  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0125  NADPH-dependent FMN reductase  30.25 
 
 
190 aa  55.8  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0303  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
199 aa  56.2  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3707  NADPH-dependent FMN reductase  29.13 
 
 
208 aa  56.2  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0930977 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>