222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2097 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2097  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
236 aa  495  1e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2580  iron-sulfur flavoprotein  56.05 
 
 
222 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29861  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3523  NADPH-dependent FMN reductase  56.56 
 
 
218 aa  252  3e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1508  NADPH-dependent FMN reductase  55.76 
 
 
216 aa  249  3e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.25275  decreased coverage  0.00823646 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0018  NADPH-dependent FMN reductase  53.45 
 
 
228 aa  249  3e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1467  NADPH-dependent FMN reductase  55.05 
 
 
216 aa  246  2e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  55.35 
 
 
217 aa  246  2e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  55.05 
 
 
214 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  54.55 
 
 
214 aa  241  6e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  54.05 
 
 
217 aa  241  9e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1381  NADPH-dependent FMN reductase  52.49 
 
 
216 aa  238  6.999999999999999e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196943  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1442  NADPH-dependent FMN reductase  53.15 
 
 
217 aa  236  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0521  NADPH-dependent FMN reductase  53.92 
 
 
217 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1125  NADPH-dependent FMN reductase  50.23 
 
 
217 aa  223  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000715162  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1799  NADPH-dependent FMN reductase  50 
 
 
216 aa  216  4e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00760  hypothetical protein  38.53 
 
 
211 aa  132  5e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.62232  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1522  NADPH-dependent FMN reductase  35.02 
 
 
212 aa  129  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0357  hypothetical protein  36.77 
 
 
211 aa  126  3e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  37.09 
 
 
186 aa  95.1  8e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1676  hypothetical protein  39.81 
 
 
200 aa  89  6e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  hitchhiker  0.000000298375 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  38.73 
 
 
185 aa  88.6  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2213  NADPH-dependent FMN reductase  35.92 
 
 
189 aa  80.9  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  37.7 
 
 
182 aa  80.1  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0772  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  34.01 
 
 
193 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.806618  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  34.75 
 
 
191 aa  77  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  40.54 
 
 
205 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1046  hypothetical protein  38.74 
 
 
187 aa  75.9  0.0000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.882215 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  36.04 
 
 
212 aa  75.9  0.0000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0797  hypothetical protein  36.36 
 
 
189 aa  75.5  0.0000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000338584 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  38.39 
 
 
223 aa  75.5  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  34.55 
 
 
194 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0893  NADPH-dependent FMN reductase  30.97 
 
 
200 aa  74.7  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  34.55 
 
 
193 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0158  NADPH-dependent FMN reductase  37.27 
 
 
206 aa  73.9  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1149  NADPH-dependent FMN reductase  36.04 
 
 
208 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.285301  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  37.27 
 
 
211 aa  73.6  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3622  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 
191 aa  73.2  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2272  NADPH-dependent FMN reductase  34.23 
 
 
197 aa  73.2  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1623  hypothetical protein  35.96 
 
 
194 aa  72.8  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  31.53 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1507  NADPH-dependent FMN reductase  32.14 
 
 
194 aa  73.2  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.569037  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0109  NADPH-dependent FMN reductase  39.64 
 
 
191 aa  72.4  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  33.64 
 
 
193 aa  72.8  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  35.14 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0017  NADPH-dependent FMN reductase  32.79 
 
 
194 aa  72.4  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0722  NADPH-dependent FMN reductase  32.74 
 
 
211 aa  72.4  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.658969  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  33.64 
 
 
193 aa  72.4  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  35.14 
 
 
204 aa  72  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0909  NADPH-dependent FMN reductase  29.84 
 
 
206 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0780942  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0076  NADPH-dependent FMN reductase  37.27 
 
 
202 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.399945  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2330  NADPH-dependent FMN reductase  33.93 
 
 
224 aa  70.5  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  0.0193614 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1170  FMN reductase, NADPH-dependent  39.64 
 
 
207 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0374  NADPH-dependent FMN reductase  32.26 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.4772 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0316  NADPH-dependent FMN reductase  36.97 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2997  NADPH-dependent FMN reductase  30.71 
 
 
184 aa  70.5  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0315889  normal  0.693807 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1264  NADPH-dependent FMN reductase  34.19 
 
 
200 aa  70.5  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.246056  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1441  NADPH-dependent FMN reductase  35.09 
 
 
192 aa  70.1  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1637  NADPH-dependent FMN reductase  32.46 
 
 
191 aa  69.7  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0800599  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  37.84 
 
 
220 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0325  NADPH-dependent FMN reductase  37.61 
 
 
188 aa  68.9  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  35.9 
 
 
207 aa  68.9  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2120  NADPH-dependent FMN reductase  34.58 
 
 
208 aa  68.9  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0276138  normal  0.10387 
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  30.43 
 
 
186 aa  67.8  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1498  NADPH-dependent FMN reductase  33.83 
 
 
185 aa  67.8  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1102  iron-sulfur flavoprotein  32.73 
 
 
182 aa  68.2  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000321891  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  34.75 
 
 
206 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1619  NADPH-dependent FMN reductase  30.28 
 
 
179 aa  67  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2588  NADPH-dependent FMN reductase  32.56 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122146  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3773  NADPH-dependent FMN reductase  36.04 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.65168  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
221 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0277  NADPH-dependent FMN reductase  31.58 
 
 
199 aa  67  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0869  NADPH-dependent FMN reductase  29.03 
 
 
206 aa  67  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00401648  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0784  NADPH-dependent FMN reductase  30.77 
 
 
179 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00930  NADPH-dependent FMN reductase  30.47 
 
 
173 aa  67  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407777  normal  0.42644 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0293  NADPH-dependent FMN reductase  32.77 
 
 
208 aa  66.6  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000996855  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1058  NADPH-dependent FMN reductase  36.22 
 
 
192 aa  65.9  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1320  NADPH-dependent FMN reductase  32.74 
 
 
179 aa  65.9  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.654727  normal  0.0975932 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0748  iron-sulfur flavoprotein  33.65 
 
 
195 aa  65.5  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.203042 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1392  NADPH-dependent FMN reductase  34.23 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0301  NADPH-dependent FMN reductase  32.46 
 
 
211 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.354287  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3141  iron-sulfur flavoprotein  35.09 
 
 
178 aa  65.5  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.087899  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0284  NADPH-dependent FMN reductase  32.46 
 
 
211 aa  65.5  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2463  hypothetical protein  30.08 
 
 
202 aa  65.1  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000389494  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0671  NADPH-dependent FMN reductase  32 
 
 
239 aa  64.7  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.610211 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1487  NADPH-dependent FMN reductase  30.97 
 
 
198 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.535714  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0650  NADPH-dependent FMN reductase  28.15 
 
 
190 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2732  NADPH-dependent FMN reductase  30.51 
 
 
209 aa  64.7  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0991  NADPH-dependent FMN reductase  30.7 
 
 
199 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.451509  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  31.93 
 
 
208 aa  63.9  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0489  NADPH-dependent FMN reductase  36.04 
 
 
206 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2817  NADPH-dependent FMN reductase  28.49 
 
 
194 aa  63.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1131  hypothetical protein  30.97 
 
 
179 aa  63.5  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1072  NADPH-dependent FMN reductase  35.14 
 
 
212 aa  64.3  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  28.68 
 
 
192 aa  63.5  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0173  multimeric flavodoxin WrbA  31.75 
 
 
206 aa  63.2  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000913866  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  33.05 
 
 
183 aa  63.2  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1486  NADPH-dependent FMN reductase  32.64 
 
 
200 aa  63.2  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1385  iron-sulfur flavoprotein  32.46 
 
 
191 aa  63.2  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0727  NADPH-dependent FMN reductase  29.63 
 
 
204 aa  62.8  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1620  NADPH-dependent FMN reductase  29.46 
 
 
211 aa  63.2  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.199489 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>