260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2302 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  100 
 
 
192 aa  394  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1385  iron-sulfur flavoprotein  56.84 
 
 
191 aa  231  6e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2925  NADPH-dependent FMN reductase  56.61 
 
 
193 aa  229  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000194359  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0650  NADPH-dependent FMN reductase  55.26 
 
 
190 aa  225  3e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  54.21 
 
 
191 aa  218  3e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1623  hypothetical protein  55.5 
 
 
194 aa  217  1e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2381  NADPH-dependent FMN reductase  54.92 
 
 
195 aa  216  2e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.19679e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0325  NADPH-dependent FMN reductase  51.6 
 
 
188 aa  214  8e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1043  NADPH-dependent FMN reductase  50 
 
 
192 aa  210  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.603654  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0991  NADPH-dependent FMN reductase  52.11 
 
 
199 aa  209  2e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.451509  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1441  NADPH-dependent FMN reductase  50.52 
 
 
192 aa  209  3e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0277  NADPH-dependent FMN reductase  51.58 
 
 
199 aa  207  9e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1637  NADPH-dependent FMN reductase  51.05 
 
 
191 aa  205  3e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0800599  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0722  NADPH-dependent FMN reductase  52.36 
 
 
211 aa  204  5e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.658969  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1264  NADPH-dependent FMN reductase  51.32 
 
 
200 aa  200  9e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.246056  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  49.73 
 
 
204 aa  198  3.9999999999999996e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1487  NADPH-dependent FMN reductase  49.74 
 
 
198 aa  197  7.999999999999999e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.535714  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0179  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  48.69 
 
 
211 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1543  NADPH-dependent FMN reductase  47.62 
 
 
193 aa  192  3e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0882991  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  48.15 
 
 
206 aa  191  5e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2535  NADPH-dependent FMN reductase  48.15 
 
 
191 aa  191  7e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.437841 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0301  NADPH-dependent FMN reductase  48.17 
 
 
211 aa  189  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.354287  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0284  NADPH-dependent FMN reductase  48.17 
 
 
211 aa  190  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1057  NADPH-dependent FMN reductase  48.95 
 
 
190 aa  187  5.999999999999999e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.840292  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0109  NADPH-dependent FMN reductase  47.64 
 
 
191 aa  187  9e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1029  iron-sulfur flavoprotein  47.89 
 
 
190 aa  184  6e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.343926  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1507  NADPH-dependent FMN reductase  49.74 
 
 
194 aa  184  6e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.569037  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1959  NADPH-dependent FMN reductase  47.85 
 
 
211 aa  184  7e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.783003  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1244  NADPH-dependent FMN reductase  48.42 
 
 
190 aa  183  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1770  NADPH-dependent FMN reductase  53.44 
 
 
190 aa  183  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000383709  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  45.45 
 
 
205 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2979  NADPH-dependent FMN reductase  50.27 
 
 
204 aa  180  9.000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.670971 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1170  FMN reductase, NADPH-dependent  44.86 
 
 
207 aa  179  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0017  NADPH-dependent FMN reductase  46.07 
 
 
194 aa  179  2e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1178  NADPH-dependent FMN reductase  48.13 
 
 
223 aa  174  7e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0293  NADPH-dependent FMN reductase  42.71 
 
 
208 aa  171  3.9999999999999995e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000996855  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  43.39 
 
 
208 aa  163  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1487  NADPH-dependent FMN reductase  41.8 
 
 
207 aa  147  7e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.22855  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0173  multimeric flavodoxin WrbA  38.54 
 
 
206 aa  140  8e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000913866  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11340  multimeric flavodoxin WrbA  39.78 
 
 
208 aa  139  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  40.31 
 
 
193 aa  135  4e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  39.29 
 
 
193 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1058  NADPH-dependent FMN reductase  34.57 
 
 
192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  39.09 
 
 
193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0909  NADPH-dependent FMN reductase  38.42 
 
 
206 aa  129  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0780942  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0869  NADPH-dependent FMN reductase  38.1 
 
 
206 aa  129  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00401648  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2588  NADPH-dependent FMN reductase  40.96 
 
 
210 aa  129  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122146  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3584  NADPH-dependent FMN reductase  38.62 
 
 
212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000299171  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0797  hypothetical protein  37.23 
 
 
189 aa  124  6e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000338584 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  36.27 
 
 
194 aa  123  2e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0225  NADPH-dependent FMN reductase  34.39 
 
 
189 aa  123  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.545185  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  37.24 
 
 
193 aa  118  7e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0948  NADPH-dependent FMN reductase  39.15 
 
 
211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105461  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1620  NADPH-dependent FMN reductase  38.83 
 
 
211 aa  114  6e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1956  NADPH-dependent FMN reductase  32.62 
 
 
204 aa  111  7.000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000522685  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  36.32 
 
 
207 aa  108  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  36.6 
 
 
193 aa  105  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2419  NADPH-dependent FMN reductase  32.11 
 
 
189 aa  99.4  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.873931  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  31.38 
 
 
183 aa  98.2  6e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
187 aa  96.7  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  36.41 
 
 
223 aa  95.9  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0316  NADPH-dependent FMN reductase  38.85 
 
 
212 aa  95.5  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  34.9 
 
 
185 aa  95.5  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  35.26 
 
 
186 aa  95.1  6e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0755  NADPH-dependent FMN reductase  29.5 
 
 
213 aa  94.4  9e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.263848  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  34.92 
 
 
186 aa  93.6  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  35.6 
 
 
186 aa  94.4  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0413  NADPH-dependent FMN reductase  30.69 
 
 
182 aa  93.2  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.72676  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  45.1 
 
 
206 aa  92.8  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  47.06 
 
 
211 aa  91.7  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2377  NADPH-dependent FMN reductase  32.2 
 
 
209 aa  89.7  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000848109  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0321  NADPH-dependent FMN reductase  30.46 
 
 
197 aa  88.2  7e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.378386  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0421  NADPH-dependent FMN reductase  30.69 
 
 
197 aa  87  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1505  NADPH-dependent FMN reductase  30.69 
 
 
197 aa  87  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0252  iron-sulfur flavoprotein  29.84 
 
 
227 aa  86.7  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.488898  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0408  NADPH-dependent FMN reductase  39.58 
 
 
225 aa  86.7  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2261  NADPH-dependent FMN reductase  38.41 
 
 
222 aa  87  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  0.127615 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1029  NADPH-dependent FMN reductase  38.89 
 
 
222 aa  86.3  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.153649  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2991  NADPH-dependent FMN reductase  34.72 
 
 
185 aa  86.3  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  30.73 
 
 
182 aa  86.3  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2482  NADPH-dependent FMN reductase  34.38 
 
 
222 aa  85.5  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.801364  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0486  NADPH-dependent FMN reductase  29.44 
 
 
197 aa  84.3  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.260904  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0414  NADPH-dependent FMN reductase  30.2 
 
 
197 aa  84  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0158  NADPH-dependent FMN reductase  41.67 
 
 
206 aa  84  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1626  NADPH-dependent FMN reductase  38.25 
 
 
220 aa  83.6  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.65491  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0630  NADPH-dependent FMN reductase  30.53 
 
 
233 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2732  NADPH-dependent FMN reductase  34.81 
 
 
209 aa  82.8  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0870  NADPH-dependent FMN reductase  30.77 
 
 
195 aa  82.8  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000162046  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  40.2 
 
 
210 aa  82.8  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  41.9 
 
 
214 aa  82  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2120  NADPH-dependent FMN reductase  37.23 
 
 
208 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0276138  normal  0.10387 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2272  NADPH-dependent FMN reductase  42.16 
 
 
197 aa  81.3  0.000000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1125  NADPH-dependent FMN reductase  33.85 
 
 
217 aa  81.3  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000715162  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1149  NADPH-dependent FMN reductase  40.2 
 
 
208 aa  80.9  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.285301  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  28.95 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2580  iron-sulfur flavoprotein  39.05 
 
 
222 aa  79.3  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29861  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1442  NADPH-dependent FMN reductase  37.14 
 
 
217 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  39.05 
 
 
214 aa  79  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0076  NADPH-dependent FMN reductase  36.11 
 
 
202 aa  79  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.399945  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0521  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 
217 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>