More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3857 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 		 220 aa  454  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3773  NADPH-dependent FMN reductase  95.91 
 
 		 220 aa  444  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.65168  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1815  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  55 
 
 		 224 aa  275  4e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0938  NADPH-dependent FMN reductase  51.16 
 
 		 220 aa  218  5e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1584  NADPH-dependent FMN reductase  37.21 
 
 		 220 aa  155  4e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2482  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 		 222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.801364  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2330  NADPH-dependent FMN reductase  40.21 
 
 		 224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  0.0193614 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  35.32 
 
 		 223 aa  142  4e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1626  NADPH-dependent FMN reductase  35.71 
 
 		 220 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.65491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3305  iron-sulfur flavoprotein  38.42 
 
 		 222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.328284  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1029  NADPH-dependent FMN reductase  36.28 
 
 		 222 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.153649  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2261  NADPH-dependent FMN reductase  35.78 
 
 		 222 aa  137  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  0.127615 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0408  NADPH-dependent FMN reductase  34.4 
 
 		 225 aa  136  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  39.02 
 
 		 221 aa  136  3.0000000000000003e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1442  NADPH-dependent FMN reductase  34.02 
 
 		 224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.103462  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  33.87 
 
 		 186 aa  97.4  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0727  NADPH-dependent FMN reductase  34.01 
 
 		 204 aa  94.4  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  38.57 
 
 		 186 aa  93.6  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 		 194 aa  92.8  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0076  NADPH-dependent FMN reductase  45.19 
 
 		 202 aa  93.2  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.399945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  31.09 
 
 		 193 aa  91.7  7e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  38.1 
 
 		 186 aa  90.9  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0857  NADPH-dependent FMN reductase  35.53 
 
 		 262 aa  90.9  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  30.94 
 
 		 183 aa  89.7  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  34.9 
 
 		 187 aa  89.4  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  39.44 
 
 		 205 aa  89  6e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  37.68 
 
 		 193 aa  88.6  7e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  36.76 
 
 		 193 aa  88.6  7e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  33.15 
 
 		 186 aa  88.2  8e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2732  NADPH-dependent FMN reductase  40.2 
 
 		 209 aa  88.2  8e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  37.3 
 
 		 185 aa  87  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0316  NADPH-dependent FMN reductase  36.22 
 
 		 212 aa  87  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1498  NADPH-dependent FMN reductase  36.48 
 
 		 185 aa  86.7  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1676  hypothetical protein  39.8 
 
 		 200 aa  86.7  3e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  hitchhiker  0.000000298375 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0158  NADPH-dependent FMN reductase  40.38 
 
 		 206 aa  85.9  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2120  NADPH-dependent FMN reductase  44.44 
 
 		 208 aa  85.5  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0276138  normal  0.10387 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1182  NADPH-dependent FMN reductase  35.58 
 
 		 190 aa  85.1  7e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000238882  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  40.95 
 
 		 217 aa  84.7  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2817  NADPH-dependent FMN reductase  40.82 
 
 		 194 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  30.88 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1371  NADPH-dependent FMN reductase  34.62 
 
 		 190 aa  84  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0748  iron-sulfur flavoprotein  32.37 
 
 		 195 aa  83.6  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.203042 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  39.05 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1152  NADPH-dependent FMN reductase  34.62 
 
 		 190 aa  84  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000059068  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2272  NADPH-dependent FMN reductase  38.53 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1442  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  37 
 
 		 182 aa  82.4  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0325  NADPH-dependent FMN reductase  32.64 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1392  NADPH-dependent FMN reductase  38.24 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2580  iron-sulfur flavoprotein  40.95 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29861  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0374  NADPH-dependent FMN reductase  29.83 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.4772 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3707  NADPH-dependent FMN reductase  35.71 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0930977 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0309  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1170  FMN reductase, NADPH-dependent  39.39 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0130  NADPH-dependent FMN reductase  31.05 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18210  NADPH-dependent FMN reductase  29.44 
 
 		 177 aa  81.3  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2991  NADPH-dependent FMN reductase  30.72 
 
 		 185 aa  81.3  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  38.03 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  39.05 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11340  multimeric flavodoxin WrbA  32.96 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2260  NADPH-dependent FMN reductase  31.79 
 
 		 270 aa  80.1  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  27.75 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1851  NADPH-dependent FMN reductase  40.32 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0492811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  34.88 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1441  NADPH-dependent FMN reductase  40.78 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  30.81 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1623  hypothetical protein  41.75 
 
 		 194 aa  77.4  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0413  NADPH-dependent FMN reductase  28.65 
 
 		 182 aa  77.4  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.72676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  40.78 
 
 		 191 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  37.24 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00930  NADPH-dependent FMN reductase  29.44 
 
 		 173 aa  76.3  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407777  normal  0.42644 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0449  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.17 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.536624  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0784  NADPH-dependent FMN reductase  28.09 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3523  NADPH-dependent FMN reductase  38.1 
 
 		 218 aa  74.7  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1043  NADPH-dependent FMN reductase  34.35 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.603654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2612  iron-sulfur flavoprotein  37.38 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2381  NADPH-dependent FMN reductase  40.59 
 
 		 195 aa  74.7  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.19679e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  29.85 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1677  EIF-4a family ATP-dependent RNA helicase  33.09 
 
 		 195 aa  74.3  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.42151  hitchhiker  0.000000240044 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0159  NADPH-dependent FMN reductase  36 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0166  NADPH-dependent FMN reductase  38.38 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3724  NADPH-dependent FMN reductase  38.1 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00781596  normal  0.326737 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0869  NADPH-dependent FMN reductase  37 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00401648  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1619  NADPH-dependent FMN reductase  37 
 
 		 179 aa  73.9  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  34 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0719  Multimeric flavodoxin WrbA-like protein  28.99 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.96421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1149  NADPH-dependent FMN reductase  35 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.285301  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1381  NADPH-dependent FMN reductase  36.19 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196943  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0414  NADPH-dependent FMN reductase  33.12 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0909  NADPH-dependent FMN reductase  36 
 
 		 206 aa  72  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0780942  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0275  NADPH-dependent FMN reductase  33.67 
 
 		 178 aa  72  0.000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1467  NADPH-dependent FMN reductase  37.14 
 
 		 216 aa  72  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  36.89 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1385  iron-sulfur flavoprotein  38.83 
 
 		 191 aa  71.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  37.86 
 
 		 208 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0870  NADPH-dependent FMN reductase  32.31 
 
 		 195 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000162046  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1505  NADPH-dependent FMN reductase  33.12 
 
 		 197 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1046  hypothetical protein  37.38 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.882215 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1638  NADPH-dependent FMN reductase  30.43 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0739804  normal  0.913531 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>