262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1104 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
206 aa  424  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1170  FMN reductase, NADPH-dependent  64.97 
 
 
207 aa  279  3e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  64.65 
 
 
205 aa  279  3e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  61.93 
 
 
204 aa  265  5e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1385  iron-sulfur flavoprotein  64.02 
 
 
191 aa  256  2e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0650  NADPH-dependent FMN reductase  61.9 
 
 
190 aa  247  7e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1637  NADPH-dependent FMN reductase  60.53 
 
 
191 aa  246  2e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0800599  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0991  NADPH-dependent FMN reductase  60.53 
 
 
199 aa  244  6e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.451509  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0277  NADPH-dependent FMN reductase  59.16 
 
 
199 aa  242  3e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1441  NADPH-dependent FMN reductase  54.69 
 
 
192 aa  225  3e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1487  NADPH-dependent FMN reductase  55.68 
 
 
198 aa  224  7e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.535714  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  51.58 
 
 
191 aa  220  9e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1043  NADPH-dependent FMN reductase  53.65 
 
 
192 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.603654  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1264  NADPH-dependent FMN reductase  55.56 
 
 
200 aa  218  3.9999999999999997e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.246056  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0325  NADPH-dependent FMN reductase  54.3 
 
 
188 aa  215  4e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1543  NADPH-dependent FMN reductase  53.44 
 
 
193 aa  215  5e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0882991  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2535  NADPH-dependent FMN reductase  53.48 
 
 
191 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.437841 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0109  NADPH-dependent FMN reductase  54.5 
 
 
191 aa  212  2.9999999999999995e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2925  NADPH-dependent FMN reductase  50.79 
 
 
193 aa  207  8e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000194359  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1623  hypothetical protein  51.58 
 
 
194 aa  206  1e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2979  NADPH-dependent FMN reductase  51.28 
 
 
204 aa  204  5e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.670971 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0017  NADPH-dependent FMN reductase  49.48 
 
 
194 aa  204  1e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1244  NADPH-dependent FMN reductase  52.11 
 
 
190 aa  193  1e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  48.15 
 
 
192 aa  191  6e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1057  NADPH-dependent FMN reductase  50.53 
 
 
190 aa  190  2e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.840292  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1029  iron-sulfur flavoprotein  50 
 
 
190 aa  188  5e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.343926  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1770  NADPH-dependent FMN reductase  53.97 
 
 
190 aa  186  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000383709  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1507  NADPH-dependent FMN reductase  50.26 
 
 
194 aa  184  8e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.569037  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0722  NADPH-dependent FMN reductase  45.99 
 
 
211 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.658969  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0301  NADPH-dependent FMN reductase  44 
 
 
211 aa  181  5.0000000000000004e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.354287  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0284  NADPH-dependent FMN reductase  44 
 
 
211 aa  179  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0179  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  44.39 
 
 
211 aa  175  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1959  NADPH-dependent FMN reductase  44 
 
 
211 aa  175  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.783003  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1058  NADPH-dependent FMN reductase  44.57 
 
 
192 aa  162  4.0000000000000004e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1178  NADPH-dependent FMN reductase  43.5 
 
 
223 aa  160  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0293  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 
208 aa  160  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000996855  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  36.68 
 
 
208 aa  155  4e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2381  NADPH-dependent FMN reductase  39.79 
 
 
195 aa  145  4.0000000000000006e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.19679e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11340  multimeric flavodoxin WrbA  42.47 
 
 
208 aa  140  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0797  hypothetical protein  41.67 
 
 
189 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000338584 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1487  NADPH-dependent FMN reductase  40.31 
 
 
207 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.22855  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0173  multimeric flavodoxin WrbA  37.31 
 
 
206 aa  138  4.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000913866  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0225  NADPH-dependent FMN reductase  35.87 
 
 
189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.545185  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0909  NADPH-dependent FMN reductase  36.51 
 
 
206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0780942  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0869  NADPH-dependent FMN reductase  36.51 
 
 
206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00401648  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0948  NADPH-dependent FMN reductase  41.49 
 
 
211 aa  122  4e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105461  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3584  NADPH-dependent FMN reductase  37.04 
 
 
212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000299171  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  38.27 
 
 
193 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  37.76 
 
 
193 aa  118  7e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1956  NADPH-dependent FMN reductase  37.31 
 
 
204 aa  117  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000522685  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2588  NADPH-dependent FMN reductase  37.31 
 
 
210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122146  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  37.76 
 
 
193 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1620  NADPH-dependent FMN reductase  39.36 
 
 
211 aa  115  6e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2419  NADPH-dependent FMN reductase  34.74 
 
 
189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.873931  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  35.42 
 
 
194 aa  111  9e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0316  NADPH-dependent FMN reductase  44.26 
 
 
212 aa  95.9  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  37.21 
 
 
187 aa  95.5  5e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  38.04 
 
 
193 aa  95.1  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  33.51 
 
 
193 aa  94.7  7e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1638  NADPH-dependent FMN reductase  33.52 
 
 
187 aa  92.8  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0739804  normal  0.913531 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
207 aa  92  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0321  NADPH-dependent FMN reductase  32.42 
 
 
197 aa  92  6e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.378386  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  30.77 
 
 
183 aa  90.1  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  30.65 
 
 
186 aa  87.8  9e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2377  NADPH-dependent FMN reductase  32.67 
 
 
209 aa  87.4  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000848109  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  31.18 
 
 
186 aa  86.3  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1442  NADPH-dependent FMN reductase  41.96 
 
 
217 aa  85.9  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  38.46 
 
 
217 aa  85.9  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  41.07 
 
 
217 aa  84.7  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  42.16 
 
 
206 aa  84.3  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0414  NADPH-dependent FMN reductase  30.85 
 
 
197 aa  84.3  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1505  NADPH-dependent FMN reductase  32.26 
 
 
197 aa  84  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  33.17 
 
 
211 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0252  iron-sulfur flavoprotein  32.39 
 
 
227 aa  84  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.488898  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2991  NADPH-dependent FMN reductase  34.09 
 
 
185 aa  83.2  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  41.44 
 
 
214 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0486  NADPH-dependent FMN reductase  29.67 
 
 
197 aa  82.8  0.000000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.260904  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1125  NADPH-dependent FMN reductase  38.39 
 
 
217 aa  82  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000715162  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  30.65 
 
 
186 aa  82  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0421  NADPH-dependent FMN reductase  32.8 
 
 
197 aa  80.9  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  42.16 
 
 
210 aa  80.9  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2580  iron-sulfur flavoprotein  37.96 
 
 
222 aa  80.1  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29861  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  41.18 
 
 
186 aa  80.5  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2330  NADPH-dependent FMN reductase  40.65 
 
 
224 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  0.0193614 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0413  NADPH-dependent FMN reductase  28.11 
 
 
182 aa  80.1  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.72676  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  33.77 
 
 
223 aa  79.3  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0549  NADPH-dependent FMN reductase  33.95 
 
 
199 aa  79.3  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0163  NADPH-dependent FMN reductase  36.24 
 
 
195 aa  78.6  0.00000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1149  NADPH-dependent FMN reductase  42.16 
 
 
208 aa  79  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.285301  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  39.64 
 
 
214 aa  78.6  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1029  NADPH-dependent FMN reductase  34.97 
 
 
222 aa  78.2  0.00000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.153649  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1498  NADPH-dependent FMN reductase  29.47 
 
 
185 aa  76.6  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0755  NADPH-dependent FMN reductase  32.11 
 
 
213 aa  76.6  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.263848  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3773  NADPH-dependent FMN reductase  33.5 
 
 
220 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.65168  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  38.24 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  35.12 
 
 
221 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  37.24 
 
 
220 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0018  NADPH-dependent FMN reductase  36.7 
 
 
228 aa  75.9  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0357  hypothetical protein  34.11 
 
 
211 aa  75.5  0.0000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1676  hypothetical protein  37.86 
 
 
200 aa  75.5  0.0000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  hitchhiker  0.000000298375 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>