247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0284 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0284  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
211 aa  440  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0301  NADPH-dependent FMN reductase  97.63 
 
 
211 aa  432  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.354287  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0179  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  73.93 
 
 
211 aa  339  2e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0722  NADPH-dependent FMN reductase  69.19 
 
 
211 aa  321  4e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.658969  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1959  NADPH-dependent FMN reductase  60.19 
 
 
211 aa  290  1e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.783003  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1178  NADPH-dependent FMN reductase  60.66 
 
 
223 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0293  NADPH-dependent FMN reductase  56.4 
 
 
208 aa  256  1e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000996855  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  46.45 
 
 
208 aa  216  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1385  iron-sulfur flavoprotein  52.41 
 
 
191 aa  209  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0869  NADPH-dependent FMN reductase  50 
 
 
206 aa  207  1e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00401648  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0909  NADPH-dependent FMN reductase  49.06 
 
 
206 aa  206  3e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0780942  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0650  NADPH-dependent FMN reductase  49.2 
 
 
190 aa  196  3e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0325  NADPH-dependent FMN reductase  48.11 
 
 
188 aa  193  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1487  NADPH-dependent FMN reductase  44.39 
 
 
207 aa  192  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.22855  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1543  NADPH-dependent FMN reductase  46.56 
 
 
193 aa  193  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0882991  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2925  NADPH-dependent FMN reductase  47.59 
 
 
193 aa  192  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000194359  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  48.17 
 
 
192 aa  190  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1441  NADPH-dependent FMN reductase  49.47 
 
 
192 aa  189  2.9999999999999997e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2588  NADPH-dependent FMN reductase  45.54 
 
 
210 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122146  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  44.74 
 
 
191 aa  188  4e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0173  multimeric flavodoxin WrbA  41.71 
 
 
206 aa  189  4e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000913866  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1043  NADPH-dependent FMN reductase  48.66 
 
 
192 aa  187  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.603654  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3584  NADPH-dependent FMN reductase  44.86 
 
 
212 aa  185  4e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000299171  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1264  NADPH-dependent FMN reductase  45.99 
 
 
200 aa  185  5e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.246056  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1487  NADPH-dependent FMN reductase  45.16 
 
 
198 aa  184  6e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.535714  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2535  NADPH-dependent FMN reductase  43.92 
 
 
191 aa  184  9e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.437841 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0277  NADPH-dependent FMN reductase  44.74 
 
 
199 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1637  NADPH-dependent FMN reductase  44.5 
 
 
191 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0800599  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0991  NADPH-dependent FMN reductase  43.98 
 
 
199 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.451509  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0017  NADPH-dependent FMN reductase  49.48 
 
 
194 aa  182  4.0000000000000006e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1057  NADPH-dependent FMN reductase  45.45 
 
 
190 aa  181  9.000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.840292  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1029  iron-sulfur flavoprotein  44.39 
 
 
190 aa  180  1e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.343926  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0109  NADPH-dependent FMN reductase  43.32 
 
 
191 aa  180  1e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  44 
 
 
206 aa  179  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1623  hypothetical protein  46.81 
 
 
194 aa  180  2e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2979  NADPH-dependent FMN reductase  46.34 
 
 
204 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.670971 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0948  NADPH-dependent FMN reductase  45.54 
 
 
211 aa  179  2.9999999999999997e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105461  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1244  NADPH-dependent FMN reductase  45.99 
 
 
190 aa  178  5.999999999999999e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1956  NADPH-dependent FMN reductase  42.65 
 
 
204 aa  176  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000522685  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1620  NADPH-dependent FMN reductase  45.54 
 
 
211 aa  176  3e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1507  NADPH-dependent FMN reductase  46.88 
 
 
194 aa  175  4e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.569037  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1170  FMN reductase, NADPH-dependent  43.65 
 
 
207 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1770  NADPH-dependent FMN reductase  44.92 
 
 
190 aa  170  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000383709  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11340  multimeric flavodoxin WrbA  41.23 
 
 
208 aa  168  7e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  42 
 
 
204 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2381  NADPH-dependent FMN reductase  41.54 
 
 
195 aa  163  1.0000000000000001e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.19679e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  42.64 
 
 
205 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0797  hypothetical protein  39.04 
 
 
189 aa  131  9e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000338584 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0225  NADPH-dependent FMN reductase  38.17 
 
 
189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.545185  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1058  NADPH-dependent FMN reductase  34.43 
 
 
192 aa  122  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  34.54 
 
 
193 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  34.54 
 
 
193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  34.02 
 
 
193 aa  107  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2419  NADPH-dependent FMN reductase  31.58 
 
 
189 aa  104  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.873931  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  30.3 
 
 
194 aa  104  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  29.23 
 
 
186 aa  89.7  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  28.21 
 
 
186 aa  87.8  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  30.96 
 
 
193 aa  87.4  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  28.21 
 
 
186 aa  86.3  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  28.18 
 
 
217 aa  83.6  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0630  NADPH-dependent FMN reductase  29.59 
 
 
233 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0374  NADPH-dependent FMN reductase  32.17 
 
 
188 aa  82  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.4772 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1381  NADPH-dependent FMN reductase  36.11 
 
 
216 aa  81.6  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196943  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1442  NADPH-dependent FMN reductase  34.26 
 
 
217 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  37.59 
 
 
187 aa  80.1  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  30.73 
 
 
186 aa  80.5  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1467  NADPH-dependent FMN reductase  32.85 
 
 
216 aa  79.3  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  34.26 
 
 
217 aa  79.7  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1125  NADPH-dependent FMN reductase  26.92 
 
 
217 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000715162  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  30.81 
 
 
223 aa  79.3  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2580  iron-sulfur flavoprotein  34.26 
 
 
222 aa  78.6  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29861  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0316  NADPH-dependent FMN reductase  34.15 
 
 
212 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1505  NADPH-dependent FMN reductase  31.22 
 
 
197 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  34.26 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  32.32 
 
 
193 aa  77  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
214 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  34.62 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1799  NADPH-dependent FMN reductase  33.88 
 
 
216 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0521  NADPH-dependent FMN reductase  34.23 
 
 
217 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  31.37 
 
 
207 aa  75.1  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3724  NADPH-dependent FMN reductase  37.9 
 
 
213 aa  74.7  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00781596  normal  0.326737 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1046  hypothetical protein  36.94 
 
 
187 aa  74.7  0.0000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.882215 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  32.07 
 
 
221 aa  74.3  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0414  NADPH-dependent FMN reductase  31.22 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  29.32 
 
 
182 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3700  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
167 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.438401  normal  0.207291 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0421  NADPH-dependent FMN reductase  30.16 
 
 
197 aa  73.2  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0018  NADPH-dependent FMN reductase  31.13 
 
 
228 aa  72.4  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0321  NADPH-dependent FMN reductase  28.34 
 
 
197 aa  72.4  0.000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.378386  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  24.87 
 
 
183 aa  72.4  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3523  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
218 aa  71.6  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0870  NADPH-dependent FMN reductase  29.03 
 
 
195 aa  71.6  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000162046  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0486  NADPH-dependent FMN reductase  27.81 
 
 
197 aa  71.6  0.000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.260904  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2732  NADPH-dependent FMN reductase  31.25 
 
 
209 aa  71.2  0.000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1072  NADPH-dependent FMN reductase  31.08 
 
 
212 aa  71.2  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  34.62 
 
 
211 aa  71.2  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1102  iron-sulfur flavoprotein  33.94 
 
 
182 aa  71.2  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000321891  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2377  NADPH-dependent FMN reductase  28.34 
 
 
209 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000848109  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1508  NADPH-dependent FMN reductase  36.45 
 
 
216 aa  69.7  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.25275  decreased coverage  0.00823646 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  32.98 
 
 
220 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>