250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0301 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0301  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 		 211 aa  441  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.354287  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0284  NADPH-dependent FMN reductase  97.63 
 
 		 211 aa  432  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0179  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  72.51 
 
 		 211 aa  334  7e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0722  NADPH-dependent FMN reductase  68.25 
 
 		 211 aa  318  5e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.658969  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1959  NADPH-dependent FMN reductase  59.72 
 
 		 211 aa  291  4e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.783003  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1178  NADPH-dependent FMN reductase  61.14 
 
 		 223 aa  285  2.9999999999999996e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0293  NADPH-dependent FMN reductase  56.4 
 
 		 208 aa  259  1e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000996855  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  47.39 
 
 		 208 aa  221  7e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1385  iron-sulfur flavoprotein  51.87 
 
 		 191 aa  207  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0869  NADPH-dependent FMN reductase  49.06 
 
 		 206 aa  205  4e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00401648  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0909  NADPH-dependent FMN reductase  48.11 
 
 		 206 aa  202  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0780942  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0650  NADPH-dependent FMN reductase  49.2 
 
 		 190 aa  194  8.000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1487  NADPH-dependent FMN reductase  43.93 
 
 		 207 aa  193  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.22855  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1543  NADPH-dependent FMN reductase  46.03 
 
 		 193 aa  192  3e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0882991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0325  NADPH-dependent FMN reductase  47.03 
 
 		 188 aa  191  5e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  48.17 
 
 		 192 aa  189  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2588  NADPH-dependent FMN reductase  46.48 
 
 		 210 aa  189  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122146  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2925  NADPH-dependent FMN reductase  45.99 
 
 		 193 aa  187  8e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000194359  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3584  NADPH-dependent FMN reductase  45.33 
 
 		 212 aa  187  8e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000299171  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1441  NADPH-dependent FMN reductase  48.94 
 
 		 192 aa  187  9e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1264  NADPH-dependent FMN reductase  44.33 
 
 		 200 aa  186  2e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.246056  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1043  NADPH-dependent FMN reductase  48.13 
 
 		 192 aa  186  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.603654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  43.68 
 
 		 191 aa  186  3e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1487  NADPH-dependent FMN reductase  44.62 
 
 		 198 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.535714  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0277  NADPH-dependent FMN reductase  44.21 
 
 		 199 aa  182  3e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  44 
 
 		 206 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2535  NADPH-dependent FMN reductase  42.86 
 
 		 191 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.437841 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0991  NADPH-dependent FMN reductase  43.68 
 
 		 199 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.451509  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0173  multimeric flavodoxin WrbA  39.81 
 
 		 206 aa  181  7e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000913866  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1637  NADPH-dependent FMN reductase  43.68 
 
 		 191 aa  181  8.000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0800599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2979  NADPH-dependent FMN reductase  46.34 
 
 		 204 aa  181  8.000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.670971 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0017  NADPH-dependent FMN reductase  47.94 
 
 		 194 aa  179  2e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1956  NADPH-dependent FMN reductase  43.6 
 
 		 204 aa  179  2.9999999999999997e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000522685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0109  NADPH-dependent FMN reductase  42.25 
 
 		 191 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0948  NADPH-dependent FMN reductase  46.48 
 
 		 211 aa  179  4e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1623  hypothetical protein  45.74 
 
 		 194 aa  179  4e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1057  NADPH-dependent FMN reductase  44.39 
 
 		 190 aa  179  4e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.840292  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1029  iron-sulfur flavoprotein  43.32 
 
 		 190 aa  178  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.343926  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1244  NADPH-dependent FMN reductase  44.92 
 
 		 190 aa  176  3e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1620  NADPH-dependent FMN reductase  46.95 
 
 		 211 aa  176  3e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1507  NADPH-dependent FMN reductase  46.35 
 
 		 194 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.569037  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1770  NADPH-dependent FMN reductase  44.39 
 
 		 190 aa  171  6.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000383709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11340  multimeric flavodoxin WrbA  42.18 
 
 		 208 aa  171  1e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1170  FMN reductase, NADPH-dependent  44.32 
 
 		 207 aa  167  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  41.5 
 
 		 204 aa  164  6.9999999999999995e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  42.13 
 
 		 205 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2381  NADPH-dependent FMN reductase  40.51 
 
 		 195 aa  159  3e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.19679e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0797  hypothetical protein  37.97 
 
 		 189 aa  129  3e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000338584 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0225  NADPH-dependent FMN reductase  37.1 
 
 		 189 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.545185  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1058  NADPH-dependent FMN reductase  33.88 
 
 		 192 aa  121  7e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  34.02 
 
 		 193 aa  108  5e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  34.02 
 
 		 193 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  30.81 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  33.51 
 
 		 193 aa  105  6e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2419  NADPH-dependent FMN reductase  30.53 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.873931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  29.23 
 
 		 186 aa  90.1  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  28.21 
 
 		 186 aa  87.8  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  28.21 
 
 		 186 aa  87.8  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0630  NADPH-dependent FMN reductase  30.61 
 
 		 233 aa  87.8  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  30.96 
 
 		 193 aa  86.7  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  28.73 
 
 		 217 aa  84.3  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1381  NADPH-dependent FMN reductase  36.11 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196943  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1442  NADPH-dependent FMN reductase  34.26 
 
 		 217 aa  81.3  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1467  NADPH-dependent FMN reductase  37.04 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1125  NADPH-dependent FMN reductase  31.54 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000715162  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0374  NADPH-dependent FMN reductase  31.47 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.4772 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  34.26 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  36.88 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  30.27 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2580  iron-sulfur flavoprotein  34.26 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29861  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 217 aa  77.8  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  30.17 
 
 		 186 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1505  NADPH-dependent FMN reductase  31.75 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0316  NADPH-dependent FMN reductase  34.91 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  34.62 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0521  NADPH-dependent FMN reductase  34.23 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  31.47 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1799  NADPH-dependent FMN reductase  34.82 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3724  NADPH-dependent FMN reductase  38.71 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00781596  normal  0.326737 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1046  hypothetical protein  36.94 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.882215 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  30.26 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  25.4 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  29.32 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3700  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.438401  normal  0.207291 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2732  NADPH-dependent FMN reductase  31.25 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  31.52 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0414  NADPH-dependent FMN reductase  30.69 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3523  NADPH-dependent FMN reductase  26.9 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0018  NADPH-dependent FMN reductase  31.13 
 
 		 228 aa  72  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0321  NADPH-dependent FMN reductase  27.81 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.378386  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1102  iron-sulfur flavoprotein  33.94 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000321891  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0421  NADPH-dependent FMN reductase  29.63 
 
 		 197 aa  71.2  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  34.62 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0486  NADPH-dependent FMN reductase  27.27 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.260904  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00930  NADPH-dependent FMN reductase  32.69 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407777  normal  0.42644 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  32 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1072  NADPH-dependent FMN reductase  30.41 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2377  NADPH-dependent FMN reductase  28.34 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000848109  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1130  NADPH-dependent FMN reductase  34.86 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>