246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2475 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
217 aa  454  1e-127  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1442  NADPH-dependent FMN reductase  70.7 
 
 
217 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  69.77 
 
 
217 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  71.09 
 
 
214 aa  323  1e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  69.19 
 
 
214 aa  320  9.999999999999999e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0018  NADPH-dependent FMN reductase  69.86 
 
 
228 aa  319  3e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3523  NADPH-dependent FMN reductase  64.22 
 
 
218 aa  289  3e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1508  NADPH-dependent FMN reductase  63.21 
 
 
216 aa  288  6e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.25275  decreased coverage  0.00823646 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2580  iron-sulfur flavoprotein  61.03 
 
 
222 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29861  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0521  NADPH-dependent FMN reductase  56.54 
 
 
217 aa  264  7e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1381  NADPH-dependent FMN reductase  54.03 
 
 
216 aa  248  6e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196943  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2097  NADPH-dependent FMN reductase  55.35 
 
 
236 aa  246  2e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1467  NADPH-dependent FMN reductase  52.8 
 
 
216 aa  238  4e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1125  NADPH-dependent FMN reductase  51.66 
 
 
217 aa  234  6e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000715162  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1799  NADPH-dependent FMN reductase  51.39 
 
 
216 aa  227  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0357  hypothetical protein  37.74 
 
 
211 aa  148  6e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1522  NADPH-dependent FMN reductase  37.62 
 
 
212 aa  142  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00760  hypothetical protein  39.07 
 
 
211 aa  134  9e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.62232  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  43.44 
 
 
186 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  41.8 
 
 
185 aa  105  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2213  NADPH-dependent FMN reductase  40.54 
 
 
189 aa  98.6  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1676  hypothetical protein  39.83 
 
 
200 aa  96.7  3e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  hitchhiker  0.000000298375 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0893  NADPH-dependent FMN reductase  36.52 
 
 
200 aa  93.6  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  41.35 
 
 
193 aa  92  5e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  40.57 
 
 
182 aa  92  6e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  41.35 
 
 
193 aa  91.7  8e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0772  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  33.57 
 
 
193 aa  90.9  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.806618  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3622  NADPH-dependent FMN reductase  34.15 
 
 
191 aa  90.9  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  41.35 
 
 
193 aa  91.3  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  42.45 
 
 
206 aa  90.1  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  36.92 
 
 
191 aa  89.7  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0671  NADPH-dependent FMN reductase  42.06 
 
 
239 aa  89.4  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.610211 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  41.44 
 
 
207 aa  89  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  37.69 
 
 
205 aa  88.2  9e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  42.45 
 
 
211 aa  87.8  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  34.75 
 
 
194 aa  87.8  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0374  NADPH-dependent FMN reductase  34.53 
 
 
188 aa  87.8  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.4772 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0722  NADPH-dependent FMN reductase  32.31 
 
 
211 aa  87.8  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.658969  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  38.68 
 
 
223 aa  87  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  40.95 
 
 
204 aa  87  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  44.34 
 
 
221 aa  86.3  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0158  NADPH-dependent FMN reductase  39.42 
 
 
206 aa  86.7  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  38.46 
 
 
206 aa  85.9  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0109  NADPH-dependent FMN reductase  42.86 
 
 
191 aa  85.9  5e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  38.68 
 
 
212 aa  85.1  6e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1498  NADPH-dependent FMN reductase  38.68 
 
 
185 aa  85.1  8e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1441  NADPH-dependent FMN reductase  35.38 
 
 
192 aa  84.7  9e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2997  NADPH-dependent FMN reductase  38.1 
 
 
184 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0315889  normal  0.693807 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1623  hypothetical protein  41.67 
 
 
194 aa  83.6  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0316  NADPH-dependent FMN reductase  38.26 
 
 
212 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0650  NADPH-dependent FMN reductase  34.88 
 
 
190 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1149  NADPH-dependent FMN reductase  38.68 
 
 
208 aa  83.6  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.285301  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2261  NADPH-dependent FMN reductase  40.57 
 
 
222 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  0.127615 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2120  NADPH-dependent FMN reductase  36.89 
 
 
208 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0276138  normal  0.10387 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0727  NADPH-dependent FMN reductase  32.46 
 
 
204 aa  83.2  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  38.68 
 
 
210 aa  83.6  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2330  NADPH-dependent FMN reductase  36.79 
 
 
224 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  0.0193614 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1241  NADPH-dependent FMN reductase  32.87 
 
 
189 aa  83.2  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1046  hypothetical protein  34.91 
 
 
187 aa  82.4  0.000000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.882215 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1637  NADPH-dependent FMN reductase  34.85 
 
 
191 aa  82.4  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0800599  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1170  FMN reductase, NADPH-dependent  36.15 
 
 
207 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0408  NADPH-dependent FMN reductase  38.68 
 
 
225 aa  80.9  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0076  NADPH-dependent FMN reductase  29.41 
 
 
202 aa  80.9  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.399945  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0125  NADPH-dependent FMN reductase  35.92 
 
 
190 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  34.62 
 
 
193 aa  80.1  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  39.05 
 
 
220 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1507  NADPH-dependent FMN reductase  39.25 
 
 
194 aa  80.5  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.569037  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0632  NADPH-dependent FMN reductase  35.43 
 
 
201 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2272  NADPH-dependent FMN reductase  39.62 
 
 
197 aa  80.5  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1487  NADPH-dependent FMN reductase  36.64 
 
 
198 aa  80.1  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.535714  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1392  NADPH-dependent FMN reductase  39.22 
 
 
201 aa  80.1  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0284  NADPH-dependent FMN reductase  34.26 
 
 
211 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1371  NADPH-dependent FMN reductase  35.58 
 
 
190 aa  79.3  0.00000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0130  NADPH-dependent FMN reductase  34.19 
 
 
224 aa  79.3  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0017  NADPH-dependent FMN reductase  33.86 
 
 
194 aa  79  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0309  NADPH-dependent FMN reductase  26.46 
 
 
212 aa  78.6  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0301  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
211 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.354287  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1385  iron-sulfur flavoprotein  35.38 
 
 
191 aa  77.8  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1770  NADPH-dependent FMN reductase  36.29 
 
 
190 aa  77.8  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000383709  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3773  NADPH-dependent FMN reductase  37.14 
 
 
220 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.65168  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1584  NADPH-dependent FMN reductase  37.74 
 
 
220 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  37.27 
 
 
183 aa  77.8  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0748  iron-sulfur flavoprotein  37.76 
 
 
195 aa  77  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.203042 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  38.1 
 
 
192 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00930  NADPH-dependent FMN reductase  29.27 
 
 
173 aa  77  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407777  normal  0.42644 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1182  NADPH-dependent FMN reductase  34.62 
 
 
190 aa  77  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000238882  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1043  NADPH-dependent FMN reductase  33.85 
 
 
192 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.603654  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1620  NADPH-dependent FMN reductase  36.45 
 
 
211 aa  76.6  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1029  NADPH-dependent FMN reductase  35.85 
 
 
222 aa  77.4  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.153649  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0991  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
199 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.451509  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0293  NADPH-dependent FMN reductase  33.07 
 
 
208 aa  76.6  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000996855  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  30.43 
 
 
208 aa  76.3  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0325  NADPH-dependent FMN reductase  40.38 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0277  NADPH-dependent FMN reductase  32.58 
 
 
199 aa  76.6  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1152  NADPH-dependent FMN reductase  34.62 
 
 
190 aa  76.3  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000059068  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3305  iron-sulfur flavoprotein  38.68 
 
 
222 aa  75.9  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.328284  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0179  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
211 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1959  NADPH-dependent FMN reductase  33.08 
 
 
211 aa  75.5  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.783003  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0797  hypothetical protein  37.86 
 
 
189 aa  75.5  0.0000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000338584 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1058  NADPH-dependent FMN reductase  35.25 
 
 
192 aa  74.3  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>