266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1029 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1029  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
222 aa  458  9.999999999999999e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.153649  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1584  NADPH-dependent FMN reductase  57.99 
 
 
220 aa  265  2.9999999999999995e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2261  NADPH-dependent FMN reductase  55.71 
 
 
222 aa  258  7e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  0.127615 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3305  iron-sulfur flavoprotein  54.3 
 
 
222 aa  256  1e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.328284  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0408  NADPH-dependent FMN reductase  52.97 
 
 
225 aa  251  6e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2482  NADPH-dependent FMN reductase  52.05 
 
 
222 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.801364  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  46.12 
 
 
223 aa  211  5.999999999999999e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1626  NADPH-dependent FMN reductase  49.77 
 
 
220 aa  210  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.65491  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1442  NADPH-dependent FMN reductase  46.61 
 
 
224 aa  197  9e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.103462  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  46.61 
 
 
221 aa  193  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2330  NADPH-dependent FMN reductase  40.27 
 
 
224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  0.0193614 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1815  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  42.79 
 
 
224 aa  180  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0938  NADPH-dependent FMN reductase  39.27 
 
 
220 aa  149  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  36.28 
 
 
220 aa  148  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3773  NADPH-dependent FMN reductase  36.28 
 
 
220 aa  148  5e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.65168  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1498  NADPH-dependent FMN reductase  40.76 
 
 
185 aa  97.1  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0130  NADPH-dependent FMN reductase  39.29 
 
 
224 aa  95.1  7e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0316  NADPH-dependent FMN reductase  33.5 
 
 
212 aa  93.6  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1441  NADPH-dependent FMN reductase  37.16 
 
 
192 aa  91.3  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0857  NADPH-dependent FMN reductase  29.26 
 
 
262 aa  90.5  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0374  NADPH-dependent FMN reductase  32.42 
 
 
188 aa  90.5  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.4772 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  41.94 
 
 
207 aa  90.1  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1043  NADPH-dependent FMN reductase  35.81 
 
 
192 aa  88.2  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.603654  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  32.05 
 
 
182 aa  86.7  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1851  NADPH-dependent FMN reductase  41.96 
 
 
204 aa  87  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0492811  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  38.89 
 
 
192 aa  85.9  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  37.19 
 
 
193 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  44 
 
 
211 aa  84  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00930  NADPH-dependent FMN reductase  41.67 
 
 
173 aa  83.2  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407777  normal  0.42644 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0158  NADPH-dependent FMN reductase  39.55 
 
 
206 aa  83.2  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0671  NADPH-dependent FMN reductase  38.89 
 
 
239 aa  82.4  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.610211 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  41 
 
 
193 aa  82  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
186 aa  82  0.000000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  41 
 
 
193 aa  81.6  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1623  hypothetical protein  29.47 
 
 
194 aa  80.9  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 
193 aa  80.5  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2629  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.54 
 
 
344 aa  80.9  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  29.44 
 
 
183 aa  80.1  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  34.92 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  44.55 
 
 
212 aa  80.1  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 
194 aa  79.7  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  38.03 
 
 
205 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0414  NADPH-dependent FMN reductase  34.27 
 
 
197 aa  79  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2272  NADPH-dependent FMN reductase  42.16 
 
 
197 aa  79  0.00000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0672  NADPH-dependent FMN reductase  35.45 
 
 
263 aa  79  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.594291 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0076  NADPH-dependent FMN reductase  41 
 
 
202 aa  78.6  0.00000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.399945  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1505  NADPH-dependent FMN reductase  37.78 
 
 
197 aa  78.6  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3707  NADPH-dependent FMN reductase  39.52 
 
 
208 aa  78.6  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0930977 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0321  NADPH-dependent FMN reductase  32.09 
 
 
197 aa  78.2  0.00000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.378386  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1676  hypothetical protein  29.59 
 
 
200 aa  78.6  0.00000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  hitchhiker  0.000000298375 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0017  NADPH-dependent FMN reductase  32.29 
 
 
194 aa  78.2  0.00000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  34.97 
 
 
206 aa  77.8  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1264  NADPH-dependent FMN reductase  33.87 
 
 
200 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.246056  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  33.11 
 
 
187 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0163  NADPH-dependent FMN reductase  33.78 
 
 
195 aa  77.8  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1046  hypothetical protein  42.72 
 
 
187 aa  78.2  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.882215 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2817  NADPH-dependent FMN reductase  31.62 
 
 
194 aa  77  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  29.53 
 
 
210 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  35.85 
 
 
217 aa  77  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2732  NADPH-dependent FMN reductase  38 
 
 
209 aa  76.6  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  33.8 
 
 
204 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  39.6 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  35.21 
 
 
208 aa  76.3  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2260  NADPH-dependent FMN reductase  32.47 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0748  iron-sulfur flavoprotein  41.05 
 
 
195 aa  75.5  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.203042 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3523  NADPH-dependent FMN reductase  35.85 
 
 
218 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2381  NADPH-dependent FMN reductase  30.99 
 
 
195 aa  75.5  0.0000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.19679e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  35.85 
 
 
214 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  31.54 
 
 
193 aa  75.1  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1638  NADPH-dependent FMN reductase  31.82 
 
 
187 aa  75.1  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0739804  normal  0.913531 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1385  iron-sulfur flavoprotein  33.1 
 
 
191 aa  74.7  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0486  NADPH-dependent FMN reductase  35.34 
 
 
197 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.260904  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1244  NADPH-dependent FMN reductase  31.22 
 
 
190 aa  73.9  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0521  NADPH-dependent FMN reductase  33.87 
 
 
217 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1149  NADPH-dependent FMN reductase  29.02 
 
 
208 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.285301  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0954  NADPH-dependent FMN reductase  35.29 
 
 
184 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1241  NADPH-dependent FMN reductase  41.35 
 
 
189 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0413  NADPH-dependent FMN reductase  28.09 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.72676  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  34.91 
 
 
214 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0275  NADPH-dependent FMN reductase  37.76 
 
 
178 aa  72.8  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2849  NADPH-dependent FMN reductase  42 
 
 
192 aa  72.8  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  28.42 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1507  NADPH-dependent FMN reductase  33.14 
 
 
194 aa  72.8  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.569037  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1543  NADPH-dependent FMN reductase  28.35 
 
 
193 aa  72.4  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0882991  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3016  iron-sulfur flavoprotein  44.83 
 
 
93 aa  72.4  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.718636  normal  0.0259997 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3039  NADPH-dependent FMN reductase  31.58 
 
 
202 aa  72  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.301206 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1492  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.24 
 
 
540 aa  72.4  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  35 
 
 
186 aa  72  0.000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1108  NADPH-dependent FMN reductase  29.17 
 
 
252 aa  72  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18210  NADPH-dependent FMN reductase  33.7 
 
 
177 aa  71.2  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0784  NADPH-dependent FMN reductase  32.96 
 
 
179 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0487  NADPH-dependent FMN reductase  31.98 
 
 
199 aa  70.9  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.671634  normal  0.453927 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0650  NADPH-dependent FMN reductase  31.91 
 
 
190 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0018  NADPH-dependent FMN reductase  33.65 
 
 
228 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1188  NADPH-dependent FMN reductase  37.37 
 
 
180 aa  71.2  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.646638 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0677  iron-sulfur flavoprotein  36.45 
 
 
250 aa  70.1  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1467  NADPH-dependent FMN reductase  33.88 
 
 
216 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0421  NADPH-dependent FMN reductase  35.56 
 
 
197 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  33.02 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2647  NADPH-dependent FMN reductase  32.68 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000475353  normal  0.334507 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>