298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0772 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0772  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  100 
 
 
193 aa  396  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.806618  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2213  NADPH-dependent FMN reductase  66.49 
 
 
189 aa  277  8e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0125  NADPH-dependent FMN reductase  68.95 
 
 
190 aa  256  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0893  NADPH-dependent FMN reductase  54.26 
 
 
200 aa  212  2.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3622  NADPH-dependent FMN reductase  54.21 
 
 
191 aa  201  4e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  38.61 
 
 
185 aa  119  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  33.7 
 
 
182 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1241  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 
189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0748  iron-sulfur flavoprotein  34.25 
 
 
195 aa  105  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.203042 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  30.53 
 
 
186 aa  100  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0374  NADPH-dependent FMN reductase  32.98 
 
 
188 aa  95.5  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.4772 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  36.25 
 
 
214 aa  95.5  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 
214 aa  94  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0018  NADPH-dependent FMN reductase  36.17 
 
 
228 aa  94  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2997  NADPH-dependent FMN reductase  30.65 
 
 
184 aa  92.4  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0315889  normal  0.693807 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0158  NADPH-dependent FMN reductase  35.9 
 
 
206 aa  92.8  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  33.57 
 
 
217 aa  90.9  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1486  NADPH-dependent FMN reductase  32.98 
 
 
200 aa  87  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0954  NADPH-dependent FMN reductase  32.81 
 
 
184 aa  86.3  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00930  NADPH-dependent FMN reductase  33.72 
 
 
173 aa  86.3  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407777  normal  0.42644 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1125  NADPH-dependent FMN reductase  32.62 
 
 
217 aa  85.5  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000715162  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0309  NADPH-dependent FMN reductase  32.28 
 
 
212 aa  85.5  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2732  NADPH-dependent FMN reductase  29.75 
 
 
209 aa  84.3  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1676  hypothetical protein  30.21 
 
 
200 aa  84  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  hitchhiker  0.000000298375 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0521  NADPH-dependent FMN reductase  39.09 
 
 
217 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  30.39 
 
 
217 aa  83.6  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0076  NADPH-dependent FMN reductase  28.8 
 
 
202 aa  82.4  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.399945  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1498  NADPH-dependent FMN reductase  31.58 
 
 
185 aa  82.4  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1467  NADPH-dependent FMN reductase  32.54 
 
 
216 aa  81.6  0.000000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1381  NADPH-dependent FMN reductase  32.14 
 
 
216 aa  79.7  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196943  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2580  iron-sulfur flavoprotein  33.64 
 
 
222 aa  79.3  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29861  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1619  NADPH-dependent FMN reductase  30.41 
 
 
179 aa  79.7  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1442  NADPH-dependent FMN reductase  31.37 
 
 
217 aa  79  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1149  NADPH-dependent FMN reductase  32.69 
 
 
208 aa  79  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.285301  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3523  NADPH-dependent FMN reductase  30.5 
 
 
218 aa  79  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2097  NADPH-dependent FMN reductase  34.01 
 
 
236 aa  78.2  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  31.73 
 
 
210 aa  77.8  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3468  multimeric flavodoxin WrbA family protein  28.95 
 
 
183 aa  77  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.177131  decreased coverage  0.000563166 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  35.29 
 
 
193 aa  77.4  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1046  hypothetical protein  34.26 
 
 
187 aa  76.3  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.882215 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0727  NADPH-dependent FMN reductase  32.86 
 
 
204 aa  76.3  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  36.63 
 
 
194 aa  75.5  0.0000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18130  NADPH-dependent FMN reductase  34.33 
 
 
172 aa  75.5  0.0000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.340395  normal  0.960689 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1799  NADPH-dependent FMN reductase  27.67 
 
 
216 aa  74.7  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1131  hypothetical protein  28.34 
 
 
179 aa  74.3  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0988  NADPH-dependent FMN reductase  41.41 
 
 
294 aa  74.3  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.327411  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  33.65 
 
 
211 aa  73.9  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  34.65 
 
 
193 aa  73.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  34.65 
 
 
193 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2535  NADPH-dependent FMN reductase  37.86 
 
 
191 aa  73.2  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.437841 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0133  NADPH-dependent FMN reductase  33.93 
 
 
191 aa  73.6  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000492716  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  34.65 
 
 
193 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1507  NADPH-dependent FMN reductase  37 
 
 
194 aa  73.2  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.569037  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1320  NADPH-dependent FMN reductase  32.32 
 
 
179 aa  72.8  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.654727  normal  0.0975932 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  29.02 
 
 
183 aa  70.5  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  34.26 
 
 
186 aa  70.5  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  31.4 
 
 
208 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0784  NADPH-dependent FMN reductase  29.22 
 
 
179 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18210  NADPH-dependent FMN reductase  27.81 
 
 
177 aa  69.7  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1508  NADPH-dependent FMN reductase  30.5 
 
 
216 aa  70.5  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.25275  decreased coverage  0.00823646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1058  NADPH-dependent FMN reductase  37 
 
 
192 aa  69.3  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1638  NADPH-dependent FMN reductase  27.08 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0739804  normal  0.913531 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1677  EIF-4a family ATP-dependent RNA helicase  28.75 
 
 
195 aa  68.9  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.42151  hitchhiker  0.000000240044 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  24.1 
 
 
206 aa  68.9  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1487  NADPH-dependent FMN reductase  32.28 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.22855  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0017  NADPH-dependent FMN reductase  37 
 
 
194 aa  68.6  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0722  NADPH-dependent FMN reductase  31.73 
 
 
211 aa  68.2  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.658969  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2659  NADPH-dependent FMN reductase  30.43 
 
 
205 aa  68.2  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.385785 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2817  NADPH-dependent FMN reductase  29.17 
 
 
194 aa  67.8  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0671  NADPH-dependent FMN reductase  33.94 
 
 
239 aa  67.4  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.610211 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0632  NADPH-dependent FMN reductase  32.12 
 
 
201 aa  67  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0277  NADPH-dependent FMN reductase  32.35 
 
 
199 aa  65.9  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2330  NADPH-dependent FMN reductase  36.63 
 
 
224 aa  66.2  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  0.0193614 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  32.69 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2272  NADPH-dependent FMN reductase  30.08 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2120  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
208 aa  65.5  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0276138  normal  0.10387 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0109  NADPH-dependent FMN reductase  35.29 
 
 
191 aa  65.5  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0080  NADPH-dependent FMN reductase  33.64 
 
 
201 aa  65.1  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  31.37 
 
 
191 aa  65.5  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1623  hypothetical protein  32.04 
 
 
194 aa  65.1  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00760  hypothetical protein  34.51 
 
 
211 aa  65.1  0.0000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.62232  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0293  NADPH-dependent FMN reductase  31.25 
 
 
208 aa  65.1  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000996855  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1505  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
197 aa  64.7  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1487  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
198 aa  64.7  0.0000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.535714  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0413  NADPH-dependent FMN reductase  37.86 
 
 
182 aa  64.3  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.72676  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1492  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.14 
 
 
540 aa  63.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0869  NADPH-dependent FMN reductase  31.37 
 
 
206 aa  64.3  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00401648  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1385  iron-sulfur flavoprotein  32.35 
 
 
191 aa  63.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0780  Multimeric flavodoxin WrbA-like protein  27.78 
 
 
181 aa  63.5  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.706677  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  36.63 
 
 
207 aa  63.2  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1988  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  30.25 
 
 
321 aa  63.5  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0292793  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2849  NADPH-dependent FMN reductase  33.06 
 
 
192 aa  63.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0321  NADPH-dependent FMN reductase  30.69 
 
 
197 aa  62.8  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.378386  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  32.35 
 
 
192 aa  62.8  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1637  NADPH-dependent FMN reductase  32.04 
 
 
191 aa  62.8  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0800599  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1264  NADPH-dependent FMN reductase  30.1 
 
 
200 aa  63.2  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.246056  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  30.69 
 
 
187 aa  62.4  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0159  NADPH-dependent FMN reductase  25.64 
 
 
203 aa  62.4  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0449  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.73 
 
 
256 aa  62  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.536624  normal  0.0128011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>