258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1385 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1385  iron-sulfur flavoprotein  100 
 
 
191 aa  394  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0650  NADPH-dependent FMN reductase  71.58 
 
 
190 aa  293  7e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0991  NADPH-dependent FMN reductase  68.95 
 
 
199 aa  285  2.9999999999999996e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.451509  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1637  NADPH-dependent FMN reductase  67.37 
 
 
191 aa  282  2.0000000000000002e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0800599  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0277  NADPH-dependent FMN reductase  67.37 
 
 
199 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2925  NADPH-dependent FMN reductase  65.26 
 
 
193 aa  271  6e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000194359  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1543  NADPH-dependent FMN reductase  64.55 
 
 
193 aa  270  8.000000000000001e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0882991  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  63.68 
 
 
191 aa  269  2e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1487  NADPH-dependent FMN reductase  65.61 
 
 
198 aa  268  5e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.535714  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0325  NADPH-dependent FMN reductase  60.64 
 
 
188 aa  260  8.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  64.02 
 
 
206 aa  256  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2535  NADPH-dependent FMN reductase  59.26 
 
 
191 aa  250  1e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.437841 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1043  NADPH-dependent FMN reductase  60.73 
 
 
192 aa  250  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.603654  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1441  NADPH-dependent FMN reductase  58.85 
 
 
192 aa  249  2e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  60.54 
 
 
204 aa  242  1.9999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1057  NADPH-dependent FMN reductase  60.53 
 
 
190 aa  240  7e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.840292  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0109  NADPH-dependent FMN reductase  56.08 
 
 
191 aa  237  8e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1244  NADPH-dependent FMN reductase  59.47 
 
 
190 aa  235  2e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1029  iron-sulfur flavoprotein  57.89 
 
 
190 aa  234  7e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.343926  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1170  FMN reductase, NADPH-dependent  56.76 
 
 
207 aa  233  9e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1623  hypothetical protein  57.59 
 
 
194 aa  231  4.0000000000000004e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  56.84 
 
 
192 aa  231  6e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1264  NADPH-dependent FMN reductase  56.02 
 
 
200 aa  230  8.000000000000001e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.246056  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0017  NADPH-dependent FMN reductase  57.45 
 
 
194 aa  230  1e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1770  NADPH-dependent FMN reductase  61.38 
 
 
190 aa  226  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000383709  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0179  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  54.01 
 
 
211 aa  224  7e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  54.55 
 
 
205 aa  222  3e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1507  NADPH-dependent FMN reductase  57.67 
 
 
194 aa  221  4.9999999999999996e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.569037  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2979  NADPH-dependent FMN reductase  55.56 
 
 
204 aa  219  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.670971 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0722  NADPH-dependent FMN reductase  52.94 
 
 
211 aa  217  6e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.658969  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0284  NADPH-dependent FMN reductase  52.41 
 
 
211 aa  209  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0301  NADPH-dependent FMN reductase  51.87 
 
 
211 aa  207  9e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.354287  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1959  NADPH-dependent FMN reductase  49.46 
 
 
211 aa  202  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.783003  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  45.26 
 
 
208 aa  192  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1178  NADPH-dependent FMN reductase  50.8 
 
 
223 aa  190  9e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0293  NADPH-dependent FMN reductase  47.37 
 
 
208 aa  186  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000996855  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2381  NADPH-dependent FMN reductase  46.6 
 
 
195 aa  176  3e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.19679e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1058  NADPH-dependent FMN reductase  42.86 
 
 
192 aa  172  2.9999999999999996e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1487  NADPH-dependent FMN reductase  44.39 
 
 
207 aa  160  7e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.22855  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0225  NADPH-dependent FMN reductase  41.27 
 
 
189 aa  157  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.545185  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11340  multimeric flavodoxin WrbA  41.94 
 
 
208 aa  154  8e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0869  NADPH-dependent FMN reductase  41.88 
 
 
206 aa  153  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00401648  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0909  NADPH-dependent FMN reductase  42.78 
 
 
206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0780942  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0173  multimeric flavodoxin WrbA  41.18 
 
 
206 aa  148  6e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000913866  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0948  NADPH-dependent FMN reductase  44.68 
 
 
211 aa  141  5e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105461  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2588  NADPH-dependent FMN reductase  43.62 
 
 
210 aa  141  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122146  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0797  hypothetical protein  39.57 
 
 
189 aa  141  6e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000338584 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1956  NADPH-dependent FMN reductase  39.04 
 
 
204 aa  139  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000522685  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1620  NADPH-dependent FMN reductase  43.09 
 
 
211 aa  137  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3584  NADPH-dependent FMN reductase  40.21 
 
 
212 aa  135  5e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000299171  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  38.42 
 
 
193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  36.87 
 
 
193 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  36.95 
 
 
193 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2419  NADPH-dependent FMN reductase  36.84 
 
 
189 aa  123  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.873931  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  35.71 
 
 
194 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  34.54 
 
 
193 aa  107  1e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  36.84 
 
 
193 aa  103  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  34.04 
 
 
186 aa  102  4e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  34.76 
 
 
186 aa  101  6e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  34.74 
 
 
187 aa  101  6e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  33.69 
 
 
186 aa  95.9  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  32.09 
 
 
183 aa  94.4  9e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  36.6 
 
 
207 aa  94  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0630  NADPH-dependent FMN reductase  30.34 
 
 
233 aa  90.9  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  32.61 
 
 
223 aa  90.1  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0316  NADPH-dependent FMN reductase  30.99 
 
 
212 aa  88.6  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0321  NADPH-dependent FMN reductase  29.79 
 
 
197 aa  88.6  5e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.378386  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  47.06 
 
 
211 aa  87.8  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1442  NADPH-dependent FMN reductase  36.15 
 
 
217 aa  86.7  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0486  NADPH-dependent FMN reductase  32.62 
 
 
197 aa  87  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.260904  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0163  NADPH-dependent FMN reductase  32.09 
 
 
195 aa  86.3  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0421  NADPH-dependent FMN reductase  30.32 
 
 
197 aa  86.3  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1505  NADPH-dependent FMN reductase  30.32 
 
 
197 aa  86.3  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0414  NADPH-dependent FMN reductase  31.38 
 
 
197 aa  85.5  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  36.92 
 
 
217 aa  85.9  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2482  NADPH-dependent FMN reductase  37.06 
 
 
222 aa  84.7  8e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.801364  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0413  NADPH-dependent FMN reductase  30.32 
 
 
182 aa  84.7  8e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.72676  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0252  iron-sulfur flavoprotein  31.61 
 
 
227 aa  82  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.488898  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0549  NADPH-dependent FMN reductase  33.15 
 
 
199 aa  81.6  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2261  NADPH-dependent FMN reductase  33.72 
 
 
222 aa  81.6  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  0.127615 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  40.2 
 
 
206 aa  81.3  0.000000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0408  NADPH-dependent FMN reductase  31.02 
 
 
225 aa  80.9  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2377  NADPH-dependent FMN reductase  29.9 
 
 
209 aa  80.5  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000848109  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1584  NADPH-dependent FMN reductase  31.69 
 
 
220 aa  80.1  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1149  NADPH-dependent FMN reductase  41.18 
 
 
208 aa  79  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.285301  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  33.52 
 
 
186 aa  79  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  40.2 
 
 
210 aa  79  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2991  NADPH-dependent FMN reductase  32.11 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0755  NADPH-dependent FMN reductase  28.72 
 
 
213 aa  78.2  0.00000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.263848  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  35.38 
 
 
217 aa  77.8  0.00000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2580  iron-sulfur flavoprotein  37.96 
 
 
222 aa  77.8  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29861  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0870  NADPH-dependent FMN reductase  27.86 
 
 
195 aa  77  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000162046  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2272  NADPH-dependent FMN reductase  37.25 
 
 
197 aa  77.4  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1125  NADPH-dependent FMN reductase  32.31 
 
 
217 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000715162  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  30.29 
 
 
214 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1381  NADPH-dependent FMN reductase  38.89 
 
 
216 aa  75.9  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196943  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0784  NADPH-dependent FMN reductase  30.86 
 
 
179 aa  75.1  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2732  NADPH-dependent FMN reductase  37.74 
 
 
209 aa  75.1  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  28.02 
 
 
214 aa  74.7  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1638  NADPH-dependent FMN reductase  33.11 
 
 
187 aa  74.7  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0739804  normal  0.913531 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>