More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1619 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1619  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
179 aa  374  1e-103  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0784  NADPH-dependent FMN reductase  64.97 
 
 
179 aa  250  7e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0275  NADPH-dependent FMN reductase  61.45 
 
 
178 aa  229  2e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1320  NADPH-dependent FMN reductase  55.68 
 
 
179 aa  218  3.9999999999999997e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.654727  normal  0.0975932 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3141  iron-sulfur flavoprotein  49.43 
 
 
178 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.087899  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1188  NADPH-dependent FMN reductase  37.2 
 
 
180 aa  121  4e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.646638 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3468  multimeric flavodoxin WrbA family protein  33.7 
 
 
183 aa  108  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.177131  decreased coverage  0.000563166 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1131  hypothetical protein  31.46 
 
 
179 aa  105  3e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0158  NADPH-dependent FMN reductase  44.07 
 
 
206 aa  103  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2849  NADPH-dependent FMN reductase  39.29 
 
 
192 aa  95.5  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0727  NADPH-dependent FMN reductase  32.32 
 
 
204 aa  94.7  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0076  NADPH-dependent FMN reductase  35.22 
 
 
202 aa  93.6  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.399945  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  34.64 
 
 
183 aa  92  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  43.43 
 
 
194 aa  90.9  9e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2732  NADPH-dependent FMN reductase  30.26 
 
 
209 aa  90.1  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  44.44 
 
 
193 aa  89.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  44.44 
 
 
193 aa  89  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0309  NADPH-dependent FMN reductase  38.78 
 
 
212 aa  89  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  44.44 
 
 
193 aa  88.6  4e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  29.05 
 
 
185 aa  87.4  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00930  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
173 aa  85.9  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407777  normal  0.42644 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18210  NADPH-dependent FMN reductase  27.27 
 
 
177 aa  85.5  4e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1676  hypothetical protein  36.73 
 
 
200 aa  85.5  4e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  hitchhiker  0.000000298375 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1498  NADPH-dependent FMN reductase  32.34 
 
 
185 aa  85.5  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
214 aa  85.5  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1677  EIF-4a family ATP-dependent RNA helicase  42.16 
 
 
195 aa  85.1  4e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.42151  hitchhiker  0.000000240044 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2120  NADPH-dependent FMN reductase  37.62 
 
 
208 aa  84.7  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0276138  normal  0.10387 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2817  NADPH-dependent FMN reductase  38.24 
 
 
194 aa  84.3  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3622  NADPH-dependent FMN reductase  39.6 
 
 
191 aa  83.2  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1815  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  42 
 
 
224 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1130  NADPH-dependent FMN reductase  36.29 
 
 
182 aa  82.8  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1182  NADPH-dependent FMN reductase  38.78 
 
 
190 aa  80.9  0.000000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000238882  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1371  NADPH-dependent FMN reductase  38.78 
 
 
190 aa  80.5  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0772  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  30.41 
 
 
193 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.806618  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2272  NADPH-dependent FMN reductase  29.41 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1392  NADPH-dependent FMN reductase  36.73 
 
 
201 aa  80.1  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  33.58 
 
 
193 aa  79  0.00000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2330  NADPH-dependent FMN reductase  37 
 
 
224 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  0.0193614 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1152  NADPH-dependent FMN reductase  37.37 
 
 
190 aa  79.3  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000059068  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  39 
 
 
186 aa  79  0.00000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2213  NADPH-dependent FMN reductase  28.22 
 
 
189 aa  78.6  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0159  NADPH-dependent FMN reductase  38.83 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0677  iron-sulfur flavoprotein  36.54 
 
 
250 aa  78.2  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  28.81 
 
 
186 aa  77.8  0.00000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  29.44 
 
 
186 aa  77.4  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  38.54 
 
 
187 aa  77  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0893  NADPH-dependent FMN reductase  37.25 
 
 
200 aa  77.4  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1102  iron-sulfur flavoprotein  33.33 
 
 
182 aa  77.4  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000321891  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1636  NADPH-dependent FMN reductase  39.22 
 
 
214 aa  76.3  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0308  NADPH-dependent FMN reductase  39.81 
 
 
204 aa  76.3  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.471384 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  32.46 
 
 
214 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2612  iron-sulfur flavoprotein  38 
 
 
246 aa  75.9  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0671  NADPH-dependent FMN reductase  33.61 
 
 
239 aa  75.5  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.610211 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  37.25 
 
 
211 aa  75.5  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0018  NADPH-dependent FMN reductase  32.04 
 
 
228 aa  75.1  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18130  NADPH-dependent FMN reductase  27.92 
 
 
172 aa  74.7  0.0000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.340395  normal  0.960689 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  33 
 
 
210 aa  73.6  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0632  NADPH-dependent FMN reductase  40.78 
 
 
201 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  37 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1626  NADPH-dependent FMN reductase  42.42 
 
 
220 aa  73.6  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.65491  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3773  NADPH-dependent FMN reductase  37 
 
 
220 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.65168  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1149  NADPH-dependent FMN reductase  34 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.285301  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  38.38 
 
 
221 aa  73.9  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0521  NADPH-dependent FMN reductase  34.95 
 
 
217 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
217 aa  73.9  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  26.23 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  37.89 
 
 
212 aa  72.8  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0954  NADPH-dependent FMN reductase  30.27 
 
 
184 aa  72  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0672  NADPH-dependent FMN reductase  33.87 
 
 
263 aa  72  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.594291 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1072  NADPH-dependent FMN reductase  34.31 
 
 
212 aa  71.6  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0542  iron-sulfur flavoprotein, putative  30.91 
 
 
204 aa  71.6  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.423785  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0017  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
194 aa  71.6  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1285  NADPH-dependent FMN reductase  30.7 
 
 
197 aa  71.2  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.497649  normal  0.389555 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1505  NADPH-dependent FMN reductase  35.24 
 
 
197 aa  71.2  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0163  NADPH-dependent FMN reductase  34.34 
 
 
195 aa  70.9  0.000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0468  NADPH-dependent FMN reductase  34.95 
 
 
205 aa  70.9  0.000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0704146  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0414  NADPH-dependent FMN reductase  34.29 
 
 
197 aa  70.9  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  23.2 
 
 
182 aa  70.5  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2733  NADPH-dependent FMN reductase  37.37 
 
 
204 aa  70.5  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1125  NADPH-dependent FMN reductase  27.88 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000715162  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0333  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.53 
 
 
222 aa  70.1  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.977725  normal  0.107763 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  25.16 
 
 
191 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0357  hypothetical protein  38.2 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1543  NADPH-dependent FMN reductase  35.65 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0882991  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0077  NADPH-dependent FMN reductase  35.92 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0303  NADPH-dependent FMN reductase  28.32 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2535  NADPH-dependent FMN reductase  38.61 
 
 
191 aa  69.3  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.437841 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0449  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.74 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.536624  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0133  NADPH-dependent FMN reductase  35.24 
 
 
191 aa  70.1  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000492716  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  32.67 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1385  iron-sulfur flavoprotein  29.56 
 
 
191 aa  69.3  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  35.92 
 
 
193 aa  69.3  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1988  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  36.08 
 
 
321 aa  68.9  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0292793  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0421  NADPH-dependent FMN reductase  31.16 
 
 
197 aa  68.9  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2463  hypothetical protein  33.33 
 
 
202 aa  68.6  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000389494  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1442  NADPH-dependent FMN reductase  30.39 
 
 
217 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  29.91 
 
 
217 aa  68.9  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0441  iron-sulfur flavoprotein  30.1 
 
 
194 aa  68.2  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2377  NADPH-dependent FMN reductase  32.65 
 
 
209 aa  67.8  0.00000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000848109  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  29.59 
 
 
205 aa  67.8  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>