195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0632 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0632  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 		 201 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2463  hypothetical protein  54.95 
 
 		 202 aa  207  6e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000389494  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0468  NADPH-dependent FMN reductase  52.97 
 
 		 205 aa  204  5e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0704146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1497  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.84 
 
 		 198 aa  165  4e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.250529  normal  0.118401 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0487  NADPH-dependent FMN reductase  40.31 
 
 		 199 aa  159  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.671634  normal  0.453927 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  37.38 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  35.43 
 
 		 217 aa  80.1  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  36.69 
 
 		 186 aa  77.8  0.00000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1442  NADPH-dependent FMN reductase  38.46 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  39.42 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  31.97 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0784  NADPH-dependent FMN reductase  27.98 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2997  NADPH-dependent FMN reductase  30.77 
 
 		 184 aa  75.1  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0315889  normal  0.693807 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1285  NADPH-dependent FMN reductase  31.71 
 
 		 197 aa  74.7  0.0000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.497649  normal  0.389555 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2580  iron-sulfur flavoprotein  34.43 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29861  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1619  NADPH-dependent FMN reductase  40.78 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  38.83 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  39.81 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  32.12 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0275  NADPH-dependent FMN reductase  35.29 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0521  NADPH-dependent FMN reductase  35.04 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  38.83 
 
 		 193 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  38.83 
 
 		 193 aa  70.9  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0018  NADPH-dependent FMN reductase  32 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1149  NADPH-dependent FMN reductase  35.51 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.285301  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1130  NADPH-dependent FMN reductase  35.34 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  34.58 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  35.78 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  30.15 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0163  NADPH-dependent FMN reductase  33.65 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2213  NADPH-dependent FMN reductase  31.21 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3523  NADPH-dependent FMN reductase  30.83 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  35.92 
 
 		 194 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0772  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  32.12 
 
 		 193 aa  67  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.806618  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1102  iron-sulfur flavoprotein  35.34 
 
 		 182 aa  67  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000321891  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  32.71 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3141  iron-sulfur flavoprotein  35.19 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.087899  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0441  iron-sulfur flavoprotein  30.39 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1125  NADPH-dependent FMN reductase  33.65 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000715162  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1371  NADPH-dependent FMN reductase  30.37 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0158  NADPH-dependent FMN reductase  34.95 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1381  NADPH-dependent FMN reductase  32.43 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196943  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2849  NADPH-dependent FMN reductase  34.29 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1498  NADPH-dependent FMN reductase  26.02 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0374  NADPH-dependent FMN reductase  28.21 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.4772 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2732  NADPH-dependent FMN reductase  27.04 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1182  NADPH-dependent FMN reductase  29.85 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000238882  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1152  NADPH-dependent FMN reductase  28.89 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000059068  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0316  NADPH-dependent FMN reductase  35.58 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1072  NADPH-dependent FMN reductase  31.19 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1467  NADPH-dependent FMN reductase  30.77 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1508  NADPH-dependent FMN reductase  32.5 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.25275  decreased coverage  0.00823646 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0309  NADPH-dependent FMN reductase  32.04 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2330  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  0.0193614 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  26.26 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3773  NADPH-dependent FMN reductase  25 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.65168  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  27.55 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3468  multimeric flavodoxin WrbA family protein  24.86 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.177131  decreased coverage  0.000563166 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  26.95 
 
 		 182 aa  61.2  0.000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1320  NADPH-dependent FMN reductase  35.92 
 
 		 179 aa  61.2  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.654727  normal  0.0975932 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1241  NADPH-dependent FMN reductase  28.47 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0677  iron-sulfur flavoprotein  33.94 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2272  NADPH-dependent FMN reductase  32.17 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1486  NADPH-dependent FMN reductase  26.45 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  31.43 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1676  hypothetical protein  35.29 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  hitchhiker  0.000000298375 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1815  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  35.58 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1677  EIF-4a family ATP-dependent RNA helicase  27.27 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.42151  hitchhiker  0.000000240044 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  30.28 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3305  iron-sulfur flavoprotein  33.71 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.328284  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0988  NADPH-dependent FMN reductase  29.55 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.327411  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1442  NADPH-dependent FMN reductase  33.96 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.103462  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4872  NAD(P)H dehydrogenase (quinone); trp repressor-binding protein  22.45 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2482  NADPH-dependent FMN reductase  32.08 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.801364  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  25.77 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1505  NADPH-dependent FMN reductase  33.01 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1131  hypothetical protein  33.03 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5027  FMN reductase, NADPH-dependent  22.45 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5408  FMN reductase, NADPH-dependent  22.45 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.516964  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0225  NADPH-dependent FMN reductase  34.62 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.545185  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5265  FMN reductase, NADPH-dependent  22.45 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  34.29 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0414  NADPH-dependent FMN reductase  32.04 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  30.1 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2659  NADPH-dependent FMN reductase  31.11 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.385785 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0017  NADPH-dependent FMN reductase  35.24 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0893  NADPH-dependent FMN reductase  26.05 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1046  hypothetical protein  26.61 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.882215 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0650  NADPH-dependent FMN reductase  33.98 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0727  NADPH-dependent FMN reductase  31.78 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0109  NADPH-dependent FMN reductase  32.04 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0333  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.69 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.977725  normal  0.107763 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1799  NADPH-dependent FMN reductase  32.08 
 
 		 216 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0857  NADPH-dependent FMN reductase  36.04 
 
 		 262 aa  54.3  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0421  NADPH-dependent FMN reductase  32.04 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0486  NADPH-dependent FMN reductase  30.1 
 
 		 197 aa  53.9  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.260904  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0991  NADPH-dependent FMN reductase  33.65 
 
 		 199 aa  53.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.451509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>