208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0441 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0441  iron-sulfur flavoprotein  100 
 
 
194 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1285  NADPH-dependent FMN reductase  56.02 
 
 
197 aa  224  6e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.497649  normal  0.389555 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2272  NADPH-dependent FMN reductase  54.92 
 
 
197 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  37.31 
 
 
212 aa  140  9e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  38.74 
 
 
210 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1149  NADPH-dependent FMN reductase  38.54 
 
 
208 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.285301  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  36.51 
 
 
206 aa  129  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  37.31 
 
 
211 aa  128  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0158  NADPH-dependent FMN reductase  28.72 
 
 
206 aa  84.7  7e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  27.98 
 
 
185 aa  83.2  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  28.11 
 
 
182 aa  82.4  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1182  NADPH-dependent FMN reductase  26.8 
 
 
190 aa  82  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000238882  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2849  NADPH-dependent FMN reductase  25.93 
 
 
192 aa  81.6  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2817  NADPH-dependent FMN reductase  25.79 
 
 
194 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  26.32 
 
 
186 aa  80.5  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0076  NADPH-dependent FMN reductase  41.84 
 
 
202 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.399945  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1371  NADPH-dependent FMN reductase  25.77 
 
 
190 aa  79.7  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1152  NADPH-dependent FMN reductase  26.29 
 
 
190 aa  78.2  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000059068  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1676  hypothetical protein  36.73 
 
 
200 aa  76.3  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  hitchhiker  0.000000298375 
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  37.86 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0671  NADPH-dependent FMN reductase  30.05 
 
 
239 aa  75.9  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.610211 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1392  NADPH-dependent FMN reductase  32.82 
 
 
201 aa  75.1  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  35.92 
 
 
186 aa  73.9  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0309  NADPH-dependent FMN reductase  31.25 
 
 
212 aa  74.3  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  33.98 
 
 
186 aa  74.3  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1498  NADPH-dependent FMN reductase  27.98 
 
 
185 aa  73.6  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0080  NADPH-dependent FMN reductase  26.04 
 
 
201 aa  73.6  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  39.8 
 
 
207 aa  73.2  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2732  NADPH-dependent FMN reductase  37.76 
 
 
209 aa  72.8  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2120  NADPH-dependent FMN reductase  25.77 
 
 
208 aa  72  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0276138  normal  0.10387 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  34.95 
 
 
183 aa  71.6  0.000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0374  NADPH-dependent FMN reductase  26.49 
 
 
188 aa  71.2  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.4772 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  35.51 
 
 
214 aa  71.2  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  32.65 
 
 
193 aa  70.9  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2997  NADPH-dependent FMN reductase  33.96 
 
 
184 aa  70.9  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0315889  normal  0.693807 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  31.63 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  33.04 
 
 
214 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  37 
 
 
223 aa  70.1  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  31.63 
 
 
193 aa  69.7  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  31.63 
 
 
194 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  39 
 
 
221 aa  69.7  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3622  NADPH-dependent FMN reductase  29.32 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2738  NADPH-dependent FMN reductase  23.2 
 
 
199 aa  68.9  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1619  NADPH-dependent FMN reductase  30.1 
 
 
179 aa  68.2  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0468  NADPH-dependent FMN reductase  31.82 
 
 
205 aa  68.2  0.00000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0704146  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  35.71 
 
 
193 aa  67.8  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  32.65 
 
 
193 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  34.65 
 
 
191 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3468  multimeric flavodoxin WrbA family protein  36.54 
 
 
183 aa  66.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.177131  decreased coverage  0.000563166 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  31.58 
 
 
217 aa  66.6  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0166  NADPH-dependent FMN reductase  26.42 
 
 
196 aa  66.6  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1442  NADPH-dependent FMN reductase  39 
 
 
224 aa  66.2  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.103462  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0303  NADPH-dependent FMN reductase  22.22 
 
 
199 aa  65.9  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1125  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
217 aa  65.9  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000715162  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0632  NADPH-dependent FMN reductase  30.39 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0784  NADPH-dependent FMN reductase  32.04 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  30.17 
 
 
217 aa  65.5  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1442  NADPH-dependent FMN reductase  31.58 
 
 
217 aa  65.1  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2733  NADPH-dependent FMN reductase  37.37 
 
 
204 aa  64.7  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1815  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 
224 aa  64.7  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3523  NADPH-dependent FMN reductase  29.13 
 
 
218 aa  64.3  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0748  iron-sulfur flavoprotein  35.92 
 
 
195 aa  64.3  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.203042 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0954  NADPH-dependent FMN reductase  35 
 
 
184 aa  63.9  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2330  NADPH-dependent FMN reductase  32 
 
 
224 aa  63.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  0.0193614 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2580  iron-sulfur flavoprotein  30.36 
 
 
222 aa  63.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29861  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0316  NADPH-dependent FMN reductase  31.21 
 
 
212 aa  63.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0018  NADPH-dependent FMN reductase  28.68 
 
 
228 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1320  NADPH-dependent FMN reductase  31.71 
 
 
179 aa  63.2  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.654727  normal  0.0975932 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0755  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 
213 aa  62.8  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.263848  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1131  hypothetical protein  32.65 
 
 
179 aa  63.2  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3414  NADPH-dependent FMN reductase  30.97 
 
 
186 aa  62.8  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  31.63 
 
 
187 aa  62.4  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0727  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
204 aa  62.4  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0487  NADPH-dependent FMN reductase  25.54 
 
 
199 aa  62.4  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.671634  normal  0.453927 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1636  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 
214 aa  62.4  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1043  NADPH-dependent FMN reductase  33 
 
 
192 aa  62  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.603654  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1046  hypothetical protein  32.04 
 
 
187 aa  62  0.000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.882215 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1241  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
189 aa  62  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1508  NADPH-dependent FMN reductase  32.69 
 
 
216 aa  60.8  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.25275  decreased coverage  0.00823646 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2659  NADPH-dependent FMN reductase  30.16 
 
 
205 aa  60.8  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.385785 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2381  NADPH-dependent FMN reductase  27.55 
 
 
195 aa  61.2  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.19679e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0130  NADPH-dependent FMN reductase  25.89 
 
 
224 aa  60.8  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0275  NADPH-dependent FMN reductase  32.65 
 
 
178 aa  60.8  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1623  hypothetical protein  32 
 
 
194 aa  60.1  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1486  NADPH-dependent FMN reductase  32.41 
 
 
200 aa  60.5  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1029  NADPH-dependent FMN reductase  37 
 
 
222 aa  60.1  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.153649  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  35.35 
 
 
220 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2097  NADPH-dependent FMN reductase  33.94 
 
 
236 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0163  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
195 aa  59.3  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0542  iron-sulfur flavoprotein, putative  35.79 
 
 
204 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.423785  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1244  NADPH-dependent FMN reductase  33 
 
 
190 aa  58.9  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0109  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 
191 aa  58.9  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2213  NADPH-dependent FMN reductase  31.37 
 
 
189 aa  58.9  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0413  NADPH-dependent FMN reductase  33.98 
 
 
182 aa  59.3  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.72676  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3773  NADPH-dependent FMN reductase  34.34 
 
 
220 aa  58.9  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.65168  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1029  iron-sulfur flavoprotein  31 
 
 
190 aa  58.5  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.343926  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1626  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
220 aa  58.5  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.65491  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2463  hypothetical protein  30.19 
 
 
202 aa  58.2  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000389494  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0133  NADPH-dependent FMN reductase  29.7 
 
 
191 aa  57.8  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000492716  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2856  NADPH-dependent FMN reductase  34 
 
 
210 aa  58.2  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>