145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1497 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1497  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 		 198 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.250529  normal  0.118401 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0487  NADPH-dependent FMN reductase  51.52 
 
 		 199 aa  227  9e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.671634  normal  0.453927 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0632  NADPH-dependent FMN reductase  41.84 
 
 		 201 aa  165  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2463  hypothetical protein  41.99 
 
 		 202 aa  160  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000389494  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0468  NADPH-dependent FMN reductase  38.38 
 
 		 205 aa  152  2.9999999999999998e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0704146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1508  NADPH-dependent FMN reductase  33.88 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.25275  decreased coverage  0.00823646 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0671  NADPH-dependent FMN reductase  30.5 
 
 		 239 aa  67.8  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.610211 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0018  NADPH-dependent FMN reductase  31.75 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2330  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  0.0193614 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  30.36 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0784  NADPH-dependent FMN reductase  28.85 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2580  iron-sulfur flavoprotein  29.52 
 
 		 222 aa  62  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29861  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1392  NADPH-dependent FMN reductase  30.86 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  29.91 
 
 		 212 aa  62  0.000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1619  NADPH-dependent FMN reductase  28.85 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1467  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1381  NADPH-dependent FMN reductase  33.04 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196943  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1442  NADPH-dependent FMN reductase  29.82 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1285  NADPH-dependent FMN reductase  28.47 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.497649  normal  0.389555 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  31.82 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1677  EIF-4a family ATP-dependent RNA helicase  33.05 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.42151  hitchhiker  0.000000240044 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  35.58 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3773  NADPH-dependent FMN reductase  34.62 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.65168  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1149  NADPH-dependent FMN reductase  30.84 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.285301  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  29.91 
 
 		 214 aa  57.8  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  29.52 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1498  NADPH-dependent FMN reductase  23.98 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0130  NADPH-dependent FMN reductase  31.91 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2849  NADPH-dependent FMN reductase  26.25 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0158  NADPH-dependent FMN reductase  27.78 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0309  NADPH-dependent FMN reductase  28.78 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0857  NADPH-dependent FMN reductase  28.49 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  31.07 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  29.91 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  30.77 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1130  NADPH-dependent FMN reductase  27.03 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1102  iron-sulfur flavoprotein  27.03 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000321891  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  27.97 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3141  iron-sulfur flavoprotein  28.57 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.087899  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2732  NADPH-dependent FMN reductase  29.17 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2612  iron-sulfur flavoprotein  30.19 
 
 		 246 aa  54.3  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1676  hypothetical protein  26.72 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  hitchhiker  0.000000298375 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  29.13 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3523  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 		 218 aa  53.9  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  30.1 
 
 		 193 aa  54.7  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0017  NADPH-dependent FMN reductase  29.25 
 
 		 194 aa  54.7  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0076  NADPH-dependent FMN reductase  26.43 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.399945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  29.13 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2097  NADPH-dependent FMN reductase  28.8 
 
 		 236 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0374  NADPH-dependent FMN reductase  25.67 
 
 		 188 aa  53.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.4772 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2377  NADPH-dependent FMN reductase  24.27 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000848109  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0163  NADPH-dependent FMN reductase  29.52 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2213  NADPH-dependent FMN reductase  28.97 
 
 		 189 aa  53.9  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2272  NADPH-dependent FMN reductase  27.27 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  29.27 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0449  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.3 
 
 		 256 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.536624  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  30.1 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2419  NADPH-dependent FMN reductase  30.3 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.873931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00930  NADPH-dependent FMN reductase  26.03 
 
 		 173 aa  53.1  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407777  normal  0.42644 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0109  NADPH-dependent FMN reductase  27.88 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0727  NADPH-dependent FMN reductase  23.43 
 
 		 204 aa  52.4  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2997  NADPH-dependent FMN reductase  25.29 
 
 		 184 aa  52.8  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0315889  normal  0.693807 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0357  hypothetical protein  31.13 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1320  NADPH-dependent FMN reductase  29.25 
 
 		 179 aa  52  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.654727  normal  0.0975932 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0521  NADPH-dependent FMN reductase  26.92 
 
 		 217 aa  51.6  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1125  NADPH-dependent FMN reductase  27.88 
 
 		 217 aa  51.6  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000715162  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0748  iron-sulfur flavoprotein  33.66 
 
 		 195 aa  51.6  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.203042 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2659  NADPH-dependent FMN reductase  27.97 
 
 		 205 aa  51.2  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.385785 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2381  NADPH-dependent FMN reductase  29.37 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.19679e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3305  iron-sulfur flavoprotein  31.43 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.328284  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1486  NADPH-dependent FMN reductase  26.81 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0672  NADPH-dependent FMN reductase  27.84 
 
 		 263 aa  50.1  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.594291 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  25.17 
 
 		 185 aa  49.7  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1845  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.08 
 
 		 152 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1522  NADPH-dependent FMN reductase  31.48 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1851  NADPH-dependent FMN reductase  32.04 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0492811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18130  NADPH-dependent FMN reductase  26.47 
 
 		 172 aa  49.7  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.340395  normal  0.960689 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  26.09 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  29.41 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0275  NADPH-dependent FMN reductase  26.92 
 
 		 178 aa  49.3  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0954  NADPH-dependent FMN reductase  26.28 
 
 		 184 aa  49.3  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  29.52 
 
 		 221 aa  49.3  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  27.36 
 
 		 193 aa  48.9  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1620  NADPH-dependent FMN reductase  26.92 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1029  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 		 222 aa  48.5  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.153649  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0316  NADPH-dependent FMN reductase  28.85 
 
 		 212 aa  48.5  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3468  multimeric flavodoxin WrbA family protein  25.93 
 
 		 183 aa  48.1  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.177131  decreased coverage  0.000563166 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1799  NADPH-dependent FMN reductase  29.91 
 
 		 216 aa  48.1  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1442  NADPH-dependent FMN reductase  30.84 
 
 		 224 aa  48.1  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.103462  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2629  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.13 
 
 		 344 aa  48.1  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  27.18 
 
 		 194 aa  48.1  0.00008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0650  NADPH-dependent FMN reductase  27.18 
 
 		 190 aa  48.1  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  28.85 
 
 		 206 aa  48.1  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1371  NADPH-dependent FMN reductase  25.24 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0225  NADPH-dependent FMN reductase  30.53 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.545185  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1188  NADPH-dependent FMN reductase  26.92 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.646638 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1241  NADPH-dependent FMN reductase  25.32 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1385  iron-sulfur flavoprotein  27.18 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1584  NADPH-dependent FMN reductase  28.97 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>